Nabycie przez zstępnego udziałów w spółce osobowej, drogą darowizny lub spadku, jest zwolnione z podatku od spadków i darowizn, przy zachowaniu terminowego zgłoszenia właściwemu organowi, zgodnie z art. 4a ustawy.
Przeniesienie własności nieruchomości na rzecz wspólnika występującego ze spółki jawnej, jako forma rozliczenia udziału kapitałowego, skutkuje powstaniem przychodu podatkowego dla pozostałych wspólników, zgodnie z art. 14 ust. 2e ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, przy założeniu, że świadczenie to jest niepieniężne i odpowiada wartości rynkowej nieruchomości.
Rozliczenie udziału kapitałowego wspólnika występującego z spółki jawnej poprzez przeniesienie własności nieruchomości powoduje powstanie przychodu podatkowego u pozostałych wspólników stosownie do art. 14 ust. 2e i 2f ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.
Przekazanie nieodpłatne działek 1, 2 i 3 w ramach majątku spółki do wspólników jest opodatkowane VAT, przy czym działki 1 i 2, jako tereny budowlane, nie korzystają z zwolnienia. Przekazanie działki 3, jako nieruchomości zasiedlonej, jest zwolnione z VAT.
Ryczałtowemu opodatkowaniu przy zbyciu zorganizowanej części przedsiębiorstwa podlegają składniki ruchome majątku według stawki 3%, natomiast wartość firmy winna być opodatkowana stawkami właściwymi dla prowadzonej działalności gospodarczej podatnika.
Koszty poniesione na podstawie faktur za usługi licencyjne, związane z działalnością spółki przekształconej, powinny być zaliczone w całości do kosztów uzyskania przychodów tej spółki z o.o., bez podziału na okresy działalności spółki jawnej i z o.o., zgodnie z zasadą sukcesji prawnej.
Wycofanie nieruchomości ze spółki jawnej na rzecz wspólników podlega opodatkowaniu VAT, jeśli przy nabyciu odliczono podatek. Zwolnienie VAT dotyczy jedynie nieruchomości zabudowanych przy spełnieniu określonych warunków. Nieruchomości niezabudowane, ale będące terenami budowlanymi, są opodatkowane odpowiednią stawką VAT.
Ogół praw i obowiązków w spółce jawnej, jako składnik majątku osobistego według art. 33 pkt 5 Kodeksu rodzinnego i opiekuńczego, przy jego przeniesieniu na inną osobę generuje przychód z praw majątkowych, podlegający opodatkowaniu podatkiem dochodowym jako dochód nie wyłączony wymienionymi przepisami o podziale majątku wspólnego.
Wypłata zysków ("Stare zyski") przez spółkę komandytową, które zostały uprzednio opodatkowane podatkiem dochodowym od osób fizycznych w ramach działalności spółki jawnej, nie podlega ponownemu opodatkowaniu tym podatkiem po przekształceniu spółki w komandytową. W razie możliwej identyfikacji takich zysków, uznaje się je za neutralne podatkowo.
Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę jawną przed jej przekształceniem w prostą spółkę akcyjną, już uprzednio opodatkowanych podatkiem dochodowym od osób fizycznych, nie podlega ponownemu opodatkowaniu PIT w momencie wypłaty. Spółka nie jest zobowiązana do poboru zryczałtowanego podatku jako płatnik.
Zbycie nieruchomości I, III i IV w formie aportu do spółki jawnej stanowi odpłatną dostawę towarów podlegającą VAT, przy czym Nieruchomość III nie korzysta ze zwolnienia, będąc terenem budowlanym. Dla Nieruchomości I i IV zwolnienie przysługuje na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT.
Najem nieruchomości na podstawie umowy, ustalony na warunkach rynkowych, nie prowadzi do powstania dochodu z tytułu ukrytych zysków podlegającego opodatkowaniu ryczałtem zgodnie z art. 28m ustawy o CIT; czynsz ten wynika z uzasadnionych ekonomicznie i organizacyjnie działań potrzebnych do prowadzenia działalności gospodarczej.
