Dzierżawa infrastruktury przez Związek stanowi odpłatne świadczenie usług opodatkowane VAT; Związkowi przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego od inwestycji, częściowo po rejestracji wstecznej, lecz nie od wydatków związanych z dojściami ogólnodostępnymi, nieprzeznaczonych do dzierżawy komercyjnej.
Pre-współczynnik metrażowy, jako proporcja liczby metrów sześciennych dostarczonej wody do odbiorców zewnętrznych do ogólnej ilości dostarczonej wody, stanowi właściwą metodę określenia proporcji odliczenia VAT przez jednostki samorządu terytorialnego, reprezentując rzeczywiste wykorzystanie infrastruktury wodociągowej do działalności opodatkowanej.
Gmina ma prawo do odliczenia VAT naliczonego od nieruchomości przy użyciu pre-współczynnika powierzchniowego, jako bardziej reprezentatywnego, zgodnego ze specyfiką działalności, w przełożeniu na powierzchniowe wykorzystanie do celów komercyjnych i innych.
Związek międzygminny, obciążając składkami na transport gminy członkowskie, nie musi wykazywać tych transakcji fakturami VAT, jako że wzajemne rozliczenia nie stanowią odpłatnych usług podlegających opodatkowaniu VAT.
Gminie przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego z tytułu wydatków na infrastrukturę wodno-kanalizacyjną, przy zastosowaniu prewspółczynnika opartego na rzeczywistych pomiarach dostaw wody i odprowadzania ścieków, oraz dofinansowanie z Polskiego Ładu nie stanowi przeszkody w tym zakresie.
Dłużnik będący jednostką samorządu terytorialnego, której dochody podlegają zwolnieniu podatkowemu, nie spełnia warunku opodatkowania transakcji, co wyklucza możliwość zastosowania ulgi na złe długi przez wierzyciela, zgodnie z art. 18f ust. 10 pkt 3 ustawy o CIT.
Gmina, dostarczając wodę i odprowadzając ścieki, może stosować alternatywną metodę wyliczania proporcji VAT opartą na wielkości świadczeń, jeżeli metoda ta najlepiej odzwierciedla specyfikę działalności, zapewniając prawidłowe przyporządkowanie podatku naliczonego. Organ podatkowy potwierdził jej prawo do takich rozliczeń.
Odpłatne świadczenie usług przez Gminę w zakresie dostarczania wody i odprowadzania ścieków podlega opodatkowaniu VAT. Pre-współczynnik obrotowy jest odpowiedni dla infrastruktury kanalizacyjnej, ale nie dla wodociągowej, gdzie zastosowanie wymaga metody z rozporządzenia. Tym samym, w odniesieniu do wydatków inwestycyjnych związanych z infrastrukturą, prawo do odliczenia ma zastosowanie tylko w zakresie
Zwolniona z VAT jest dostawa terenów niezabudowanych innych niż budowlane, które nie są objęte miejscowym planem zagospodarowania przestrzennego ani decyzją o warunkach zabudowy, a część działki objęta planem jako teren budowlany podlega opodatkowaniu.
Udział gminy w przychodach z ponownego zagospodarowania odpadów komunalnych stanowi odpłatne świadczenie usług podlegające opodatkowaniu VAT. Gminie nie przysługuje prawo do odliczenia VAT od wydatków na system gospodarowania odpadami, gdyż wydatki te nie mogą być jednoznacznie związane z działalnością opodatkowaną.
Jednostka samorządu terytorialnego ma prawo odliczenia VAT od inwestycji proporcjonalnie do jej wykorzystania dla czynności opodatkowanych, uwzględniając prewskaźnik określony w art. 86 ust. 2a ustawy o VAT.
Czynności realizowane przez Gminę w ramach projektu budowy przydomowych oczyszczalni ścieków nie stanowią odpłatnej dostawy towarów ani świadczenia usług podlegających opodatkowaniu VAT oraz nie będą wykorzystywane do czynności opodatkowanych; w konsekwencji Gmina nie występuje w charakterze podatnika VAT, a wpłaty i dotacje nie stanowią podstawy opodatkowania VAT.
