Ogólny czas pracy pracownika, kluczowy dla oceny przedmiotowej ulgi B+R, obejmuje całkowitą liczbę godzin pracy wynikającą z rozkładu pracy, bez wyłączenia okresów usprawiedliwionej nieobecności, zgodnie z wykładnią systemową regulowaną przez Kodeks pracy.

Spółka, na podstawie art. 18db ust. 4 w zw. z ust. 1 ustawy o CIT, ma prawo pomniejszenia zaliczek PIT od wynagrodzeń specjalistów B+R od miesiąca następującego po złożeniu zeznania CIT-8, mimo że dotyczy to wynagrodzenia za miesiąc, w którym złożono to zeznanie.

Wypłaty wstecznych wyrównań i zwiększonych bieżących wynagrodzeń mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów, natomiast odszkodowań za nierówne traktowanie wraz z odsetkami nie można zaliczyć do takich kosztów; koszty postępowania sądowego mogą być zakwalifikowane jako koszty uzyskania przychodów.

Przychód z nabycia nieruchomości z bonifikatą, wynikającą z definitywnego przepisu, podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym jako inne źródło dochodów. Darowizna nieruchomości przed upływem pięciu lat od nabycia, pozostaje nieopodatkowana, o ile spełnia nieodpłatny charakter czynności.

Koszty uzyskania przychodu ze stosunku pracy mogą być wykazane w wysokości faktycznie poniesionych wydatków udokumentowanych imiennymi biletami okresowymi, o ile są wyższe od kosztów zryczałtowanych i nie zostały zwrócone przez pracodawcę (art. 22 ust. 11 u.p.d.o.f.).

Wydatki ponoszone przez pracowników Spółki, pokryte imiennymi służbowymi kartami kredytowymi, udokumentowane fakturami wystawionymi na pracowników lub paragonami fiskalnymi bez danych nabywcy, stanowią koszty uzyskania przychodów zgodnie z art. 15 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych, jeśli są powiązane z działalnością gospodarczą i właściwie udokumentowane.

Koszty noclegu pracownika poniesione w trakcie podróży służbowej (krajowej lub zagranicznej) i przekraczające limity Rozporządzenia ministra, mogą korzystać ze zwolnienia z PIT na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 16 lit. a ustawy o PIT, o ile pracodawca wyrazi zgodę na ich zwrot w uzasadnionych przypadkach.

Zakwaterowanie zapewniane pracownikom przez pracodawcę w kontekście ich oddelegowania do miejsca poza miejscem zamieszkania stanowi przychód z tytułu nieodpłatnych świadczeń podlegający opodatkowaniu podatkiem dochodowym, ponieważ przynosi pracownikowi wymierną korzyść finansową poprzez uniknięcie wydatku.

Bonifikata przy zakupie nieruchomości od Lasów Państwowych nie stanowi przychodu podlegającego opodatkowaniu, gdyż nie stanowi świadczenia nieodpłatnego; sprzedaż warunkowa wyklucza uznanie przysporzenia majątkowego za przychód podatkowy.

Dofinansowanie wynagrodzeń pracowników z FGŚP, otrzymane przez podmiot działający w Specjalnej Strefie Ekonomicznej, stanowi przychód z działalności zwolnionej z opodatkowania CIT, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, o ile istnieje ścisły związek z działalnością strefową.

Przychód pracownika z tytułu nieodpłatnych świadczeń, wynikający z zasilenia karty lunchowej pracownikowi przez pracodawcę, powstaje w momencie postawienia środków do dyspozycji pracownika, bez względu na faktyczne wykorzystanie tych środków.

Opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek (estoński CIT) może podlegać podatnik zatrudniający co najmniej 3 osoby w przeliczeniu na pełne etaty przez 300 różnych dni w roku podatkowym; warunek nie jest spełniony poprzez zsumowanie krótszego okresu zatrudnienia większej liczby osób.

