Wystawienie faktury korygującej do zera dla pierwotnej faktury VAT dokumentującej rzeczywiste zdarzenie gospodarcze, nie rodzi obowiązku zapłaty podatku na podstawie art. 108 ust. 1 ustawy o VAT, przy jednoczesnym braku prawa do odliczenia podatku naliczonego, jeśli faktura nie była zaakceptowana przez sprzedawcę.
Odliczenie podatku naliczonego jest możliwe wyłącznie z faktur w rozumieniu ustawy o VAT, które są przechowywane elektronicznie z zachowaniem autentyczności, integralności i czytelności. Dokumenty inne niż faktury mogą wspierać rozliczenia, lecz nie stanowią podstawy do obniżenia podatku należnego.
Podatnicy dokonujący samofakturowania dla dostawców zarejestrowanych do VAT w Polsce, lecz bez stałej siedziby, nie są zobowiązani do wystawiania faktur przez KSeF, chyba że uzyskają autoryzację i uprawnienia od zagranicznego dostawcy zgodnie z art. 106ga ust. 4 ustawy o VAT.
Spółka jako nabywca podejmująca czynność samofakturowania na rzecz dostawców nie jest zobowiązana do wykazywania faktur w JPK_FA, ponieważ zgodnie z przepisami oraz poglądami sądowymi, JPK_FA obejmuje jedynie faktury sprzedaży podatnika będącego dostawcą towarów lub usług.
Świadczenia marketingowe partnerów wnioskodawcy stanowią odpłatne świadczenie usług podlegające opodatkowaniu VAT, uzasadniające prawo do odliczenia podatku naliczonego przy nabyciu od czynnych podatników VAT. Odliczenie jest niedozwolone w przypadku faktur partnerów zwolnionych na podstawie art. 113 ust. 1 ustawy o VAT, które powinny być wystawiane bez wykazu podatku.