Wynagrodzenie za reorganizację oraz przychody z likwidacji środków trwałych są opodatkowane na zasadach ogólnych, nie korzystając ze zwolnienia SSE. Koszty reorganizacji stanowiące koszty uzyskania przychodu nie są związane bezpośrednio z wynagrodzeniem za reorganizację, natomiast koszty likwidacji środków trwałych mogą być uznawane za koszty podatkowe w braku zmiany rodzaju działalności.