Podatnicy wykorzystujący karty paliwowe mogą odliczać VAT naliczony z faktur otrzymanych od wystawców tych kart tylko wtedy, gdy transakcje te można uznać za tzw. transakcje łańcuchowe. Nie zawsze warunek ten jest spełniony, czego skutkiem może być utrata prawa do odliczenia VAT naliczonego z faktur dokumentujących zakupy opłacane kartą paliwową.