Rekompensaty z Funduszu Rekompensat Pośrednich Kosztów Emisji nie stanowią dotacji zwolnionych od opodatkowania na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 47 ustawy CIT, ponieważ są one klasyfikowane jako przychody podlegające opodatkowaniu z uwagi na ich charakter rekompensacyjny i brak bezpośredniego pochodzenia ze środków budżetu państwa.

W świetle umowy powierniczej zawartej z Wykonawcą, Gmina nie wykonuje czynności opodatkowanych podatkiem VAT, albowiem pozyskanie i zbycie praw majątkowych wynikających z certyfikatów efektywności energetycznej dokonane przez Wykonawcę nie stanowi odpłatnego świadczenia usług przez Gminę.

Brak obowiązku rozliczenia podatku należnego od otrzymanych przez Gminę środków pieniężnych uzyskanych ze sprzedaży białych certyfikatów oraz brak obowiązku wystawienia faktury VAT na rzecz Spółki.