Podatnik nie ma prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego od zakupów towarów i usług związanych z realizacją projektu, jeśli wydatki te nie są bezpośrednio związane z działalnością opodatkowaną, a projekt nie generuje sprzedaży opodatkowanej podatkiem od towarów i usług.

Stawka ryczałtu dla usług doradczych w zakresie oprogramowania sklasyfikowanych jako PKWiU 62.02.20.0 wynosi 12%, a nie 8,5%, co oznacza, że usługi te nie stanowią działalności techniczno-analitycznej w rozumieniu przepisów o zryczałtowanym podatku dochodowym.