Wypłaty zysków wypracowanych przez spółkę jawną przed jej przekształceniem i uprzednio opodatkowanych podatkiem dochodowym od osób fizycznych nie stanowią dochodu podlegającego opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek zgodnie z art. 28m ustawy o CIT, gdyż nie spełniają definicji podzielonego zysku, ukrytych zysków ani innych kategorii dochodów opodatkowanych w omawianym systemie.
W przypadku uregulowania wierzytelności po zaprzestaniu prowadzenia działalności przez wspólnika, podatnik obowiązany jest zwiększyć podstawę obliczenia podatku w zeznaniu za rok, w którym nastąpiło uregulowanie, zgodnie z art. 26i ust. 7 ustawy o PIT, niezależnie od braku prowadzenia działalności w danym roku.
Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę przekształconą, na podstawie uchwały podziału zysków, po przekształceniu w formę spółki kapitałowej, stanowi przychód z tytułu udziału w zyskach osób prawnych zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 4 ustawy o PIT i podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych.
Zwrot nakładów poniesionych przez spółkę jawną w ramach działalności gospodarczej, zaliczanych uprzednio do kosztów uzyskania przychodu, stanowi przychód opodatkowany podatkiem dochodowym od osób fizycznych. Zwrot ten nie kwalifikuje się jako nieodpłatne świadczenie zwolnione z opodatkowania z art. 21 ust. 1 pkt 125 Ustawy PIT, gdyż spółka jawna nie spełnia kryterium przynależności do grupy podatkowej
W świetle art. 93a § 1 pkt 2 Ordynacji podatkowej przekształcona spółka z o.o. wstępuje we wszelkie prawa i obowiązki podatkowe przekształconej spółki jawnej, co uprawnia ją do zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów wydatków poniesionych przed przekształceniem przez spółkę jawną, nawet jeśli te nie były uznane jako koszty przed tym dniem, pod warunkiem spełnienia odpowiednich przesłanek ustalonych
Odpłatne zbycie nieruchomości (lokalu mieszkalnego) wykorzystywanej w działalności gospodarczej spółki jawnej po upływie pięciu lat od jej nabycia nie powoduje uzyskania przychodu podatkowego w rozumieniu art. 10 ust. 1 pkt 8 ustawy o PIT.
Wniesienie nieruchomości jako wkładu do spółki jawnej przez osobę fizyczną, zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 50b ustawy o PIT, nie rodzi obowiązku podatkowego.
Spółka jawna, przekształcona ze spółki komandytowej, z dniem przekształcenia w spółkę jawną i zmiany składu wspólników na wyłącznie osoby fizyczne, przestaje być podatnikiem podatku dochodowego od osób prawnych.
Zwiększenie udziałów kapitałowych w spółce jawnej, wynikające z wniesienia aportu przez wspólników, nie stanowi darowizny podlegającej opodatkowaniu podatkiem od spadków i darowizn, gdyż operacja ta ma odpłatny i ekwiwalentny charakter, co wyklucza jej kwalifikację jako nieodpłatnego przysporzenia.
Spółka jawna, która uzyskała status podatnika CIT, nie traci tego statusu w wyniku zmiany składu wspólników na wyłącznie osoby fizyczne, i pozostaje zobowiązana do składania zeznań CIT-8 do czasu likwidacji lub wykreślenia z rejestru.
Nieodpłatne wycofanie zabudowanych nieruchomości ze spółki jawnej do majątku wspólników, przy nabyciu których odliczono VAT, stanowi czynność podlegającą opodatkowaniu podatkiem VAT jako odpłatna dostawa towarów. Natomiast wycofanie nieruchomości niezabudowanych, bez możliwości wcześniejszego odliczenia VAT, pozostaje neutralne na gruncie podatku VAT.
Przychód ze sprzedaży nieruchomości, użyczonej spółce jawnej, nabytej ponad pięć lat przed zbyciem, nie stanowi przychodu z działalności gospodarczej i nie podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych.