Koszty poniesione na podstawie faktur za usługi licencyjne, związane z działalnością spółki przekształconej, powinny być zaliczone w całości do kosztów uzyskania przychodów tej spółki z o.o., bez podziału na okresy działalności spółki jawnej i z o.o., zgodnie z zasadą sukcesji prawnej.

W świetle art. 93a § 1 pkt 2 Ordynacji podatkowej przekształcona spółka z o.o. wstępuje we wszelkie prawa i obowiązki podatkowe przekształconej spółki jawnej, co uprawnia ją do zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów wydatków poniesionych przed przekształceniem przez spółkę jawną, nawet jeśli te nie były uznane jako koszty przed tym dniem, pod warunkiem spełnienia odpowiednich przesłanek ustalonych

Zwiększenie udziałów kapitałowych w spółce jawnej, wynikające z wniesienia aportu przez wspólników, nie stanowi darowizny podlegającej opodatkowaniu podatkiem od spadków i darowizn, gdyż operacja ta ma odpłatny i ekwiwalentny charakter, co wyklucza jej kwalifikację jako nieodpłatnego przysporzenia.

Zakupiony przez spółkę jawną grunt, nabyty na potrzeby działalności deweloperskiej, winien być traktowany jako towar w rozumieniu ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych. Wydatki ponoszone w ramach inwestycji deweloperskich mogą być uznawane za koszty uzyskania przychodu, ale jedynie pod warunkiem przestrzegania zasad zawartych w rozporządzeniu w sprawie prowadzenia podatkowej księgi przychodów

Wniesienie aportem nieruchomości do spółki jawnej przez osobę nie będącą czynnym podatnikiem VAT, nabywającą działkę przy użyciu kredytu inwestycyjnego, stanowi czynność opodatkowaną podatkiem od towarów i usług. Podstawą opodatkowania jest wartość wkładu ustalona w umowie spółki jawnej, pomniejszona o kwotę VAT, a nie wartość rynkowa nieruchomości.

Nieodpłatne przekazanie składników majątkowych ze spółki jawnej do majątku prywatnego wspólników, przeznaczonych następnie na indywidualne działalności gospodarcze, stanowi nieodpłatne świadczenie usług podlegające VAT jako odpłatne świadczenie zgodnie z art. 8 ust. 2 pkt 2 ustawy o VAT.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę jawną po jej przekształceniu w spółkę z o.o. stanowi przychód z tytułu udziału w zyskach osób prawnych podlegający opodatkowaniu, jeżeli niepoprzedzona była uchwałą o wypłacie przed przekształceniem. Kosztami uzyskania przychodów ze zbycia udziałów w przekształconej spółce są wydatki na nabycie udziałów oraz proporcjonalna część zatrzymanych zysków.

Przekazanie nieruchomości z majątku spółki jawnej do majątku prywatnego wspólników może stanowić odpłatną dostawę towarów podlegającą opodatkowaniu VAT, jeśli spółce przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego przy nabyciu nieruchomości.

Spółka komandytowa, jako płatnik podatku dochodowego od osób fizycznych, nie ma obowiązku pobierania zaliczek na podatek PIT od zaliczek na zysk wypłacanych komplementariuszowi, zanim zostanie znana wysokość podatku należnego CIT, co jest zgodne z art. 30a i 41 ustawy o PIT oraz orzecznictwem.

Dochody z tytułu objęcia udziałów lub akcji w wyniku połączenia spółek, uzyskane przez wspólników spółek jawnych, stanowią przychody z kapitałów pieniężnych, opodatkowane zgodnie z art. 24 ust. 5 pkt 6 i 7a ustawy o PIT. Przy spełnieniu ustawowych warunków możliwe jest odroczenie opodatkowania do momentu zbycia aktywów.

Przekazanie prawa użytkowania wieczystego nieruchomości oraz własności budynków wspólnikowi w zamian za obniżenie udziału kapitałowego stanowi odpłatną dostawę towarów podlegającą VAT, jednak korzysta ze zwolnienia z podatku, gdyż spełnia warunki określone w art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT, a ponadto nie rodzi obowiązku korekty podatku VAT naliczonego.

