Zakaz ne bis in idem nie ma zastosowania do sytuacji, gdy nałożenie kar administracyjnych wynika z różnych ustaw, które penalizują odrębne rodzaje naruszeń, nawet jeśli dotyczą one tego samego czynu w aspekcie faktycznym, ponieważ realizują odmienne cele i chronią różne interesy prawne.
Zasada ne bis in idem nie jest naruszona, gdy nałożenie kar pieniężnych następuje na podstawie różnych ustaw, które wprowadzają odrębne regulacje prawne odnoszące się do różnych zakresów ochrony i penalizują zachowania w różny sposób, nawet jeśli faktyczne stany sprawy są zbieżne.
W przypadku wątpliwości co do kwalifikacji prawnej obiektu budowlanego, organy administracyjne obowiązane są do kompleksowego wyjaśnienia stanu faktycznego i prawidłowego zastosowania przepisów Prawa budowlanego, w szczególności rozstrzygania, czy obiekt jest trwale związany z gruntem, co może wymagać pozwolenia na budowę.
Rada gminy, wprowadzając wewnętrzne definicje pojęć związanych z odpadami komunalnymi w ramach obowiązujących ustawowych granic i w celu technicznego uporządkowania ich odbioru, nie narusza ustawowych przepisów, jeżeli takie działania mieszczą się w zakresie ustawowo dopuszczonych sposóbów realizacji zadań gminy. Teza od Redakcji