Dodatnie różnice kursowe od zobowiązań Spółki, których nie można przypisać do Działalności strefowej, stanowią przychód pozastrefowy opodatkowany zgodnie z ogólnymi zasadami CIT, natomiast ujemne różnice kursowe traktowane są jako koszty wspólne, alokowane według klucza przychodowego w myśl art. 15 ust. 2 ustawy CIT.

Wynagrodzenie z tytułu transferu projektów poza teren SSE stanowi przychód pozastrefowy, zgodnie z art. 7 CIT, a koszty uzyskania przychodów obejmują jedynie koszty związane bezpośrednio z przychodami pozastrefowymi, nie uwzględniając m.in. kosztów pozbawionych związku z uzyskaniem przychodu, zgodnie z art. 15 ust. 1 CIT.

Wynagrodzenie uzyskane z tytułu transferu projektów "Exit fee" nie jest przychodem strefowym zwolnionym z opodatkowania, lecz podlega opodatkowaniu jako przychód pozastrefowy. Koszty związane z przeniesieniem projektów mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów tylko wtedy, gdy spełniają warunki określone w art. 15 ustawy o CIT, z wyłączeniem kosztów roszczeń pracowniczych i zerwania kontraktów

Odszkodowanie otrzymane w związku z uszkodzeniem i utraconymi korzyściami na terenie SSE nie stanowi przychodu zwolnionego z podatku zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, gdyż nie bezpośrednio wynika z działalności objętej zezwoleniem strefowym, lecz z pokrywania szkód przez ubezpieczyciela.

Działalność Spółki w zakresie projektów badawczo-rozwojowych kwalifikuje się jako działalność badawczo-rozwojowa w rozumieniu art. 4a pkt 26 ustawy o CIT, co uprawnia Spółkę do korzystania z ulgi B+R poprzez odliczenie kosztów wynagrodzeń w proporcji przypisanej do działalności B+R od podstawy opodatkowania.

Dofinansowanie otrzymane na podstawie art. 15g i 15gg Ustawy o COVID-19, w zakresie wynagrodzeń pracowników związanych z działalnością strefową, stanowi przychód zwolniony z podatku dochodowego. Wpływy z działalności pozastrefowej stanowią przychód podlegający opodatkowaniu podatkiem dochodowym na zasadach ogólnych.

Otrzymane dofinansowanie na podstawie art. 15g i 15gg Ustawy o Covid-19, w części dotyczącej działalności strefowej, stanowi przychód związany z działalnością na terenie SSE i jest zwolnione, zaś uznanie takich przychodów i kosztów wymaga odpowiedniej alokacji opartej na proporcji przychodowej.

Limit kosztów świadczeń niematerialnych, o którym mowa w art. 15e ust. 1 ustawy o CIT, należy wyliczać bez uwzględnienia przychodów oraz kosztów uzyskania przychodów ze źródeł wolnych od opodatkowania CIT. Koszty związane z działalnością zwolnioną winny być pominięte w kalkulacji podatkowej EBITDA na potrzeby ustalania tego limitu.

Wynagrodzenie otrzymane za zobowiązanie się do wyłącznego zakupu komponentów od kontrahenta nie stanowi przychodu zwolnionego z opodatkowania na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, jako że nie jest bezpośrednim następstwem działalności gospodarczej prowadzonej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej zgodnie z zezwoleniem.

Usługi wsparcia sprzedaży nabywane od podmiotów powiązanych od 1 stycznia 2019 r. podlegają limitowaniu w zaliczaniu do kosztów uzyskania przychodów na mocy art. 15e ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych jako usługi podobne do doradczych. Ograniczenia nie obejmują kosztów uwzględnianych w działaniach strefowych wolnych od podatku.

Dochody uzyskane przez spółkę z działalności w Specjalnej Strefie Ekonomicznej do 31 grudnia 2026 r. korzystają ze zwolnienia podatkowego na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, niezależnie od złożenia deklaracji podatkowej w 2027 r.

Przychody i koszty uzyskania związane ze sprzedażą oprzyrządowania, służącego produkcji wyrobów zwolnionych, stanowią element kalkulacyjny zwolnionej działalności gospodarczej na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 i 34a ustawy o CIT, o ile działalność ta jest bezpośrednio powiązana z działalnością prowadzoną na terenie strefy w oparciu o uzyskane zezwolenia/ decyzje.

