Podatnikowi dokonującemu nabyć towarów i usług na cele czynności zwolnionych z VAT, związanych z świadczeniami medycznymi, nie przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.

Usługi logopedyczne świadczone przez wykwalifikowanych logopedów, obejmujące grupowe zajęcia terapeutyczne w zakresie poprawy zdrowia, kwalifikują się do zwolnienia z podatku VAT zgodnie z art. 43 ust. 1 pkt 19 lit. c ustawy, i nie wliczają się do limitu zwolnienia podmiotowego z VAT, ustanowionego w art. 113 ust. 1 tejże ustawy.

Usługi pomocnicze świadczone przez osoby fizyczne niebędące podmiotami leczniczymi, nawet gdy wspierają opiekę nad pacjentami w placówkach medycznych, nie korzystają ze zwolnienia z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 18a ustawy o VAT, gdy świadczący nie spełnia kryteriów podmiotowych dla tego zwolnienia.

Zawarta po ukończeniu rezydentury umowa cywilnoprawna na świadczenie usług jako lekarz specjalista z byłym pracodawcą nie wyklucza opodatkowania przychodów ryczałtem, jeśli zakres czynności nie odpowiada tym realizowanym w trakcie zatrudnienia na etacie.

Usługi dietetyczne świadczone na rzecz osób z pogorszonym stanem zdrowia, mające charakter terapeutyczny, korzystają ze zwolnienia z VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 19 lit. c ustawy o VAT. Usługi na rzecz osób bez diagnozy oraz sportowców, ukierunkowane na profilaktykę, nie spełniają przesłanki terapeutycznej, co wyklucza zastosowanie zwolnienia podatkowego.

Usługi dozymetrii indywidualnej świadczone przez podmiot leczniczy nie mogą korzystać ze zwolnienia z VAT, gdyż nie realizują wprost celu terapeutycznego, zgodnie z art. 43 ust. 1 pkt 18) i 18a) ustawy o VAT, tj. profilaktyki, ratowania, przywracania lub poprawy zdrowia.

Zwolnienie z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 19 ustawy o VAT nie przysługuje w przypadku świadczenia usług zdrowotnych przez kosmetologa, jako że zawód ten nie jest uznawany za medyczny w rozumieniu ustawy o działalności leczniczej.

Usługi opieki czynnej nad pacjentami nie mieszczą się w spectrum zwolnienia podmiotowo-przedmiotowego z VAT, określonego w art. 43 ust. 1 pkt 19 lit. c) ustawy VAT, jako że nie są wykonywane w ramach uznanego zawodu medycznego.

Możliwe jest opodatkowanie przychodów z działalności leczniczej wykonywanej przez lekarza w ramach indywidualnej praktyki lekarskiej zryczałtowanym podatkiem dochodowym w wysokości 14%, jeśli czynności te nie są identyczne z obowiązkami wykonywanymi u pracodawcy jako pracownik w trakcie szkolenia specjalizacyjnego.

Przychody uzyskiwane z tytułu świadczenia usług medycznych jako lekarz specjalista na rzecz byłego pracodawcy mogą być opodatkowane ryczałtem, gdy czynności te nie są tożsame z zadaniami wykonywanymi jako rezydent.

Przychody z tytułu świadczeń zdrowotnych wykonanych ponad limity umowne z NFZ, które nie są objęte gwarancją zapłaty, powinny być rozpoznawane dla celów CIT w dacie ich faktycznego otrzymania, zgodnie z art. 12 ust. 3e ustawy o CIT.

Czynności wykonywane przez lekarza w ramach działalności gospodarczej po zakończeniu stosunku pracy nie są tożsame z obowiązkami wykonywanymi podczas rezydentury, co umożliwia opodatkowanie przychodów z tej działalności ryczałtem od przychodów ewidencjonowanych, zgodnie z przepisami ustawy z 20 listopada 1998 r. o zryczałtowanym podatku dochodowym.

