Przyznanie warrantów subskrypcyjnych w ramach Programu Motywacyjnego nie powoduje powstania przychodu podatkowego. Przychód ten powstaje w momencie realizacji praw z warrantów jako przychód z działalności gospodarczej opodatkowany 3% ryczałtem. Z kolei zbycie nabytych akcji generuje przychód z kapitałów pieniężnych z możliwością odliczenia kosztów uzyskania przychodów.

Transakcja sprzedaży aktywów, która podlega opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, nie podlega opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych zgodnie z art. 2 pkt 4 lit. a) ustawy o PCC, jeśli nie stanowi sprzedaży przedsiębiorstwa ani jego zorganizowanej części.

Transakcja zbycia składników materialnych i zasobów ludzkich związanych z działalnością księgowości, kadr i IT, nie stanowi zorganizowanej części przedsiębiorstwa, lecz odpłatne świadczenie usług podlegające opodatkowaniu VAT, zgodnie z art. 5 ust. 1 ustawy VAT.