Prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego przysługuje podatnikowi wyłącznie w zakresie, w jakim wydatki są związane z działalnością opodatkowaną podatkiem VAT, przy czym czynności realizujące zadania własne gminy zgodnie z u.s.g., jeżeli nie są związane z działalnością opodatkowaną, wykluczają możliwość dokonania odliczenia.

Jednostka samorządu terytorialnego nie ma prawa do stosowania indywidualnej metody obliczenia proporcji VAT od zakupów związanych z inwestycjami, jeżeli zaproponowana metoda nie lepiej odzwierciedla specyfiki działalności i nie jest bardziej miarodajna od metody wskazanej w odpowiednim rozporządzeniu Ministra Finansów.