Koszty kwalifikowane, które nie zostały zwrócone podatnikowi, mogą być odliczane od podstawy opodatkowania w ramach ulgi badawczo-rozwojowej zgodnie z art. 18d ust. 1 ustawy o CIT, pod warunkiem spełnienia przesłanek określonych w tym przepisie.
Rekompensaty z Funduszu Rekompensat Pośrednich Kosztów Emisji nie stanowią dotacji zwolnionych od opodatkowania na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 47 ustawy CIT, ponieważ są one klasyfikowane jako przychody podlegające opodatkowaniu z uwagi na ich charakter rekompensacyjny i brak bezpośredniego pochodzenia ze środków budżetu państwa.
Przychody z dotacji zwolnione z CIT nie powodują powstania różnic kursowych. Jednakże różnice kursowe w przypadku wydatków mieszanych są kalkulowane proporcjonalnie do części finansowanej ze środków własnych. Różnice kursowe powstają również od środków własnych na rachunku walutowym niezależnie od pochodzenia tych środków, zgodnie z art. 15a ustawy o CIT.
Przychody z działalności w zakresie organizacji i koordynacji procesu aplikacyjnego o pożyczki unijne podlegają opodatkowaniu zryczałtowanym podatkiem dochodowym według stawki 15% zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 2 lit. v ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym od osób fizycznych, o ile mieszczą się w grupie PKWiU 82.9.
Podatnik, który po roku dokonania odliczeń w ramach ulgi termomodernizacyjnej otrzymał zwrot odliczonych wydatków, jest zobowiązany doliczyć te wydatki do dochodu za rok, w którym nastąpił zwrot, zgodnie z art. 26h ust. 8 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.
W przypadku braku wyodrębnienia kosztów na fakturze oraz dofinansowania przez NFOŚiGW, wydatki poniesione na instalację wiatrową i magazyn energii nie podlegają odliczeniu w ramach ulgi termomodernizacyjnej zgodnie z art. 26h ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.
Podatnik VAT ma prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur za zakupy przed rejestracją, jeśli odnoszą się one do przyszłej działalności opodatkowanej, pod warunkiem spełnienia pozostałych warunków materialnoprawnych, w tym statusu czynnego podatnika.
Podatnik, który po roku dokonania odliczenia w ramach ulgi termomodernizacyjnej otrzymał zwrot wydatków, zobowiązany jest do ich doliczenia do dochodu za rok, w którym zwrot ten otrzymał, zgodnie z art. 26h ust. 8 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.
Środki finansowe uzyskane z bezzwrotnego grantu unijnego nie podlegają zwolnieniu podatkowemu na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 46 ustawy o PIT, gdyż nie spełniają wymaganych warunków dotyczących polskich umów rządowych oraz bezpośredniej realizacji celu programu.
Podatnik, który po roku skorzystania z ulgi termomodernizacyjnej otrzymał zwrot związanych z nią wydatków, musi doliczyć otrzymaną kwotę do dochodu za rok podatkowy, w którym nastąpił zwrot, zgodnie z art. 26h ust. 8 ustawy o PIT. Nie istnieje alternatywna możliwość korekty wcześniejszych zeznań podatkowych.
Usługi pozyskiwania dotacji oraz związane z obsługą biura, sklasyfikowane odpowiednio pod PKWiU 70.22.30.0 i 82.1, podlegają opodatkowaniu zryczałtowanym podatkiem dochodowym według stawki 8,5% zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 5 lit. a ustawy, o ile nie stanowią doradztwa związanego z zarządzaniem (PKWiU ex dział 70).
Otrzymane środki na podjęcie działalności gospodarczej są zwolnione od opodatkowania, a wydatki na zakup wyposażenia, finansowane z tych środków, mogą być zaliczane do kosztów uzyskania przychodów, o ile zostały poniesione w związku z prowadzoną działalnością gospodarczą.
Wydatki poniesione na zakup wyposażenia, sfinansowanego ze środków dotacji zwolnionej z opodatkowania, mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów, o ile zakupy te mają bezpośredni związek z prowadzoną działalnością gospodarczą i są prawidłowo udokumentowane.
Odpisy amortyzacyjne od ulepszonych środków trwałych, sfinansowane dodatkowo ze środków własnych, wymagają ponownego ustalenia proporcji KUP/NKUP, z uwzględnieniem finansowania dotacyjnego. Każdy przypadek zmiany wartości środka trwałego musi respektować zasadę rozdziału kosztów według źródeł finansowania, niezależnie od późniejszego finansowania ulepszeń.
Dotacja przeznaczona częściowo na konkretne usługi kształcenia stanowi podstawę opodatkowania VAT, gdyż wpływa bezpośrednio na cenę. Jednocześnie zwolnieniom z VAT podlegają kursy i praktyki zawodowe, jak również zajęcia językowe na podstawie odpowiednich przepisów ustawy o VAT, pod warunkiem spełnienia przesłanek dotyczących form i źródeł finansowania.
Podatnik, który dokonał zakupu towarów przed rejestracją jako czynny podatnik VAT i wykorzystywał je początkowo w działalności zwolnionej z VAT, nie posiada prawa do odliczenia podatku naliczonego z tytułu tego zakupu. Prawo takie może wystąpić po zmianie przeznaczenia towarów na działalność opodatkowaną, jednak realizacja odliczenia wymaga przestrzegania zasad korekty przewidzianych w art. 91 ustawy
Premia kogeneracyjna, jako dopłata do energii elektrycznej z wysokosprawnej kogeneracji, nie kwalifikuje się jako dotacja na gruncie art. 17 ust. 1 pkt 47 ustawy o CIT i tym samym nie jest zwolniona od podatku dochodowego od osób prawnych.
Wydatki na wyposażenie niezaliczone do środków trwałych, sfinansowane z dotacji z Funduszu Pracy zwolnionej z opodatkowania, mogą być uznane za koszty uzyskania przychodów, jeżeli mają związek przyczynowy z przychodami działalności i są prawidłowo udokumentowane.
Otrzymane dofinansowanie przez Spółkę nie stanowi dochodu z tytułu ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą w rozumieniu art. 28m ust. 1 pkt 2 i 3 ustawy o CIT, co oznacza brak obowiązku ich opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek.
Środki finansowe otrzymywane przez rolnika w ramach umowy na realizację praktyk regeneracyjnych nie stanowią przychodu z działalności rolniczej w rozumieniu art. 2 ust. 2 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, a zatem podlegają opodatkowaniu jako przychody z innych źródeł.
Wydatki na instalację magazynu energii jako części systemu fotowoltaicznego mogą podlegać odliczeniu w ramach ulgi termomodernizacyjnej, jeśli nie zostały zrefinansowane dotacją. Obowiązek uwzględnienia dotacji w przychodach powstaje tylko w przypadku uzyskania wcześniejszego odliczenia kosztów w całości z ulgą.
Podatnik nie jest zobowiązany do wykazania w zeznaniu PIT dotacji otrzymanej przez osobę trzecią (teścia), gdyż nie dochodzi do sytuacji, w której podatnik korzysta z odliczeń wydatków zrefinansowanych innemu podmiotowi.
Dotacja podmiotowa przyznawana samorządowej instytucji kultury, nie stanowiąca wynagrodzenia za konkretne czynności opodatkowane, ani wpływająca na cenę świadczeń, nie powinna być uwzględniana w liczniku prewspółczynnika przy odliczaniu podatku VAT.