Usługi pozyskiwania dotacji oraz związane z obsługą biura, sklasyfikowane odpowiednio pod PKWiU 70.22.30.0 i 82.1, podlegają opodatkowaniu zryczałtowanym podatkiem dochodowym według stawki 8,5% zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 5 lit. a ustawy, o ile nie stanowią doradztwa związanego z zarządzaniem (PKWiU ex dział 70).

Otrzymane środki na podjęcie działalności gospodarczej są zwolnione od opodatkowania, a wydatki na zakup wyposażenia, finansowane z tych środków, mogą być zaliczane do kosztów uzyskania przychodów, o ile zostały poniesione w związku z prowadzoną działalnością gospodarczą.

Przy sprzedaży środka trwałego kosztem uzyskania przychodu jest jego wartość początkowa, pomniejszona o odpisy amortyzacyjne, niezależnie od źródła finansowania jego wytworzenia.

Realizacja przez Gminę projektu budowy przydomowych oczyszczalni ścieków nie stanowi działalności gospodarczej w rozumieniu ustawy o VAT, a tym samym wpłaty od mieszkańców oraz otrzymane dofinansowanie nie podlegają opodatkowaniu podatkiem VAT, tym samym wykluczając prawo do odliczenia podatku naliczonego.

Gmina nie działa jako podatnik VAT w zakresie realizacji inwestycji związanej z montażem zbiorników wodnych, a czynności te nie podlegają opodatkowaniu VAT, z uwagi na ich publicznoprawny charakter i brak działalności gospodarczej. Opłaty od osób fizycznych oraz dofinansowanie nie stanowią wynagrodzenia za opodatkowane usługi, co wyklucza prawo do odliczenia VAT naliczonego.

Środki otrzymywane z Funduszu Polskiej Nauki przez publiczne uczelnie na cele badawcze nie stanowią podstawy opodatkowania VAT, zaś kwoty uzyskane z podziału zysku z komercjalizacji wyników badań stanowią wynagrodzenie podlegające opodatkowaniu tym podatkiem.

Dofinansowanie publiczne oraz wpłaty mieszkańców na realizację projektu budowy przydomowych oczyszczalni ścieków przez gminę, które nie mają na celu osiągnięcia stałego dochodu, nie stanowią czynności opodatkowanych VAT, a Gmina nie jest zobowiązana do wystawiania faktur VAT na wpłaty oraz nie przysługuje jej prawo do odliczenia VAT.

Dotacja na realizację projektu naukowego, nie wpływająca bezpośrednio na cenę dostaw ani świadczeń, nie stanowi obrotu w rozumieniu art. 29a ust. 1 ustawy VAT i nie podlega opodatkowaniu tym podatkiem. Ponadto, możliwe jest pełne odliczenie podatku VAT związanego z kosztami projektu, o ile są one przeznaczone na czynności opodatkowane.

Wydatki poniesione na zakup wyposażenia, sfinansowanego ze środków dotacji zwolnionej z opodatkowania, mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów, o ile zakupy te mają bezpośredni związek z prowadzoną działalnością gospodarczą i są prawidłowo udokumentowane.

Środki finansowe otrzymane jako dotacja na projekt badawczo-rozwojowy stanowią przychód podatkowy, ale mogą korzystać ze zwolnienia na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 21 ustawy o CIT, jeżeli są przeznaczone na pokrycie kosztów środków trwałych, wartości niematerialnych i prawnych.

Dofinansowanie mające charakter zwrotu kosztów ogólnych, a nie dopłaty do ceny świadczenia, nie stanowi wynagrodzenia w rozumieniu art. 29a ust. 1 ustawy o VAT i nie skutkuje prawem do odliczenia podatku naliczonego od związanych z nim wydatków.

Dotacje otrzymane od Gminy ościennej i Wojewody z tytułu organizacji publicznego transportu zbiorowego nie stanowią podstawy do opodatkowania VAT, gdyż brak jest bezpośredniego związku między dotacjami a konkretnymi usługami, co wyklucza ich uznanie za wynagrodzenie za świadczenie usług.

Dotacja otrzymana przez Instytut na pokrycie kosztów projektowych nie stanowi wynagrodzenia podlegającego opodatkowaniu VAT, gdyż brak jest bezpośredniego wpływu na cenę świadczonych usług, co wyklucza również prawo do odliczenia VAT naliczonego.

Zaliczki na rekompensaty oraz rekompensaty dla podmiotów uprawnionych wynikające z ustawy o maksymalnych cenach energii elektrycznej, stanowią wyjątek od zasady opodatkowania VAT. Nie są traktowane jako dotacje wpływające na podstawę opodatkowania według ustawy o VAT i nie podlegają opodatkowaniu tym podatkiem.

Amortyzacje środków trwałych, sfinansowanych z dochodów zwolnionych na mocy art. 17 ust. 1 pkt 5a ustawy o CIT, mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów, o ile środki te zostały przeznaczone na cele statutowe klubu sportowego, w tym na szkolenie i współzawodnictwo sportowe dzieci i młodzieży.

Rekompensaty przyznawane na podstawie ustawy o środkach nadzwyczajnych, w świetle art. 10 ust. 2 tej ustawy, są wyłączone z podstawy opodatkowania VAT, mimo podobieństwa do dotacji, subwencji i innych dopłat wymienionych w art. 29a ust. 1 ustawy o VAT.

Wynagrodzenie dyrektora niepublicznej szkoły muzycznej, finansowane z dotacji oświatowej, stanowi przychód z pozarolniczej działalności gospodarczej, które może być opodatkowane zryczałtowanym podatkiem dochodowym według stawki 3% zgodnie z art. 12 ust. 7 pkt e ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym.

Dotacje przyznane na pokrycie kosztów projektu badawczego, które nie są powiązane bezpośrednio z ceną dostarczanych towarów lub usług, nie stanowią podstawy do opodatkowania VAT. Natomiast wynagrodzenie uzyskane z komercjalizacji wyników badań badawczych powinno być opodatkowane, jeśli stanowi faktyczne wynagrodzenie za świadczenie usług. Prawo do odliczenia VAT przysługuje, jeśli zakupy są związane

Środki finansowe otrzymane w ramach Polsko-Szwajcarskiego Programu Współpracy jako udział w projekcie korzystają ze zwolnienia z CIT na mocy art. 17 ust. 1 pkt 53 ustawy o CIT. Koszty amortyzacji środków dofinansowanych nie mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodu.

Jednostka samorządu terytorialnego, która realizuje projekt w zakresie zaspokajania zbiorowych potrzeb wspólnoty i nieodpłatnie udostępnia powstały majątek, nie ma prawa do odliczenia podatku VAT, gdyż czynności te nie są związane z wykonaniem czynności opodatkowanych VAT.

Odpisy amortyzacyjne od ulepszonych środków trwałych, sfinansowane dodatkowo ze środków własnych, wymagają ponownego ustalenia proporcji KUP/NKUP, z uwzględnieniem finansowania dotacyjnego. Każdy przypadek zmiany wartości środka trwałego musi respektować zasadę rozdziału kosztów według źródeł finansowania, niezależnie od późniejszego finansowania ulepszeń.