Błędne lub niepełne dane jednostki organizacyjnej JST wykazywanej jako podmiot trzeci na fakturze w KSeF winny być skorygowane poprzez fakturę korygującą zmieniającą te dane, bez potrzeby wystawiania faktury do zera, jeśli dane nabywcy są prawidłowe.
Przekazanie nieruchomości na rzecz Skarbu Państwa w zamian za odszkodowanie korzysta ze zwolnienia z VAT, jeśli od pierwszego zasiedlenia upłynęło więcej niż dwa lata. Obowiązek podatkowy powstaje z chwilą otrzymania odszkodowania.
Wydatki poniesione jako wkład własny na przedsięwzięcia termomodernizacyjne, takie jak instalacja fotowoltaiczna, mogą podlegać odliczeniu od dochodu w ramach ulgi termomodernizacyjnej, o ile nie zostały zrefinansowane i są udokumentowane fakturami VAT, a przedsięwzięcie zakończy się w ciągu 3 lat.
Równowartość odpisów amortyzacyjnych, stan środków obrotowych na początek okresu sprawozdawczego oraz nadwyżka środków obrotowych pozostawiona w zakładzie budżetowym nie stanowią przychodów wykonanych zakładu budżetowego w rozumieniu rozporządzenia w sprawie pre-współczynnika i nie powinny być uwzględniane w jego kalkulacji, tym samym nie wpływają na wysokość odliczanego podatku naliczonego przez Gminę
Wpłaty mieszkańców na rzecz gminy, związane z budową przydomowych oczyszczalni ścieków, nie stanowią opodatkowanej dostawy towarów ani odpłatnego świadczenia usług na gruncie ustawy o VAT, co wyklucza obowiązek podatkowy i prawo do odliczenia podatku VAT. Gmina nie wykonuje działalności gospodarczej w rozumieniu art. 15 ust. 2 ustawy o VAT podczas realizacji tej inwestycji.
Świadczenie odpłatnych usług kanalizacyjnych przez JST na rzecz odbiorców zewnętrznych stanowi działalność gospodarczą opodatkowaną VAT, niekorzystającą ze zwolnień podatkowych. JST nie ma obowiązku naliczania podatku należnego w przypadku wewnętrznego wykorzystania infrastruktury. JST przysługuje prawo do odliczenia części podatku VAT naliczonego metodą proporcjonalną, obliczoną według ilości metrów
Gmina ma prawo do obniżenia kwoty podatku VAT należnego o kwotę podatku naliczonego z wydatków poniesionych na realizację wskazanych inwestycji wodociągowych, stosując prewspółczynnik dla zadań 1 i 2 oraz pełne odliczenie dla zadań 3 i 4, zgodnie z art. 86 ust. 1 oraz ust. 2a ustawy o VAT.
Gminie jako podatnikowi VAT przysługuje prawo do częściowego odliczenia podatku naliczonego z wydatków na infrastrukturę wodno-kanalizacyjną. Odliczenie to winno być oparte na prewspółczynniku uwzględniającym specyfikę dostarczania wody i odprowadzania ścieków, obiektywnie odzwierciedlającym proporcjonalne wykorzystanie do działalności opodatkowanej.
Pobierane opłaty przez Gminę za zajęcie pasa drogowego dróg wewnętrznych nie podlegają opodatkowaniu podatkiem VAT, gdyż dotyczą realizacji zadań publicznych, co wyłącza Gminę z kręgu podatników dla tych czynności. Dokumentacja powinna być prowadzona poprzez noty księgowe, a nie faktury VAT.
Wprowadzanie nadwyżki energii elektrycznej do sieci przez prosumenta będącego jednostką samorządu terytorialnego stanowi odpłatną dostawę towarów podlegającą opodatkowaniu VAT, z obowiązkiem wystawienia faktury i odprowadzenia podatku; prawo do odliczenia VAT zależy od prewspółczynnika, a poniżej 2% odliczenie nie przysługuje. Pozostałe koszty inwestycji nie dają prawa do odliczenia.
Sprzedaż nieruchomości z obecnymi na niej cudzymi budowlami, przez gminę, nie kwalifikuje się do zwolnienia z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 9 ustawy o VAT, mimo klasyfikacji terenu jako niezabudowany w miejscowym planie zagospodarowania, i podlega podstawowej stawce 23% VAT.