Zmiana sposobu określania i proporcji udziału w zyskach i stratach spółki jawnej nie powoduje powstania opodatkowanego przychodu ani konieczności korekty zaliczek na podatek dochodowy, gdyż modyfikacja umowy sama w sobie nie stanowi źródła przychodu podatkowego.

Wycofanie ze spółki jawnej prawa użytkowania wieczystego gruntu i budynków do majątku prywatnego wspólników stanowi dostawę towarów podlegającą podatkowi VAT, zgodnie z art. 7 ust. 2 ustawy o VAT, generującą obowiązek korekty VAT od uprzednio odliczonych wydatków na ulepszenia.

Przekształcenie spółki z o.o. w jawną jest neutralne podatkowo, gdy brak niepodzielonych zysków. Likwidacja spółki jawnej nie powoduje przychodu podatkowego z samego wydania składników majątku, chyba że składniki te zostaną odpłatnie zbyte przed upływem określonego terminu. Spółka jawna, po przekształceniu, zobowiązana jest do prowadzenia ksiąg rachunkowych od momentu rejestracji.

Przychody z odsetek od weksli kwalifikowane są jako przychody z zysków kapitałowych, podczas gdy odsetki od pożyczek, niebędące partycypacyjnymi, zaliczane są do przychodów z innych źródeł. Koszty związane z uzyskiwaniem takich przychodów wymagają stosowania proporcji podziału zgodnie z ustawą CIT.

Koszty uzyskania przychodu z tytułu zbycia praw i obowiązków w spółce jawnej powinny być określane jako poniesione przy objęciu praw w spółce z o.o., kontynuując zasadę kosztu historycznego.

Przekształcenie spółki jawnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością w ramach sukcesji uniwersalnej, zgodnie z przepisami kodeksu spółek handlowych, nie powoduje powstania przychodu podatkowego po stronie wspólników na gruncie ustawy o PIT. Ponadto, wypłata zysków wypracowanych przed przekształceniem, które zostały wcześniej opodatkowane, nie stanowi ponownego źródła przychodu.

Wypłaty zysków spółki jawnej dokonane przez spółkę z o.o. stanowią realizację zobowiązania spółki jawnej i nie są przychodem z udziału w zyskach osób prawnych, wobec czego spółka z o.o. nie pełni funkcji płatnika podatku dochodowego od tych wypłat.

Kosztem uzyskania przychodów z tytułu odpłatnego zbycia udziałów w spółce przekształconej (Sp. z o.o.), na podstawie przekształcenia spółki jawnej, jest wartość rynkowa majątku tej spółki jawnej na dzień przekształcenia, a nie sama wartość nominalna zbywanych udziałów.

Wycofanie nieruchomości ze spółki jawnej do majątku prywatnego wspólnika jest czynnością opodatkowaną VAT, co skutkuje obowiązkiem korekty podatku naliczonego, natomiast wniesienie nieruchomości do fundacji rodzinnej przez wspólnika pozostaje neutralne podatkowo dla spółki jawnej.

Sprzedaż przedsiębiorstwa nie wpływa na odliczenie VAT już naliczonego przez zbywcę; obowiązek korekty spoczywa na nabywcy (art. 91 ust. 9 VAT). VAT naliczony z tytułu obsługi prawnej sprzedaży można odliczyć ze względu na ich związek z działalnością opodatkowaną.

Przychody uzyskiwane przez wspólników spółki jawnej z udziału w produkcji i sprzedaży nowego suplementu medycznego mogą być opodatkowane ryczałtem 5,5%, zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 6 lit. a) ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym od niektórych przychodów osiąganych przez osoby fizyczne.

Koszt uzyskania przychodu z tytułu zbycia składnika majątku obejmuje wartość początkową, pomniejszoną o odpisy amortyzacyjne, oraz wartość poniesionych wydatków na nabycie, niezaliczonych wcześniej do kosztów przychodu, co nie uprawnia podatnika do pomniejszenia przychodu o cenę nabycia z 1997 r.