prawa do odliczenia podatku naliczonego można odmówić na podstawie art. 86 ust.1 ustawy o VAT na tej podstawie, że transakcja w rzeczywistości nie miała miejsca albo nabyty towar nie służył do czynności opodatkowanej. Zakwestionowanie natomiast prawa do odliczenia podatku naliczonego w takiej sprawie, w której kwestionuje się ważność transakcji albo stwierdza się jej pozorność, zastosowanie art. 88
Związek nieruchomości z prowadzoną działalnością gospodarczą nie wynika jedynie z faktu jej posiadania przez przedsiębiorcę, ale powinien być oparty na faktycznym lub potencjalnym wykorzystaniu nieruchomości w tej działalności. Ocena związku wymaga również uwzględnienia statusu podatnika i charakteru prowadzonej przez niego działalności.
Interpretacja przepisów prawa podatkowego nie może służyć unikaniu opłacania podatków za pomocą sztucznych operacji gospodarczych. W sytuacji, kiedy dokładne przeprowadzenie postępowania dowodowego nie jest możliwe lub celowe, organy podatkowe mogą odmówić wszczęcia postępowania w odniesieniu do wydania interpretacji indywidualnej, na podstawie uprawnionego przypuszczenia.
Sądy administracyjne mają obowiązek kontrolować, czy wszczęcie postępowania karno-skarbowego nie służyło jedynie zawieszeniu biegu terminu przedawnienia zobowiązań podatkowych, bez realnej aktywności organów postępowania przygotowawczego, co mogłoby wskazywać na instrumentalne wykorzystanie tej instytucji. W przypadku stwierdzenia takiej nieprawidłowości, sąd administracyjny ma prawo uchylić decyzję
Wynajem nieruchomości na cele komercyjne, niezależnie od stopnia jej eksploatacji, jest traktowany jako działalność gospodarcza, co skutkuje obowiązkiem zapłaty wyższych stawek podatków od nieruchomości. Przy opodatkowaniu nieruchomości decyduje jej gospodarcze przeznaczenie i wykorzystanie, a nie fakt, czy jest ona faktycznie eksploatowana.