W przypadku umowy leasingu finansowego samochodu osobowego wykorzystywanego do celów mieszanych, opłaty wprowadzone w wartość początkową środka trwałego i rozliczane przez odpisy amortyzacyjne, nie wpływają na dochód opodatkowany ryczałtem od dochodów spółek; opodatkowanie obejmuje 50% odpisów amortyzacyjnych oraz części odsetkowej rat leasingowych.

Przeksięgowanie kosztów z konta „usługi w toku” na inne konto, które nie odzwierciedla ich jako kosztów sprzedanych usług w zysku netto roku podatkowego, skutkuje powstaniem dochodu do opodatkowania z tytułu nieujawnionych operacji gospodarczych pod estońskim CIT.

Pożyczka udzielona w czasie obowiązywania estońskiego CIT, choć finansowana z wcześniejszych zysków, stanowi ukryty zysk dla celów opodatkowania ryczałtem. Natomiast zwrot kapitału pożyczki i zapłaconych odsetek nie generują takiego dochodu.

Podpisanie sprawozdania finansowego po upływie przedłużonego terminu nie stanowi przeszkody do opodatkowania ryczałtem, jeśli rok podatkowy jest tożsamy z rokiem kalendarzowym.

Zakup obligacji Skarbu Państwa przez spółkę z o.o. opodatkowaną estońskim CIT nie skutkuje powstaniem dochodu do opodatkowania ryczałtem oraz nie wyłącza spółki z estońskiego CIT, pod warunkiem, że przychody pasywne z tego tytułu nie przekroczą 50% przychodów z działalności.

Opóźnione złożenie sprawozdania finansowego do KRS i jego nieterminowe podpisanie przez kierownika jednostki nie wpływają na skuteczność wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek od początku nowego roku podatkowego, o ile inne warunki formalne zostały spełnione.

Podpisanie sprawozdania finansowego w terminie jest warunkiem sine qua non skutecznego wyboru ryczałtu od dochodów spółek, zgodnie z art. 28j ust. 5 ustawy o CIT; jego późniejsze dokonanie uniemożliwia zmianę formy opodatkowania w trakcie roku podatkowego.

Uzyskiwanie przychodów z tytułu umowy dzierżawy, stanowiących dominującą część przychodów, nie wyłącza możliwości korzystania z opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, pod warunkiem spełnienia wymagań art. 28j ust. 1 ustawy o CIT.

Transakcja pożyczki udzielonej przez podatnika jednostce powiązanej stanowi dochód z ukrytych zysków w rozumieniu art. 28m ust. 3 pkt 1 ustawy o CIT, który podlega opodatkowaniu CIT estońskim. Powiązania osobowe i kapitałowe, a także relacje rodzinne, determinują uznanie spółek za jednostki powiązane.

Brak sporządzenia i publikacji sprawozdań finansowych za lata poprzedzające wybór estońskiego CIT nie stanowi przeszkody dla skutecznego wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek od początku nowego roku podatkowego, jeśli nie są spełnione ujemne przesłanki z art. 28j ust. 1 pkt 2-7 ustawy o CIT.

Podatnik, który poniósł stratę przed zmianą opodatkowania na ryczałt, ma prawo odliczyć ją od dochodu sprzed dwóch lat przed rozpoczęciem stosowania ryczałtu, pod warunkiem utrzymania opodatkowania ryczałtem przez cztery lata.

Podatnik opodatkowany ryczałtem od dochodów spółek, który uprzednio skorzystał z ulgi na złe długi, nie ma obowiązku zwiększenia podstawy opodatkowania CIT o należność uregulowaną na podstawie ugody, w okresie opodatkowania ryczałtem.

Podatnik będący spółką dzieloną oraz spółka przejmująca, które są opodatkowane estońskim CIT, nie tracą prawa do opodatkowania w tej formie w przypadku dokonania podziału przez wydzielenie, jeśli oba podmioty pozostają w ramach reżimu estońskiego CIT, zgodnie z art. 28l ust. 1 pkt 4 lit. d ustawy o CIT.

Posiadanie przez spółkę udziałów członkowskich w spółdzielni energetycznej nie wyłącza możliwości korzystania z opodatkowania w formie estońskiego CIT, gdyż spółdzielnia nie jest podmiotem wskazanym w zamkniętym katalogu art. 28j ust. 1 pkt 5 ustawy o CIT.

Przystąpienie do umowy konsorcjum oraz poniesienie wydatków w jej ramach przez podatnika ryczałtu od dochodów spółek nie skutkuje utratą prawa do opodatkowania ryczałtem, gdyż konsorcjum nie stanowi podmiotu ani stosunku prawnego określonego w art. 28l i 28j ustawy o CIT.

Przychody z realizacji prawa z instrumentów finansowych obejmują całość kwoty otrzymanej przy wykupie, łącznie z wartością nominalną, a nie tylko dyskonto; takie przychody wliczają się w struktury przychodów określone w art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. f ustawy o CIT.

Spółka, która otrzymuje wkład niepieniężny w postaci przedsiębiorstwa lub jego części, nie może wybrać estońskiego CIT w roku wniesienia wkładu oraz roku następującym, lecz co najmniej przez 24 miesiące od jego wniesienia. Po terminie tym możliwe jest ponowne zgłoszenie do estońskiego CIT, o ile spełnione są wszystkie inne ustawowe warunki.

W przypadku podziału przez wydzielenie, jeżeli dzielona spółka zamknie księgi rachunkowe, sporządzi sprawozdanie finansowe i dokona wymaganych rozliczeń, spółka przejmująca może kontynuować opodatkowanie ryczałtem na podstawie art. 28l ust. 1 pkt 4 lit. c ustawy o CIT.

Wydatki poniesione przez Spółkę na rzecz zagranicznego kontrahenta z tytułu zapłaty roszczeń nie są wydatkami niezwiązanymi z działalnością gospodarczą i tym samym nie podlegają opodatkowaniu ryczałtem, zgodnie z art. 28m ust. 1 pkt 3 ustawy o CIT.

Zwrot nieoprocentowanych dopłat przez spółkę dokonywany w nominalnej wysokości nie stanowi ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ust. 3 pkt 4 ustawy o CIT i nie podlega opodatkowaniu estońskim CIT.

Zakończenie opodatkowania ryczałtem nie nakłada obowiązku zapłaty podatku od niewypłaconych zysków netto uzyskanych w tym okresie, o ile zyski te nie zostały rozdysponowane. Obowiązek podatkowy powstaje przy faktycznej dystrybucji dochodu lub jego rozdysponowaniu w formie innej niż wewnętrzna alokacja w spółce.

W celu określenia limitu przychodów pasywnych na mocy art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. f ustawy o CIT, należy wliczać całą kwotą otrzymaną z realizacji praw z instrumentów finansowych, w tym pełną kwotę wykupu obligacji, a nie jedynie kwoty odsetek i dyskonta.

Podział zysku netto wypracowanego w okresie opodatkowania ryczałtem podlega opodatkowaniu ryczałtem wyłącznie w części przeznaczonej do wypłaty wspólnikom, bez możliwości kompensacji z stratą powstałą przed wejściem w Estoński CIT.