Koszty finansowania dłużnego, wyłączone z kosztów uzyskania przychodów na mocy art. 15c ust. 1 CIT, mogą być rozliczane w kolejnych pięciu latach według zasady FIFO. Dla kosztów obejmujących działalność opodatkowaną i zwolnioną stosuje się proporcję alokacji z roku ich powstania, nie bieżący klucz alokacji.

Ograniczenia wynikające z art. 15e ustawy o CIT nie mają zastosowania do kosztów związanych z działalnością zwolnioną z opodatkowania, a alokacja kosztów powinna być dokonana proporcjonalnie wg klucza określonego w art. 15 ust. 2 i 2a dla części działalności opodatkowanej. Potwierdza to wykładnia językowa i systemowa ustawy.

Dla uznania wydatków inwestycyjnych za koszty kwalifikowane, momentem decydującym jest chwila ich rzeczywistej zapłaty (metoda kasowa), a skorzystanie ze zwolnienia podatkowego jest możliwe dopiero po uzyskaniu dochodów z nowej inwestycji, a nie od samego rozpoczęcia realizacji inwestycji.

Koszty uzyskania przychodu ponoszone przez spółkę w związku z zamkniętą dywizją w specjalnej strefie ekonomicznej, po formalnym wygaśnięciu zezwoleń, mogą być kwalifikowane jako koszty działalności opodatkowanej, z wyłączeniem amortyzacji budynku i strat niezamortyzowanych środków trwałych, które utraciły przydatność gospodarczą. Wygaśnięcie zezwolenia jest jednoznaczne z momentem złożenia wniosku

Korekty rentowności dokonywane w ramach transakcji kontrolowanych, które związane są bezpośrednio z działalnością gospodarczą określoną w decyzji o wsparciu, mogą być uznane za wpływające na wartość dochodu zwolnionego z podatku dochodowego od osób prawnych na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy CIT.

Koszt nabycia kontenerów poniesiony przez spółkę komandytową w 2020 r. kwalifikuje się do objęcia wsparciem jako koszt kwalifikowany w rozumieniu § 8 ust. 1 Rozporządzenia WNI, co stanowi podstawę do korzystania z zwolnienia podatkowego, zgodnie z przepisami obowiązującymi przed uzyskaniem przez spółkę statusu podatnika CIT, tj. do 30 kwietnia 2021 r.

Nakłady związane z zakupem i montażem instalacji fotowoltaicznej, które nie zostały określone w dokumentacji PSI jako część nowej inwestycji, nie mogą być traktowane jako koszty kwalifikowane do objęcia pomocą publiczną w formie zwolnienia podatkowego, gdyż nie przyczyniają się do zwiększenia zdolności produkcyjnych ani do dywersyfikacji produkcji.

Wydatki z tytułu usług świadczonych przez podmiot powiązany mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów bez zastosowania ograniczeń, o których mowa w art. 15e ust. 1 ustawy o CIT, jeżeli usługi te nie są wymienione w ustawie oraz są bezpośrednio związane z przychodami podatnika.

Koszty materiału złomowanego, związane z przychodami z odpadu produkcyjnego, powinny być przypisane do działalności pozastrefowej, co implikuje konieczność korekty zeznań CIT-8. Zwolnieniem podatkowym objęte są tylko dochody z działalności określonej w zezwoleniu SSE.

Podatnik posiada prawo do rozpoczęcia korzystania ze zwolnienia podatkowego od miesiąca poniesienia kosztów kwalifikowanych inwestycji po uzyskaniu decyzji o wsparciu, niezależnie od oddania środków trwałych do używania; jednakże nie może dowolnie decydować o momencie rozpoczęcia korzystania z tego zwolnienia w ramach jego okresu obowiązywania.

Koszty wdrożenia oraz koszty licencji na oprogramowanie, poniesione do momentu przyjęcia oprogramowania do używania, zwiększają wartość początkową wartości niematerialnej i prawnej, podlegającej amortyzacji, oraz mogą być uznane za koszty kwalifikowane Nowej Inwestycji zgodnie z odpowiednimi przepisami ustawy CIT oraz Rozporządzenia.