Świadczenie przez Gminę odpłatnych usług wstępu do obiektu oznaczonego jako 'A' oraz usług wynajmu obiektów 'B' i 'C', w ramach umów cywilnoprawnych, stanowi działalność gospodarczą podlegającą opodatkowaniu VAT, niekorzystającą ze zwolnienia. Gminie przysługuje prawo do pełnego odliczenia podatku VAT naliczonego w związku z inwestycją.

Jednostka samorządu terytorialnego, wykonując czynności opodatkowane na podstawie umów cywilnoprawnych, może obniżyć kwotę podatku należnego o kwotę podatku naliczonego z tytułu zakupów wykorzystywanych wyłącznie do tych czynności, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.

Muzeum jest uprawnione do pełnego odliczenia podatku VAT od wydatków powierzchniowo przypisanych działalności opodatkowanej VAT oraz do częściowego, proporcjonalnego odliczenia VAT od powierzchni wykorzystywanych mieszanie, na zasadach określonych w art. 90 ustawy o VAT, bez zastosowania prewspółczynnika.

Gmina refakturując media powinna stosować stawki VAT zgodne z fakturami dostawców mediów. Przysługuje jej zatem prawo do pełnego odliczenia VAT naliczonego, gdyż dokonuje odsprzedaży według wyjściowych stawek VAT, a zakupy te wykorzystywane są w działalności podlegającej opodatkowaniu VAT.