Pokrywanie przez pracodawcę kosztów ubezpieczenia KL, NNW i bagażu w ramach podróży zagranicznej stanowi dla pracownika przychód podatkowy, od którego pracodawca jest zobowiązany do poboru zaliczek na podatek dochodowy, zgodnie z art. 12 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym. Natomiast diety i koszty biletów pokrywane przez inne podmioty nie stanowią przychodu ze stosunku pracy.

Należności wypłacane przez instytucję wdrażającą projekt współpracy międzynarodowej podlegają opodatkowaniu zgodnie z miejscem zamieszkania beneficjentów oraz obowiązującymi konwencjami o unikaniu podwójnego opodatkowania, z uwzględnieniem certyfikatów rezydencji i czasu przebywania na terytoriach poszczególnych państw.