Niezachowanie formalności doręczenia postanowienia o wszczęciu postępowania podatkowego skutkuje brakiem jego skutecznego rozpoczęcia, co w konsekwencji uniemożliwia wprowadzenie decyzji do obrotu prawnego i wywiedzenie od niej środka zaskarżenia.
Stwierdzenie wydania decyzji podatkowej po terminie, bez zasadnego użycia wyjątku pięcioletniego w art. 68 § 2 O.p., uzasadnia uchylenie zaskarżonej decyzji i wyroku, skutkując koniecznością ich poprawnego rozstrzygnięcia.
Orzeczenie o odpowiedzialności członka zarządu na podstawie art. 116 § 1 i 2 Ordynacji podatkowej jest uzależnione od wykazania przez organ przesłanek pozytywnych oraz niewykazania przez członka zarządu przesłanek egzoneracyjnych wyłączających tę odpowiedzialność.
Zyski opodatkowane na poziomie wspólników spółki osobowej nie mogą być ponownie opodatkowane po jej przekształceniu w spółkę kapitałową, gdyż naruszałoby to zasadę unikania podwójnego opodatkowania dochodów, zgodnie z art. 93a § 1 pkt 2 Ordynacji podatkowej.
Druga korekta deklaracji złożona po 14-dniowym terminie od doręczenia wyniku kontroli wywołującego skutki prawne jest bezskuteczna, jeśli organ nie uwzględnił wcześniejszej korekty, co wyklucza wszczęcie postępowania nadpłatowego (art. 82 uKAS).
W sytuacji zbycia akcji celem ich umorzenia, do przychodów podatkowych zalicza się tylko nadwyżkę wynagrodzenia uzyskanego nad kosztami ich nabycia lub objęcia, zgodnie z art. 12 ust. 4 pkt 3 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.
Członek zarządu spółki z ograniczoną odpowiedzialnością ponosi solidarną odpowiedzialność za jej zaległości podatkowe, jeżeli nie wykaże, że we właściwym czasie zgłosił wniosek o ogłoszenie upadłości bądź otwarcie postępowania restrukturyzacyjnego.
Osoby trzecie pociągnięte do solidarnej odpowiedzialności za zobowiązania podatkowe mają prawo do kwestionowania ustaleń faktycznych i prawnych decyzji wymiarowych w sposób umożliwiający skuteczną obronę w ramach krajowego postępowania. Należy zapewnić im pełny dostęp do akt sprawy wymiarowej, respektując jednocześnie standardy unijne ochrony praw.
Naczelny Sąd Administracyjny orzekł, iż błędne jest stosowanie pięcioletniego okresu przedawnienia z art. 68 § 2 O.p. na podstawie opóźnionego złożenia deklaracji w 2008 roku bez późniejszych zmian wymuszających aktualizację. Organ musi przestrzegać zasad proceduralnych uwzględniając prawo podatnika do udziału w postępowaniu.