Czy faktury korygujące „in plus” zwiększają podstawę opodatkowania VAT po ostatecznym potwierdzeniu i odbiorze robót

Spółka (podatnik VAT czynny rozliczający VAT miesięcznie) współpracuje z firmą Y (zamawiający) w zakresie różnorodnych prac. Prace każdorazowo wykonywane są na podstawie i w zakresie określonym umową, stosownie do wymagań określonych przez zamawiającego oraz obowiązujących przepisów prawa. Po wykonaniu powierzonych prac zamawiający dokonuje odbioru tych prac zgodnie z postanowieniami danej umowy. Na potwierdzenie odbioru prac jest podpisywany protokół odbioru przez osoby do tego upoważnione reprezentujące obydwie strony. W umowach ostateczne wynagrodzenie przysługujące spółce jest obliczane z wykorzystaniem metody marży transakcyjnej netto na podstawie rzeczywiście poniesionych kosztów oraz ustalonego rynkowego poziomu narzutu na te koszty. Rozliczenie między stronami umowy następuje w dwóch etapach. W pierwszej kolejności wynagrodzenie udokumentowane fakturami wyznaczane jest na podstawie kosztów planowanych, które podlegają weryfikacji przez zamawiającego na podstawie przesłanego przez spółkę rozliczenia sporządzonego w oparciu o koszty rzeczywiste oraz przedstawionej dokumentacji. Ostateczna wysokość wynagrodzenia należnego spółce jest więc znana po zaakceptowaniu rozliczenia końcowego przez zamawiającego. Tak ustalane wynagrodzenie, zarówno w fazie pierwszej, jak i drugiej, stanowi kwotę netto, do której doliczany jest VAT. Po podpisaniu protokołu spółka ma obowiązek wystawienia zamawiającemu stosownej faktury korygującej („in minus” lub „in plus”) – w zależności od treści tego protokołu. Z art. 29a ust. 17 ustawy o VAT wynika, że w przypadku gdy podstawa opodatkowania uległa zwiększeniu, korekty tej podstawy dokonuje się w rozliczeniu za okres rozliczeniowy, w którym zaistniała przyczyna zwiększenia podstawy opodatkowania. Czy w opisanym przypadku za moment „zaistnienia przyczyny zwiększenia podstawy opodatkowania” należy uznać moment pisemnej akceptacji ostatecznego rozliczenia bazy kosztowej i narzutu zysku przez zamawiającego (podpisanie protokołu rozliczenia prac)? Czy wobec tego spółka może na podstawie wystawionych faktur korygujących „in plus” zwiększyć podstawy opodatkowania w stosunku do zafakturowanych wcześniej prac w rozliczeniu za okres, w którym doszło do pisemnej akceptacji ostatecznej wysokości wynagrodzenia za cały zakres prac przez zamawiającego?