Organ przedłużający termin zwrotu nadwyżki VAT powinien wykazać rzeczywiste i konieczne przesłanki do tej decyzji, a brak ich precyzyjnego uzasadnienia narusza prawo podatnika i skutkuje uchyleniem decyzji o przedłużeniu zwrotu jako całkowicie nieuzasadnionej.

Naczelny Sąd Administracyjny uchyla wyrok Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego i postanowienie organu podatkowego, nakazując pełne zweryfikowanie zasadności przedłużenia zwrotu VAT, zgodnie z ustaleniami kontroli i wytycznymi NSA.

Gdy świadczenie okaże się nienależne i zostanie zwrócone, podatnik ma prawo odliczyć tę kwotę od dochodu w roku zwrotu lub w kolejnych 5 latach, na podstawie art. 26 ust. 1 pkt 5 PDOF. Korekta deklaracji za rok pierwotnego przychodu jest prawnie niedopuszczalna.

Dochody z przeniesienia autorskich praw majątkowych do programów komputerowych stworzonych w ramach działalności badawczo-rozwojowej mogą zostać opodatkowane preferencyjną stawką 5% na podstawie art. 30ca ustawy o PIT, przy spełnieniu wymogów dotyczących ewidencji oraz kwalifikacji kosztów.