Brak faktury końcowej oraz korekt faktur zaliczkowych, spowodowany niewykonaniem części zobowiązania i brakiem współdziałania kontrahenta, nie wyłącza zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów wartości netto świadczenia faktycznie wykonanego, jeżeli jego poniesienie, zakres i związek z działalnością są wykazane innymi wiarygodnymi dowodami. Kosztem jest również należycie udokumentowane wynagrodzenie

Faktura wystawiana po wykonaniu usługi, gdy uprzednia faktura zaliczkowa dokumentuje tylko część zapłaty, stanowi fakturę rozliczającą w rozumieniu art. 106f ust. 3 ustawy o VAT. Musi ona wykazywać wartości i podatek pomniejszone o rozliczone zaliczki oraz zawierać numery identyfikujące faktury zaliczkowe w KSeF; niedopuszczalne jest rozliczenie zaliczki wyłącznie w sekcji technicznej przy wykazaniu

Obowiązek zamieszczenia na fakturze adnotacji „mechanizm podzielonej płatności” powstaje wyłącznie wtedy, gdy kwota należności ogółem wykazana na tej konkretnej fakturze przekracza 15 000 zł, a faktura dotyczy czynności z załącznika nr 15 wykonanej na rzecz podatnika. Wartość całego zamówienia lub umowy pozostaje bez znaczenia; oznaczenia nie wymaga również zerowa faktura rozliczeniowa.

Dla ustalenia roku odliczenia w uldze termomodernizacyjnej zaliczka zapłacona i udokumentowana fakturą zaliczkową nie stanowi samodzielnie wydatku poniesionego w roku jej zapłaty, jeżeli dostawa lub usługa dotycząca przedsięwzięcia nie zostały jeszcze wykonane. Jeżeli inwestycję zakończono w następnym roku i wystawiono fakturę końcową, odliczenia całości wydatków dokonuje się za rok zakończenia inwestycji

Faktura zaliczkowa zawierająca dane pozwalające zidentyfikować dostawę wyrobów węglowych może stanowić podstawę sporządzenia e-DD dla każdej dostawy wykonanej na jej podstawie. Późniejsza korekta lub faktura rozliczeniowa nie wymaga dodatkowego e-DD, jeżeli nie zwiększa ilości faktycznie dostarczonego węgla; w przypadku zwiększenia tej ilości zwolnienie akcyzowe nadwyżki jest uwarunkowane sporządzeniem

W uldze termomodernizacyjnej odliczeniu w zeznaniu za rok podatkowy podlegają również wydatki stanowiące zaliczki, udokumentowane fakturami zaliczkowymi, jeżeli dotyczą kwalifikowanego przedsięwzięcia i zostały faktycznie poniesione. Ustawa PIT nie uzależnia prawa ani momentu odliczenia od zakończenia całej inwestycji, dostawy urządzenia lub wystawienia faktury końcowej, lecz od daty poniesienia wydatku

Jeżeli lokal należący do majątku wspólnego małżonków został nabyty i oddany w najem na podstawie umów zawartych przez oboje małżonków, każdy z nich jest odrębnym podatnikiem VAT w zakresie własnej części świadczenia; jeden małżonek nie może, nawet za zgodą drugiego, samodzielnie rozliczać całego podatku należnego ani odliczyć całego podatku naliczonego. Brak NIP nabywcy na fakturze nie wyłącza odliczenia

Wpłaty zaliczkowe, dotyczące realizacji indywidualnych zamówień, które stają się bezzwrotne 24 godziny po przyjęciu zamówienia, stanowią przychód podatkowy w momencie ich definitywnego wpłynięcia na rzecz spółki, zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 1 ustawy o CIT.

Brak numeru NIP na fakturach zaliczkowych i końcowej, przy zakupie lokalu używanego do czynności opodatkowanych, nie stanowi przeszkody do odliczenia podatku VAT naliczonego, jeżeli faktury te odzwierciedlają rzeczywiste zdarzenia gospodarcze i innych warunków ustawowych. (art. 86 ust. 1 ustawy o podatku od towarów i usług)

Koszty uzyskania przychodów powiązane z przychodami są potrącalne w roku ich uzyskania, a zaliczki na zakup towarów nie stanowią kosztu podatkowego przed ich rozliczeniem fakturą końcową. Rozpoznanie przychodu i przypisanych kosztów musi odzwierciedlać rzeczywisty i definitywny wpływ na majątek podatnika oraz zgodność z regułą współmierności przychodów i kosztów.

W przypadku usług turystyki opodatkowanych procedurą VAT marża, powstanie obowiązku podatkowego z tytułu zaliczek na te usługi następuje z chwilą otrzymania zaliczki, niezależnie od możliwości ustalenia wartości marży, a wstępne szacowanie marży należy przeprowadzić w oparciu o dostępne dane.

Wydatek na remont środka trwałego może zostać zaliczony do kosztów uzyskania przychodów, gdy jest definitywnie poniesiony i odpowiednio udokumentowany fakturą końcową. Koszty pośrednie, uwzględnione w księgach rachunkowych na podstawie otrzymanej faktury końcowej, są potrącalne w dacie ich poniesienia.

Podatnik może skorzystać z ulgi termomodernizacyjnej od wydatków udokumentowanych fakturami końcowymi, z zastrzeżeniem, że faktury zaliczkowe nie stanowią podstawy do takich odliczeń.

Faktury zaliczkowe wystawione przed otrzymaniem zapłaty, mimo wystawienia niezgodnego z art. 106i ust. 7 VAT, nie są fakturami "pustymi" w rozumieniu art. 108 ust. 1 ustawy o VAT, jeśli dokumentują rzeczywiste transakcje prowadzące do powstania obowiązku podatkowego.

Odliczenie podatku VAT nie jest możliwe w sytuacji braku faktur, gdyż dokumenty takie jak umowa, protokół odbioru czy kosztorys nie stanowią faktury zgodnie z art. 2 pkt 22 i art. 106b ustawy o VAT.

Do odliczenia podatku naliczonego konieczne jest posiadanie faktury końcowej, dokumentującej transakcję zgodnie z art. 86 ustawy o VAT, a brak takiej faktury wyklucza możliwość odliczenia, pomimo posiadania innych dokumentów kontraktowych, gdyż nie spełniają one warunków formalnych wymaganych przez przepisy VAT.

Wystawienie faktury korygującej do zaliczki, której wartość nie jest zwracana klientowi, lecz kompensowana z fakturą całościową na zakup finansowany leasingiem, nie jest zgodne z ustawą o VAT. Nie zachodzą przesłanki pozwalające na wystawienie takiej faktury korygującej.

Prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego, wynikającego z faktur wystawionych poza KSeF, przysługuje w momencie ich faktycznego otrzymania, pod warunkiem, że spełnione są pozostałe warunki uprawniające do tego prawa, zgodnie z art. 86 ustawy o VAT.

Mechanizm podzielonej płatności jest obligatoryjny dla transakcji przekraczających 15 000 zł, dokumentowanych fakturą obejmującą towary z załącznika nr 15 do ustawy o VAT, niezależnie od formy płatności i rodzaju faktury (jednostkowa bądź zbiorcza).

Wpłat na zamknięte rachunki powiernicze nie można uznać za otrzymane środki na gruncie art. 19a ustawy VAT; nie stanowią one ani zaliczki, ani zapłaty, chyba że zostaną uwolnione na rachunek dewelopera. Faktury zaliczkowe wystawione przedwcześnie nie są puste i nie wymagają korekty w zakresie VAT, o ile odzwierciedlają rzeczywiste transakcje.