Na gruncie art. 23 ust. 1 pkt 38 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, wartość bilansowa majątku spółki przekształcanej nie stanowi wydatków na objęcie akcji, lecz wydatki te mogą być uznane za koszty uzyskania przychodu z ich zbycia, gdy nie wiążą się z historycznym okresem nabycia majątku przekształconej spółki.

Do odliczenia zryczałtowanego podatku CIT od PIT przy zyskach komplementariusza w spółce komandytowej ma zastosowanie mechanizm przewidziany w art. 30a ust. 6a ustawy o PIT, umożliwiający pomniejszenie podatku PIT niezależnie od zmiany statusu wspólnika w trakcie roku podatkowego.

Wypłata zaliczek z zysku spółki komandytowej na rzecz komplementariusza w trakcie roku podatkowego nie powoduje powstania zobowiązania z tytułu zryczałtowanego podatku dochodowego od dochodów z udziałów. Zobowiązanie podatkowe powstaje dopiero po zakończeniu roku podatkowego i ustaleniu rzeczywistego zysku oraz podatku dochodowego od osób prawnych.

Spółka komandytowa wypłacając zaliczki na zysk komplementariuszowi nie ma obowiązku poboru podatku PIT, dopóki nie jest znana wysokość podatku CIT spółki za dany rok. Ustalenie i pobór zryczałtowanego PIT następuje po zakończeniu roku podatkowego, uwzględniając zapłacony CIT zgodnie z ostatecznym wynikiem finansowym.

Wypłaty na rzecz wspólników spółki komandytowej lub komandytowo-akcyjnej z tytułu zobowiązania długoterminowego, powstałego w wyniku przekształcenia i przeksięgowania kapitału zapasowego, nie podlegają dodatkowi podatkowemu, gdyż wcześniej opodatkowane zyski nie stanowią nowego przychodu podatkowego.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę komandytową przed 1 maja 2021 r., kiedy spółka nie była podatnikiem CIT, nie powoduje powstania obowiązku podatkowego po stronie spółki z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych.

Wypłaty niepodzielonych zysków wypracowanych przez spółkę komandytową, przed jej przekształceniem i uzyskaniem statusu podatnika CIT, dokonane przez spółkę z o.o., nie podlegają ponownemu opodatkowaniu CIT ani jako dywidenda, ani jako ukryty zysk pod estońskim CIT.

Rezygnacja z dotychczasowego wkładu wspólników spółki komandytowej przez uchwałę wspólników i zmianę umowy spółki nie skutkuje natychmiastowym powstaniem przychodu podatkowego. Przychód podlegający PIT powstaje z chwilą faktycznego otrzymania środków, stanowiąc analogię częściowego wystąpienia wspólnika ze spółki.

Wypłata zysków przez spółkę komandytową na rzecz wspólników z zysków wypracowanych przed 1 maja 2021 r., zaksięgowanych na kapitale zapasowym, nie skutkuje obowiązkiem spółki jako płatnika do poboru podatku dochodowego od osób fizycznych, z uwagi na wcześniejsze opodatkowanie tych zysków.

Wypłata zysków wypracowanych przed przekształceniem spółki jawnej, po przekształceniu w spółkę komandytową, nie generuje obowiązku ponownego opodatkowania, jeśli decyzja o ich podziale zapadła przed przekształceniem. Natomiast zyski zarejestrowane później wymagają poboru podatku jako dochód z zysków osób prawnych.

Kwoty otrzymane z tytułu wystąpienia ze spółki cywilnej traktuje się jako przychody z działalności gospodarczej, natomiast z tytułu wystąpienia ze spółki komandytowej jako przychody z kapitałów pieniężnych, podlegające opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych.

Nabycie ogółu praw i obowiązków komandytariusza w spółce komandytowej na podstawie art. 10 Kodeksu spółek handlowych nie jest czynnością podlegającą opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych, gdyż nie mieści się w zamkniętym katalogu czynności wymienionych w ustawie o PCC.

