Jeżeli uchwała o podziale zysku, podjęta w roku, w którym podatnik ryczałtu od dochodów spółek nie ma statusu małego podatnika, obejmuje zaliczki na poczet przewidywanej dywidendy wypłacone w poprzednim roku, ostateczny ryczałt od zysku objętego uchwałą ustala się według stawki właściwej w roku podjęcia uchwały; podatek zapłacony od zaliczek podlega jedynie odliczeniu, stosownie do art. 28p ust. 3

Wynagrodzenie wypłacone wspólnikowi z tytułu dobrowolnego umorzenia udziałów stanowi dochód z tytułu ukrytych zysków w rozumieniu art. 28m ust. 1 pkt 2 w zw. z art. 28m ust. 3 pkt 5 ustawy o CIT także wtedy, gdy jest finansowane z kapitału zapasowego utworzonego z zysków wypracowanych przed objęciem spółki ryczałtem lub ze środków uprzednio wniesionych na kapitał zakładowy.

Wypłacone wspólnikom wynagrodzenie za dobrowolne umorzenie udziałów, sfinansowane z czystego zysku spółki, stanowi ukryty zysk w rozumieniu art. 28m ust. 3 pkt 5 ustawy o CIT także wtedy, gdy źródłem finansowania jest zysk wypracowany przed rozpoczęciem opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek. Przepis ten nie uzależnia kwalifikacji świadczenia od okresu wypracowania zysku.

Przy sprzedaży zorganizowanej części przedsiębiorstwa przez podatnika opodatkowanego ryczałtem przychód podlega opodatkowaniu według stawek właściwych dla poszczególnych zbywanych składników. Dodatnia wartość firmy ujawniona w cenie sprzedaży ZCP nie jest po stronie zbywcy prawem majątkowym ani wartością niematerialną i prawną, dlatego nie podlega stawce 10%, lecz stawce właściwej dla działalności

Pożyczka udzielona przez spółkę opodatkowaną ryczałtem od dochodów spółek jej wspólnikowi lub podmiotowi z nim powiązanemu stanowi ukryty zysk w rozumieniu art. 28m ust. 1 pkt 2 i ust. 3 pkt 1 ustawy o CIT, jeżeli wypłata następuje w okresie stosowania ryczałtu, niezależnie od tego, że została sfinansowana środkami pochodzącymi z zysku wypracowanego przed wyborem tej formy opodatkowania.

Rozliczenie ceny nabycia udziału w nieruchomości przez potrącenie ustawowe albo kompensatę umowną wzajemnych, istniejących i zdatnych do umorzenia wierzytelności pieniężnych z tytułu ceny oraz wypłaty kwoty głównej pożyczki jest formą wykonania zobowiązania równoważną zapłacie. Nie powoduje ono po stronie nabywcy trwałego przysporzenia majątkowego, a zatem nie skutkuje powstaniem przychodu podatkowego

Czynsz za najem nieruchomości należącej do wspólników spółki opodatkowanej ryczałtem od dochodów spółek nie stanowi ukrytego zysku, jeżeli najem jest gospodarczo uzasadniony rzeczywistymi potrzebami spółki, został zawarty na warunkach rynkowych, nieruchomość nie pochodzi z majątku spółki ani nie wymaga jej nakładów, a czynsz pozostaje niezależny od prawa wspólników do udziału w zysku i nie jest świadczeniem

Nakłady ponoszone przez spółkę cywilną na nieruchomości użyczone jej przez wspólników, lecz niewniesione do niej jako wkład, nie podlegają rozliczeniu przez amortyzację ani jako inwestycja w obcym środku trwałym, jeżeli dotyczą majątku należącego do tych wspólników. Jeżeli pozostają w pośrednim związku z przychodami działalności, stanowią koszty uzyskania przychodów potrącalne w dacie poniesienia,

Nakłady poniesione przez spółkę cywilną na nieruchomości należące do jej wspólników, niewniesione do spółki jako wkład i użyczone jej do korzystania, nie stanowią ani podstawy amortyzacji środków trwałych spółki, ani inwestycji w obcych środkach trwałych. Jeżeli nakłady służą działalności gospodarczej, są kosztami pośrednimi potrącalnymi w dacie poniesienia, przypisywanymi wspólnikom według udziału

Przekazanie przez spółkę jawną pojazdów ruchomych na rzecz występującego wspólnika w ramach rozliczenia jego udziału kapitałowego stanowi podatkową dostawę towarów podlegającą opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, zgodnie z art. 7 ust. 2 ustawy o VAT, jeżeli przy nabyciu tych towarów przysługiwało prawo do odliczenia podatku VAT.

