Koszty kwalifikowane dla ulgi badawczo-rozwojowej w podatkowej grupie kapitałowej mogą być odliczane jedynie w wysokości dochodów poszczególnych spółek członkowskich; transakcje wewnętrzne między spółkami PGK nie mogą być uznane za kwalifikowane.

Uzyskanie przez spółkę Z decyzji o wsparciu w trakcie członkostwa w PGK, bez korzystania ze zwolnienia podatkowego przed zakończeniem PGK, nie narusza art. 1a ust. 2 pkt 3 lit. a ustawy o CIT i nie prowadzi do utraty statusu PGK.

Skrócenie okresu trwania umowy PGK zgodnie z art. 1a ust. 2 Ustawy o CIT nie narusza jej statusu jako podatnika, o ile umowa PGK trwa co najmniej 3 lata, a skrócenie okresu nastąpi z zachowaniem minimalnego okresu obowiązywania umowy.

Podział przez wyodrębnienie spółki, zobowiązujący się do transferu części majątku jako zorganizowanej części przedsiębiorstwa, zgodnie z art. 4a pkt 4 ustawy o CIT, nie skutkuje powstaniem przychodu podatkowego po stronie spółki dzielonej ani przejmującej, jeśli spełnione są wymogi organizacyjnego i funkcjonalnego wyodrębnienia majątku.

Przychody z tytułu udziału w zyskach osób prawnych, niezależnie od ich reżimu podatkowego (zwolnienie czy opodatkowanie ryczałtowe), nie są uwzględniane w kalkulacji proporcji alokacji kosztów pośrednich zgodnie z art. 15 ust. 2, 2a i 2b ustawy o CIT, gdyż nie wpływają na opodatkowany dochód.

Planowane połączenie spółek, w którym Spółka Przejmująca wyemituje udziały odpowiadające wartości rynkowej majątku przejmowanych spółek, nie powoduje powstania przychodu podlegającego opodatkowaniu CIT na podstawie art. 12 ust. 1 pkt 8d, jeżeli wartość emisyjna odpowiada wartości rynku przejmowanego majątku.

Zgodnie z art. 1a ust. 9 ustawy o CIT, przedłużenie funkcjonowania PGK jest możliwe na dowolny okres, bez ograniczeń co do ilości przedłużeń, przy jednoczesnym zobowiązaniu do zgłoszenia zmiany w ciągu 14 dni od jej dokonania. Brak konieczności zgłoszenia przedłużenia na 45 dni przed końcem roku podatkowego PGK.

Przychody z dywidend, w tym zwolnione z opodatkowania na podstawie art. 22 ust. 4 ustawy o CIT, winny być uwzględniane w całkowitych przychodach do limitów kosztów finansowania dłużnego w zgodzie z art. 15c ust. 1 i 4 CIT.

Rozszerzenie podatkowej grupy kapitałowej o nową spółkę skutkuje utworzeniem nowej PGK, której przysługuje wyłączenie z minimalnego podatku dochodowego przez trzy lata od jej utworzenia, a rozliczanie strat sprzed utworzenia grupy jest ograniczone przepisami ustawy. (art. 1a ust. 6 i art. 24ca ust. 14 pkt 1 ustawy o CIT)

W kontekście planowanej podatkowej grupy kapitałowej (PGK), Spółka Dominująca ma prawo rozpoznać poniesione koszty M&A jako koszty uzyskania przychodów, proporcjonalnie do przychodów z różnych źródeł, zgodnie z art. 15 ust. 2-2b ustawy o CIT, co przewiduje stosowanie klucza przychodowego.

Oddział zagranicznej spółki nie spełnia warunków samodzielności prawnej wymaganych dla utworzenia podatkowej grupy kapitałowej; spółka dominująca musi posiadać siedzibę w Polsce, co wyklucza C. jako potencjalną spółkę dominującą w PGK.

Podatkowa grupa kapitałowa nie jest uprawniona do odliczenia straty z danego źródła przychodów powstałej podczas jej funkcjonowania od dochodu z tegoż źródła w latach następnych bez ograniczeń, zgodnie z art. 7 ust. 5 ustawy o CIT.

