Przejście fazy postępowania karnego skarbowego z ad rem do in personam stanowi jedną z okoliczności, która może negować instrumentalność wszczęcia postępowania, to jednak na organie nadal spoczywa ciężar przedstawienia dowodów i chronologii podejmowanych czynności, które uzasadniałyby stanowisko, że postępowanie karne skarbowe nie było wszczęte instrumentalnie.
W przypadku sporów dotyczących zwolnień podatkowych na tle umów o unikaniu podwójnego opodatkowania, kluczowe jest ustalenie, czy podmiot, na rzecz którego dokonano wypłaty odsetek, posiada status rzeczywistego beneficjenta tych odsetek (beneficial owner), co jest decydujące dla możliwości skorzystania ze zwolnienia z podatku źródłowego. Ponadto, w sytuacji wszczęcia postępowania karnego skarbowego
Zgodnie z treścią art. 70 § 6 pkt 2 Ordynacji podatkowej bieg terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego nie rozpoczyna się, a rozpoczęty ulega zawieszeniu z dniem wniesienia skargi do sądu administracyjnego na decyzję dotyczącą tego zobowiązania. Natomiast w myśl art. 70 § 7 pkt 2 tej ustawy bieg terminu przedawnienia rozpoczyna się, a po zawieszeniu biegnie dalej, od dnia następującego po dniu
W sytuacji, gdy Ordynacyjna podatkowa nie przewiduje możliwości zażalenia na postanowienie organu podatkowego, takie postanowienie nie może być przedmiotem zaskarżenia w drodze środków odwoławczych przewidzianych w prawie administracyjnym.