Przychody ze sprzedaży gnojowicy z chowu świń są przychodami z działalności rolniczej i nie podlegają opodatkowaniu podatkiem PIT. Natomiast przychody ze sprzedaży obornika z chowu drobiu rzeźnego stanowią przychody z działów specjalnych produkcji rolnej i podlegają opodatkowaniu.
Gmina nie jest uprawniona do odliczenia VAT związanego z wydatkami na projekt PSZOK, gdyż efekty projektu będą używane wyłącznie do działalności niepodlegającej opodatkowaniu VAT, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Gmina nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego na podstawie art. 86 ust. 1 ustawy o VAT z wydatków na usunięcie odpadów niebezpiecznych, jako że działania te nie są związane z wykonywaniem czynności opodatkowanych, lecz są realizacją zadań własnych w sferze publicznoprawnej.
Spółdzielni Mieszkaniowej, nabywającej towary i usługi na modernizację punktów selektywnej zbiórki odpadów do czynności zwolnionych z VAT, nie przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego, gdyż nie spełnia warunków określonych w art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Obciążenie najemców kosztami wywozu popiołu należy traktować jako element usługi najmu, podlegający opodatkowaniu według stawki właściwej dla najmu, natomiast wywóz nieczystości ciekłych stanowi odrębne świadczenie podlegające oddzielnemu opodatkowaniu VAT.
Gmina wykonująca zadania własne dotyczące selektywnego zbierania odpadów komunalnych, które nie są związane z działalnością opodatkowaną VAT, nie posiada prawa do odliczenia podatku naliczonego od wydatków związanych z realizacją tych zadań.
Jednostka samorządu terytorialnego, realizując zadania własne z pomocą dotacji z NFOŚiGW, nie działa jako podatnik VAT czynny, co wyklucza prawo do odliczenia podatku VAT od wydatków związanych z tymi zadaniami. Zatem, prawo do odliczenia podatku naliczonego nie przysługuje Powiatowi względem zadania finansowanego z dotacji NFOŚiGW.
Gminie nie przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego związanego z realizacją projektu dotyczącego inteligentnego systemu gospodarki odpadami, z uwagi na brak wykorzystania tego systemu w działalności opodatkowanej, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Nabycie Surowca o wartości ujemnej stanowi odrębną od usługi zagospodarowania odpadów czynność, będącą odpłatnym świadczeniem usługi odbioru, co uzasadnia odrębne opodatkowanie. Natomiast odpłatne nabycie Surowca o wartości dodatniej jest odrębną transakcją nie pomniejszającą podstawy opodatkowania usługi. Przy zerowej wartości Surowca nie występuje odrębna czynność opodatkowania.
Jednostka samorządu terytorialnego, nie generując przychodów z realizacji projektu związanego z zadaniem publicznym, nie posiada prawa do odliczenia podatku VAT od towarów i usług związanych z projektem, jako że nie prowadzi działalności opodatkowanej VAT.
Wniesienie aportem infrastruktury w postaci PSZOK wraz z gruntem do Gminnej Spółki Komunalnej nie stanowi zbycia przedsiębiorstwa ani zorganizowanej części przedsiębiorstwa, wobec czego podlega opodatkowaniu VAT. Gmina jako czynny podatnik VAT ma prawo do pełnego odliczenia VAT naliczonego przy wydatkach poniesionych na budowę tej infrastruktury jako niewykorzystanych do działalności zwolnionej z VAT
Udział gminy w przychodach z ponownego zagospodarowania odpadów komunalnych stanowi odpłatne świadczenie usług podlegające opodatkowaniu VAT. Gminie nie przysługuje prawo do odliczenia VAT od wydatków na system gospodarowania odpadami, gdyż wydatki te nie mogą być jednoznacznie związane z działalnością opodatkowaną.
Przeniesienie kosztów badań UDT powinno być udokumentowane fakturą VAT. Przeniesienie opłat za zajęcie pasa drogowego musi być również dokumentowane fakturą. Koszty związane z opłatami administracyjnymi, znaczkami pocztowymi, gospodarowaniem odpadami i polisami ubezpieczonymi można przenosić notą księgową jako niepodlegające VAT. Zwolnienie z VAT zarządzania nieruchomościami jest możliwe wyłącznie
Gmina, realizująca zadania publiczne w sferze publicznoprawnej, nie ma prawa do obniżenia podatku należnego o podatek naliczony z wydatków niezwiązanych z działalnością opodatkowaną VAT.
Gmina nie ma prawa do odliczenia VAT naliczonego związanego z usunięciem nielegalnie zgromadzonych odpadów, gdyż działa jako organ władzy publicznej w realizacji zadań własnych, które nie są opodatkowane.
Wydatki na kary umowne związane z bieżącą działalnością gospodarczą, mimo sankcyjnego charakteru, mogą nie być uznane za wydatki niezwiązane z działalnością gospodarczą, o ile wykazują związek z prowadzoną działalnością. Kary pieniężne nakładane w trybie administracyjnym, wskazujące na zaniedbania, mogą być traktowane jako wydatki niezwiązane z działalnością gospodarczą i podlegają opodatkowaniu ryczałtem
Nieodpłatne przekazanie środka otrzymywanego z osadów ściekowych rolnikom przez gminę podlega opodatkowaniu VAT, jednak brak wartości środka dla gminy skutkuje brakiem obowiązku zapłaty podatku.
W przypadku usług odbioru odpadów komunalnych przychód podatkowy w rozumieniu ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych powstaje zgodnie z art. 12 ust. 3c ustawy CIT, tj. w ostatni dzień przyjętego okresu rozliczeniowego, bez względu na moment wystawienia faktury.
Gmina realizując zadania własne związane z usuwaniem odpadów niebezpiecznych w trybie publicznoprawnym, nie działa jako podatnik VAT, tym samym nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego od wydatków na te działania.
Kary umowne naliczane Spółce za niezgodność parametrów paliwa zastępczego z umownymi, są zaliczane do kosztów uzyskania przychodów, gdyż nie wynikają z wad dostarczonych towarów, lecz z działalności zagospodarowania odpadów, i mają związek przyczynowy z generowaniem przychodów (art. 15 ust. 1 ustawy o CIT).
Jednostki samorządu terytorialnego, realizując zadania wynikające z prawa publicznego, nie nabywają prawa do odliczenia VAT naliczonego na podstawie faktur dokumentujących wydatki związane z działaniami nieobjętymi VAT, jako że nie działają w charakterze podatnika VAT.
Gmina realizująca zadania ze sfery zadań publicznych, wykorzystująca infrastrukturę wyłącznie do czynności niepodlegających opodatkowaniu VAT, nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego ani jego zwrotu. Takie podmioty są wyłączone spod działania przepisów o podatnikach VAT według art. 15 ust. 6 ustawy o VAT.