Wyrok NSA z dnia 14 maja 2008 r., sygn. II FSK 395/07

Naczelny Sąd Administracyjny w składzie: Przewodniczący Sędzia NSA Zbigniew Kmieciak (sprawozdawca), Sędzia NSA Andrzej Grzelak, Sędzia NSA Włodzimierz Kubiak, Protokolant Janusz Bielski, po rozpoznaniu w dniu 14 maja 2008 r. na rozprawie w Izbie Finansowej skargi kasacyjnej M. sp. z o. o. z siedzibą w W. od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie z dnia 23 października 2006 r. sygn. akt III SA/Wa 1974/06 w sprawie ze skargi M. sp. z o. o. z siedzibą w W. na decyzje Ministra Finansów z dnia 6 kwietnia 2006 r. nr [...], [...] w przedmiocie odmowy wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności decyzji określającej zobowiązanie podatkowe w podatku dochodowym od osób prawnych za 2000 r. oraz odmowy stwierdzenia nadpłaty w podatku dochodowym od osób prawnych za 2000 r. 1) oddala skargę kasacyjną, 2) zasądza od M. sp. z o. o. z siedzibą w W. na rzecz Ministra Finansów kwotę 240 (dwieście czterdzieści) złotych tytułem zwrotu kosztów postępowania kasacyjnego.

Wnioskami z dnia 22 sierpnia 2005 r. i 4 października 2005 r. "M." Sp. z o.o. w W. (Spółka) wystąpiła do M. F. o stwierdzenie nieważności decyzji Izby Skarbowej w K. z dnia 4 października 2002 r. wraz z uzupełniającą ją decyzją z dnia 22 listopada 2002 r. oraz decyzji Izby Skarbowej w O. z dnia 24 lipca 2001 r. Decyzjom zarzucono wydanie bez podstawy prawnej, gdyż oparto je na art. 2 pkt 2 w związku z art. 4 ustawy z dnia 20 listopada 1999 r. o zmianie ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych (Dz. U. Nr 95, poz. 110 z późn. zm.), a przepis ten, wyrokiem Trybunału Konstytucyjnego z dnia 25 czerwca 2002 r., sygn. akt K 45/01, został uznany za niezgodny z zasadą ochrony praw nabytych i zasadą ochrony interesów w toku, wyrażonymi w art. 2 Konstytucji RP.

M. F. zaskarżonymi decyzjami z dnia 12 grudnia 2005 r., odmówił wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności wskazanych decyzji, uznając, że wnioski o stwierdzenie nieważności decyzji obu Izb Skarbowych zostały wniesione z uchybieniem terminu określonego w art. 249 § 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2005 r., Nr 8, poz.60, z późn. zm zwana dalej Ord.pod.) w brzmieniu obowiązującym do dnia 31 grudnia 2002 r. ze względu na przepis przejściowy - art. 24 § 1 ustawy z dnia 12 września 2002 r. o zmianie ustawy Ordynacja podatkowa oraz o zmianie niektórych innych ustaw (Dz.U. Nr 169 poz. 1387 zwana dalej ustawą zmieniającą).

Biorąc pod uwagę, że Spółka w latach 1996-2001 posiadała status zakładu pracy chronionej nadany na czas nieokreślony na podstawie ustawy nieobowiązującej po dniu 1 stycznia 1998 r., M. F. nie zgodził się z twierdzeniem Spółki, iż wyrok Trybunału Konstytucyjnego z dnia 25 czerwca 2002 r. dotyczy również Spółki. W związku z powyższym, w ocenie M. F., w rozpatrywanej sprawie miał zastosowanie art. 249 §1 Ord.pod., w brzmieniu obowiązującym do dnia 31 grudnia 2002 r.