Spółka komandytowa jako płatnik zryczałtowanego podatku dochodowego obowiązana jest pobrać podatek od dochodu komplementariusza z zysków dopiero po opodatkowaniu dochodu spółki, umożliwiając odliczenie proporcjonalnego CIT płaconego przez spółkę, unikając tym samym podwójnego opodatkowania.

Zmniejszenie udziałów kapitałowych w spółce komandytowej poprzez zwrot nieruchomości nabytych przed uzyskaniem przez spółkę statusu podatnika CIT skutkuje powstaniem przychodu z kapitałów pieniężnych po stronie wspólnika, nakładając tym samym obowiązek podatkowy na płatnika, o czym stanowi art. 17 ust. 1 pkt 4 w związku z art. 24 ust. 5 pkt 1a ustawy o PIT.

Wypłata zatrzymanych zysków zysków przez spółkę przekształconą na rzecz wcześniejszych wspólników, a po przekształceniu niewłaścicieli udziałów, nie podlega wyłączeniu z opodatkowania jako przychody z kapitałów pieniężnych, ale stanowi przychód z innych źródeł, obciążając spółkę obowiązkiem informacyjnym.

Obniżenie udziału kapitałowego w spółce komandytowej powstałej z przekształcenia sp. z o.o. podlega opodatkowaniu jako przychód z kapitałów pieniężnych. Koszty uzyskania przychodów ustala się zgodnie z art. 22 ust. 1f ustawy o PIT, uwzględniając proporcję do obniżonej części udziału.

Wynagrodzenie wypłacane wspólnikom spółki komandytowej za prowadzenie jej spraw, na podstawie umowy i uchwały wspólników, należy kwalifikować jako przychód z innych źródeł, o którym mowa w art. 10 ust. 1 pkt 9 ustawy PIT, bez powstania obowiązków płatnika po stronie spółki.

Wynagrodzenie wspólników spółki komandytowej za prowadzenie jej spraw, wypłacane na podstawie umowy spółki i uchwały wspólników, kwalifikuje się jako przychody z innych źródeł, co zwalnia spółkę z obowiązków płatnika, lecz wymaga wystawienia PIT-11.

Wycofanie nieruchomości z majątku spółki komandytowej do majątku wspólników na podstawie umowy nienazwanej nie skutkuje powstaniem obowiązku podatkowego w podatku od spadków i darowizn, jako że czynność ta nie wypełnia warunków umowy darowizny ani nieodpłatnego zniesienia współwłasności.

Nieodpłatne wycofanie nieruchomości z majątku spółki komandytowej na rzecz wspólników, proporcjonalnie do udziałów w zysku, nie podlega podatkowi od czynności cywilnoprawnych, jako że czynność ta nie została wymieniona w zamkniętym katalogu czynności podlegających temu podatkowi.

Nieodpłatne przeniesienie własności nieruchomości z majątku spółki komandytowej na wspólników, proporcjonalnie do ich udziałów w zysku, nie stanowi czynności cywilnoprawnej podlegającej opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych, z uwagi na brak uwzględnienia tej czynności w zamkniętym katalogu czynności wymienionych w ustawie.

Nieodpłatne przekazanie nieruchomości ze spółki komandytowej do majątku prywatnego wspólników, na mocy uchwały, jako czynność nienazwana, nie wywołuje skutku podatkowego w zakresie podatku od spadków i darowizn, gdy nie przyjmuje formy umowy darowizny ani nieodpłatnego zniesienia współwłasności.

Wycofanie nieruchomości z majątku spółki komandytowej i jej nieodpłatne przekazanie wspólnikom skutkuje powstaniem przychodu podatkowego z kapitałów pieniężnych, podlegającego opodatkowaniu na gruncie podatku dochodowego od osób fizycznych, z uwagi na zachowanie odrębności majątkowej spółki i wspólników.