Ani wypłaty z tytułu dzierżawy działki, ani nakłady na budowę budynku nie będą stanowiły ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy o CIT, ponieważ dokonywane są na rynkowych warunkach, niepowiązanych z prawem do udziału w zysku.

Sprzedaż zabudowanej nieruchomości przez osoby fizyczne, które w okresie posiadania stale i odpłatnie wynajmowały ją nabywcy, stanowi dostawę dokonywaną przez podatników VAT, niezależnie od kwalifikowania najmu jako prywatnego dla celów podatku dochodowego. Jeżeli strony skutecznie zrezygnowały ze zwolnienia z art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT, dostawa podlega fakturowaniu, a nabywcy wykorzystującemu

Czynsz najmu nieruchomości wspólnika, wypłacany przez spółkę z o.o. opodatkowaną ryczałtem od dochodów, nie stanowi ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ust. 3 u.p.d.o.p., jeżeli transakcje są na warunkach rynkowych i są gospodarczo uzasadnione.

Działalność gospodarcza prowadzona w formie spółki cywilnej, ukierunkowana na prace badawczo-rozwojowe, które są twórcze oraz systematyczne i służą zwiększeniu zasobów wiedzy oraz jej wykorzystaniu do nowych zastosowań, spełnia definicję działalności badawczo-rozwojowej w rozumieniu art. 5a pkt 38 ustawy o PIT, dając uprawnienie do korzystania z ulgi B+R.

Działalność badawczo-rozwojowa, prowadzona systematycznie w celu opracowywania nowych lub ulepszonych technologii, stanowi podstawę do skorzystania z ulgi B+R przez wspólników spółki cywilnej w zakresie ich udziału, jeśli spełniono kryteria twórczości oraz systematyczności.

Zyski wypracowane przez spółkę komandytową przed wyborem estońskiego CIT, prawidłowo wyodrębnione i opodatkowane za wcześniejszy okres, nie podlegają ponownemu opodatkowaniu ryczałtem przy ich wypłacie wspólnikom.

Przeniesienie praw udziałowych w zamian za umorzenie udziałów wspólnika, traktowane jako świadczenie niepieniężne, skutkuje rozpoznaniem przychodu podatkowego po stronie dłużnika na podstawie art. 14a ust. 1 ustawy o CIT, obejmującym regulację zobowiązania w postaci umorzenia udziałów.

Przychody i koszty związane ze świadczeniami otrzymanymi przez spółkę przed wyborem opodatkowania ryczałtem, podlegają wstępnej korekcie według art. 7aa ustawy o PDOP, o ile występuje różnica czasowa lub nie zostały wcześniej ujęte podatkowo. Umorzone subwencje nie podlegają tej korekcie przy braku różnic czasowych.

Czynsz najmu za nieruchomość, niebędący efektem działań między podmiotami powiązanymi wywierających wpływ na decyzje spółki, ustalony na warunkach rynkowych i niezależny od zysków spółki, nie stanowi ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ust. 3 pkt 3 ustawy o CIT i nie podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek.

Wynagrodzenie za umorzenie udziałów, finansowane zarówno z zysku ryczałtowego, jak i z kapitału zapasowego pochodzącego z agio, stanowi dochód z tytułu ukrytych zysków i podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek na podstawie art. 28m ust. 3 pkt 5 ustawy o CIT.

Posiadanie przez wspólnika spółki statusu fundatora fundacji i członka jej zarządu, bez prawa do świadczeń majątkowych, nie wyklucza opodatkowania spółki ryczałtem od dochodów spółek.

Brak złożenia przez wszystkich wspólników spółki jawnej oświadczenia o wyborze opodatkowania ryczałtem w terminie do 20 dnia miesiąca po uzyskaniu pierwszego przychodu przez spółkę wyklucza możliwość skorzystania z tej formy opodatkowania.

Przeniesienie przedsiębiorstwa spółki jawnej na rzecz wspólnika większościowego oraz przekazanie środków pieniężnych wspólnikowi mniejszościowemu, dokonane w trybie innym niż likwidacja, jest neutralne podatkowo i nie generuje przychodu podlegającego opodatkowaniu.

Przychody z tytułu usług pośrednictwa w sprzedaży składników majątku świadczonych przez spółkę jawną podlegają opodatkowaniu ryczałtem od przychodów ewidencjonowanych według stawki 15%, jako usługi wspomagające usługi finansowe, zgodnie z obowiązującymi przepisami z uwagi na ich klasyfikację w PKWiU.