Naczelnik urzędu celno-skarbowego jest właściwym organem do wydawania decyzji w sprawach naruszeń ustawy o systemie monitorowania drogowego i kolejowego przewozu towarów oraz obrotu paliwami opałowymi, a decyzje te muszą uwzględniać zasady proporcjonalności i interesu publicznego, które nie mogą być modyfikowane subiektywnymi ocenami podmiotu naruszającego przepisy.

Odpowiedzialność administracyjna podmiotu wykonującego transport drogowy za brak wymaganych zezwoleń ma charakter obiektywny, a wyjątki od tej odpowiedzialności wymagają wykazania wpływu zdarzeń i okoliczności, których przedsiębiorca nie mógł przewidzieć ani im zapobiec.

Sądy administracyjne mogą stwierdzić niekonstytucyjność przepisów rozporządzeń wykonawczych do ustaw i na tej podstawie orzekać o obowiązku zwrotu niesłusznie pobranych opłat. Odmowa zwrotu nadpłaconej opłaty za wydanie karty pojazdu stanowi 'inne rozstrzygnięcie' w rozumieniu art. 190 ust. 4 Konstytucji RP.

Sądy administracyjne są uprawnione do samodzielnej oceny konstytucyjności przepisów prawa, które nie były przedmiotem kontroli Trybunału Konstytucyjnego, a które naruszają normy konstytucyjne lub ustawowe, co uprawnia stronę do żądania zwrotu nienależnie pobranej opłaty.

Podmiot skupujący, zobowiązany do uiszczenia opłaty za nadwyżki od dostawców mleka, nie ma prawa do stwierdzenia nadpłaty na podstawie przepisów Ordynacji podatkowej, niezależnie od tego, czy pobrał opłatę w całości od dostawców.

Nieprzedstawienie pojazdu do kontroli w ramach systemu monitorowania przewozu towarów objętego ustawą z dnia 9 marca 2017 r. o systemie monitorowania drogowego i kolejowego przewozu towarów oraz obrotu paliwami opałowymi, nawet gdy przewóz rozpoczął się przed wejściem w życie odpowiednich przepisów, skutkuje nałożeniem kary pieniężnej.

Podmiot organizujący międzynarodowy przewóz odpadów niesklasyfikowanych pod żadnym kodem według rozporządzenia (WE) nr 1013/2006 odpowiedzialny jest za posiadanie odpowiednich zezwoleń i dokumentacji wymaganej prawem, a ich brak skutkuje nałożeniem kary administracyjnej, nawet jeśli nie wykazano winy w postaci celowego działania.