W przypadku wydania przez Naczelny Sąd Administracyjny wyroku reformatoryjnego, zarówno organy administracyjne, jak i sądy niższej instancji, są związane wiążącą oceną prawną wyrażoną w takim orzeczeniu i są zobowiązane do działania zgodnego z tą oceną, o ile nie zachodzą dopuszczalne przez prawo okoliczności pozwalające na odstąpienie od tej oceny.

Odmowa wydania zaświadczenia potwierdzającego pozytywne załatwienie sprawy przez organ administracji jest prawnie uzasadniona, jeżeli zaświadczenie miałoby potwierdzać stan faktyczny lub prawny, który nie jest jeszcze ostatecznie ustalony z uwagi na trwające postępowanie administracyjne.

Zmiana terminu obowiązywania zezwolenia na działalność gospodarczą w specjalnej strefie ekonomicznej nie stanowi zwiększenia pomocy publicznej w rozumieniu art. 19 ust. 4 pkt 2 ustawy o specjalnych strefach ekonomicznych, lecz dotyczy wykorzystania już przyznanego wsparcia, nie wpływając na jego wielkość.