W przypadku ujawnienia nowych istotnych okoliczności faktycznych nieznanych organowi wcześniej, które mogą mieć wpływ na ocenę zobowiązań podatkowych, organ podatkowy jest zobowiązany do ponownego rozpatrzenia sprawy i uwzględnienia tych okoliczności w podjętej decyzji.

Decyzja w przedmiocie przyznania ulgi ma charakter decyzji uznaniowej. Oznacza to, że jeżeli spełnione zostaną przesłanki zastosowania ulgi, do organu należy wybór konsekwencji prawnej ustalonego stanu faktycznego. Z przyznanej im kompetencji organy nie mogą korzystać w sposób woluntarystyczny, zupełnie nieracjonalny lub sprzeczny z podstawowymi zasadami konstytucyjnymi. Wartości te wyznaczają granice

Zastosowanie art. 108 ustawy o VAT wymaga pełnego i wiarygodnego materiału dowodowego potwierdzającego brak rzeczywistych transakcji gospodarczych dokumentowanych fakturami, a brak oryginałów faktur uniemożliwia prawo do odliczenia podatku naliczonego.