Usługi świadczone przez lekarza na zlecenie instytucji państwowych, klasyfikowane jako usługi w zakresie praktyki lekarskiej (PKWiU 86.2), podlegają opodatkowaniu 14% stawką ryczałtu od przychodów ewidencjonowanych, zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 2a lit. a) ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym.

Podatnikowi nie przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego ani do zwrotu VAT, gdy nabywane towary i usługi wykorzystywane są wyłącznie do czynności zwolnionych z VAT, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT. Proporcjonalny udział czynności opodatkowanych nie przekraczający 2% uniemożliwia takie rozliczenie.

Przychody z tytułu usług zdrowia psychicznego świadczonych przez osoby fizyczne, sklasyfikowanych jako PKWiU 86.90.18.0, podlegają opodatkowaniu ryczałtem według stawki 14% na podstawie art. 12 ust. 1 pkt 2a lit. a ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym.

W przypadku wykazania straty podatkowej, środki otrzymane z Państwowego Funduszu Rehabilitacji Osób Niepełnosprawnych, mimo że stanowią przychód podatkowy, nie powodują powstania dochodu do opodatkowania i tym samym nie rodzą obowiązku zapłaty podatku CIT.

Zwrot podatku od towarów i usług dla kompleksowych turnusów terapeutyczno-rehabilitacyjnych dla dzieci nie przysługuje z uwagi na niespełnienie wymogów podmiotowych określonych w art. 43 ust. 1 pkt 19 ustawy o VAT.

Podatnik, który zmienia status zawodowy z rezydenta na specjalistę, uzyskując samodzielność w wykonywaniu obowiązków i rezygnując z nadzoru, może po rozwiązaniu umowy o pracę z byłym pracodawcą zyskiwać dochody z działalności gospodarczej oraz skorzystać z podatku liniowego i ryczałtu, jeśli czynności nie są tożsame z wcześniejszymi."

Lekarz prowadzący działalność gospodarczą w zakresie usług medycznych, korzystający ze zryczałtowanego opodatkowania przychodów, nie traci tego prawa, gdy usługi te różnią się rodzajowo od czynności realizowanych w ramach umowy o pracę i mieszczą się w grupowaniu PKWiU 86.21.Z.

Przychody uzyskiwane przez lekarza z tytułu świadczenia usług medycznych w ramach działalności gospodarczej mogą być opodatkowane ryczałtem, o ile czynności te nie są tożsame z obowiązkami wykonywanymi wcześniej na podstawie umowy o pracę.

Świadczenia podologiczne, nawet jeśli służą poprawie zdrowia, nie korzystają ze zwolnienia od VAT, jeżeli nie są wykonywane przez podmiot zarejestrowany jako podmiot leczniczy, a osoba wykonująca nie posiada wpisu do właściwej izby zawodowej, co wyklucza spełnienie podmiotowej przesłanki zwolnienia podatkowego.

Zakład Opieki Zdrowotnej nie ma prawa do odzyskania podatku VAT naliczonego od zakupionego sprzętu i modernizacji pomieszczeń w projekcie przeznaczonym do działalności zwolnionej od VAT, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT. Odliczenie jest możliwe tylko w zakresie czynności opodatkowanych.

Przychody uzyskiwane przez podatnika z działalności podologicznej oraz pośrednictwa w interesach, jako odpowiednio zakwalifikowane do grupowań PKWiU 86.90.19.0 i 74.90.12.0, mogą podlegać opodatkowaniu zryczałtowanym podatkiem dochodowym w wysokości 14% dla usług zdrowotnych i 8,5% dla usług pośrednictwa, przy spełnieniu określonych warunków i braku wyłączeń.

Paragon fiskalny za usługi medyczne świadczone nieubezpieczonym pacjentom przez zakłady opieki zdrowotnej winien być wystawiony w momencie realizacji usługi medycznej, nie później niż z chwilą przyjęcia należności; nie dopuszcza się wystawiania paragonu w dniu następnym po wykonaniu usługi.