Przepisy Rozdziału 11a w Dziale III O.p. (dotyczące tzw. schematów podatkowych) mogą być przedmiotem interpretacji indywidualnej, w tym w zakresie obowiązku złożenia informacji o schemacie podatkowym. Te przepisy, mimo iż są regulacjami drugiego stopnia, tj. meta-regulacjami, wpływają na treść i zakres materialnego stosunku prawnopodatkowego. Ponadto, brak wyraźnego wykluczenia możliwości wydania interpretacji

Interpretacja przepisów prawa podatkowego nie może służyć unikaniu opłacania podatków za pomocą sztucznych operacji gospodarczych. W sytuacji, kiedy dokładne przeprowadzenie postępowania dowodowego nie jest możliwe lub celowe, organy podatkowe mogą odmówić wszczęcia postępowania w odniesieniu do wydania interpretacji indywidualnej, na podstawie uprawnionego przypuszczenia.

Sądy administracyjne mają obowiązek kontrolować, czy wszczęcie postępowania karno-skarbowego nie służyło jedynie zawieszeniu biegu terminu przedawnienia zobowiązań podatkowych, bez realnej aktywności organów postępowania przygotowawczego, co mogłoby wskazywać na instrumentalne wykorzystanie tej instytucji. W przypadku stwierdzenia takiej nieprawidłowości, sąd administracyjny ma prawo uchylić decyzję

Związek nieruchomości z prowadzoną działalnością gospodarczą nie wynika jedynie z faktu jej posiadania przez przedsiębiorcę, ale powinien być oparty na faktycznym lub potencjalnym wykorzystaniu nieruchomości w tej działalności. Ocena związku wymaga również uwzględnienia statusu podatnika i charakteru prowadzonej przez niego działalności.