Połączenie, w którym spółką przejmującą jest członek PGK, a spółką przejmowaną - podmiot spoza PGK, nie prowadzi do utraty statusu podatnika przez PGK, o ile nie dochodzi do naruszenia warunków uznania PGK za podatnika, w tym braku rozszerzenia składu grupy o zewnętrzne podmioty.

Oddział wydzielony oraz działalność pozostająca w spółce, podlegające podziałowi przez wydzielenie, spełniają definicję zorganizowanej części przedsiębiorstwa w rozumieniu art. 4a pkt 4 ustawy o CIT, co skutkuje neutralnością podatkową transakcji podziału dla CIT.

Podział przez wydzielenie zorganizowanej części przedsiębiorstwa z A. SA do podmiotu spoza PGK X. nie prowadzi do utraty przez PGK X. statusu podatnika CIT, o ile nie narusza on materialnych i formalnych warunków funkcjonowania PGK jako podatnika określonych w art. 1a ust. 2 i 6 Ustawy o CIT.

Podział spółki dominującej z wyodrębnieniem ZCP do spółki wchodzącej w skład podatkowej grupy kapitałowej, nie mieszczący się w wyjątkach z art. 1a ust. 6 ustawy o CIT, skutkuje utratą przez PGK statusu podatnika CIT.

Podział przez wyodrębnienie ZCP z A. SA do nowoutworzonej spółki, skutkujący zmianą spółki dominującej PGK B., narusza warunki uznania PGK B. za podatnika CIT, prowadząc do utraty tego statusu zgodnie z zamkniętym katalogiem dopuszczalnych modyfikacji struktury PGK w ustawie o CIT.

Podział przez wydzielenie zorganizowanej części przedsiębiorstwa z A. SA, zawierający udziały w spółkach zależnych PGK X., do podmiotu spoza grupy, skutkuje utratą przez PGK X. statusu podatnika CIT ze względu na naruszenie wymogu 75% posiadania przez spółkę dominującą udziałów we wszystkich spółkach zależnych, co jest wymagane przez art. 1a ust. 2 pkt 1 lit. b ustawy o CIT.

Przepływy finansowe, w ramach Podatkowej Grupy Kapitałowej, związane z rozliczaniem zobowiązań podatkowych zgodnie z wewnętrzną Procedurą, pozostają neutralne na gruncie podatku dochodowego od osób prawnych i nie kreują przychodów ani kosztów dla spółek w PGK.

Przeniesienie zorganizowanej części przedsiębiorstwa, jaką jest Oddział D., na Spółkę Przejmującą w ramach podziału przez wydzielenie, jest czynnością wyłączoną spod działania ustawy o VAT zgodnie z art. 6 pkt 1 ustawy o VAT. W konsekwencji, transakcja nie podlega opodatkowaniu VAT, co skutkuje brakiem prawa do odliczenia podatku naliczonego przez Spółkę Przejmującą.

Połączenie spółek przez Podatkową Grupę Kapitałową, w którym następuje przejęcie spółek spoza PGK przez spółki z PGK, nie powoduje utraty statusu podatnika przez PGK, o ile nie narusza to wymogów zachowania minimalnej liczby spółek wewnątrz grupy, zgodnie z art. 1a ust. 6 ustawy o CIT.

Dobrowolne umorzenie udziałów (akcji) za wynagrodzeniem niższym od początkowych kosztów nabycia, na mocy art. 12 ust. 4 pkt 3 ustawy o CIT, nie może prowadzić do powstania straty podatkowej. Udziałowcy nie są uprawnieni do zaliczenia kwoty poniesionych wydatków na nabycie jako kosztu uzyskania przychodu.

Spółka członkowska podatkowej grupy kapitałowej, niebędąca podatnikiem podatku CIT, nie jest uprawniona do korzystania z ulgi na innowacyjnych pracowników, gdyż wymaga to jednoczesnego posiadania statusu podatnika i płatnika podatków dochodowych.