Wartość kart podarunkowych oraz przedpłaconych finansowanych ze środków ZFŚS stanowi przychód pracownika, opodatkowany po przekroczeniu limitu 1 000 zł. Pracodawca nie ma obowiązku pomniejszania kwoty świadczenia o podatek przed jego przyznaniem, ale musi pobrać zaliczkę od nadwyżki zgodnie z zasadami art. 32 ustawy o PIT.

Spółka jest uprawniona do ulgi na innowacyjnych pracowników, jednak musi dostosować definicję "ogólnego czasu pracy" do obowiązujących przepisów prawa pracy oraz precyzyjnie stosować pomniejszenia zaliczek PIT zgodnie z art. 18db ust. 1 ustawy o CIT zgodnie ze zobowiązaniami roku podatkowego.

Nowy pracodawca, przejmujący części zakładu pracy na podstawie art. 23¹ § 1 Kodeksu pracy, nie ma obowiązku zapłaty zaliczek na podatek dochodowy od osób fizycznych za okres przed przejęciem, jeśli zaliczki te zostały pobrane i wpłacone przez poprzedniego pracodawcę. Funkcja płatnika nie przechodzi na nowego pracodawcę bez wyraźnej podstawy prawnej w ustawie podatkowej.

Zwrot kosztów za pranie odzieży oraz korzystanie z sanitariatów w transporcie międzynarodowym jest zwolniony z opodatkowania, jeżeli odpowiada rzeczywistym kosztom lub średnim kosztom rynkowym, zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 11 i 23d ustawy o PIT. Ryczałt przewyższający te koszty wymaga opodatkowania.

Bony przekazane pracownikom jako premia ze stosunku pracy podlegają opodatkowaniu, natomiast te przyznane podopiecznym, jako świadczenie z pomocy społecznej, korzystają ze zwolnienia z podatku dochodowego, zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 79 PDOF.

Dochód z działalności prowadzonej na podstawie decyzji o wsparciu, realizowanej w ramach zdalnej i hybrydowej pracy pracowników, podlega zwolnieniu z podatku dochodowego od osób prawnych na mocy art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT, o ile spełnia pozostałe warunki związane z decyzją o wsparciu.

Wydatki poniesione na zakup i utrzymanie konia, używanego w dobrowolnym programie pracowniczym, nie stanowią kosztów uzyskania przychodów zgodnie z art. 15 ust. 1 ustawy o CIT, gdyż nie mają bezpośredniego i obiektywnego związku z działalnością gospodarczą Spółki.

Nieodpłatne świadczenia, takie jak badania profilaktyczne i konsultacje lekarskie finansowane z funduszy unijnych w ramach programów operacyjnych, korzystają ze zwolnienia podatkowego na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 114 ustawy o PIT.

Otrzymanie przez podatnika w ramach zdarzenia korporacyjnego akcji spółki D. stanowi przychód z innych źródeł, którego wartość ustala się według cen rynkowych na dzień ich otrzymania; przy odpłatnym zbyciu tych akcji kosztem uzyskania przychodu jest wartość nieodpłatnie uzyskanych akcji.

Przychody z tytułu premii i świadczeń z Zakładowego Funduszu Świadczeń Socjalnych, jako przychody ze stosunku pracy, co do zasady podlegają opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych, z wyjątkiem świadczeń z ZFŚS, zwolnionych do limitu 1000 zł rocznie na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 67 ustawy o PIT.

Praca zdalna pracowników spółki prawniczej z Ukrainy wykonywana z terytorium Polski z powodu wojny w Ukrainie, ograniczona do działań promocyjno-pomocniczych, nie skutkuje powstaniem w Polsce zakładu podatkowego spółki w rozumieniu art. 4a pkt 11 ustawy o CIT oraz art. 5 Konwencji polsko-ukraińskiej o unikaniu podwójnego opodatkowania.

Płatnik podatku dochodowego od osób fizycznych, korzystający z ulgi badawczo-rozwojowej, określa podstawę wynagrodzenia wskazanego w art. 28 § 1 Ordynacji podatkowej na poziomie zaliczek faktycznie wpłacanych do urzędu skarbowego, uwzględniając pomniejszenia z art. 18db ustawy o CIT.