Jak skorygować fakturę w sytuacji uznania transakcji za niepodlegającą opodatkowaniu VAT

1 października 2020 r. spółka A sprzedała zabudowaną nieruchomość firmie B. Transakcja została opodatkowana według 23% stawki podatku VAT. Na udokumentowanie spółka wystawiła fakturę w wysokości 1 230 000 zł, w tym VAT: 230 000 zł. Podatek należny (VAT) od tej dostawy spółka A rozliczyła w deklaracji VAT. W wyniku kontroli podatkowej przeprowadzonej w spółce A organ podatkowy stwierdził, że w przedmiotowej transakcji doszło do zbycia zorganizowanej części przedsiębiorstwa, która to transakcja nie podlega VAT. W jaki sposób w tej sytuacji skorygować dokonane rozliczenia?