Przeniesienie kosztów badań UDT powinno być udokumentowane fakturą VAT. Przeniesienie opłat za zajęcie pasa drogowego musi być również dokumentowane fakturą. Koszty związane z opłatami administracyjnymi, znaczkami pocztowymi, gospodarowaniem odpadami i polisami ubezpieczonymi można przenosić notą księgową jako niepodlegające VAT. Zwolnienie z VAT zarządzania nieruchomościami jest możliwe wyłącznie

Wypłaty czynszu najmu nieruchomości przez spółkę opodatkowaną estońskim CIT na rzecz podmiotu powiązanego, zawarte na warunkach rynkowych przed wyborem tego modelu, nie stanowią ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą w rozumieniu ustawy o CIT.

Skazanie członka zarządu pośredniczącego podmiotu węglowego za przestępstwo z art. 79 ustawy o rachunkowości nie wpływa na jego status według ustawy o podatku akcyzowym, nie przewidującej wymogu niekaralności w tym zakresie. Status PPW pozostaje niezmieniony i nie stanowi podstawy do ograniczenia działalności.

Oddział zagranicznej spółki stosuje rok podatkowy tożsamy z rokiem centrali, także przy zmianie roku przez spółkę-matkę; nie powstaje obowiązek dodatkowego zawiadomienia organów podatkowych ani korekty deklaracji CIT-8, gdy zmiana dotyczy powrotu do roku kalendarzowego.

Koszty wynagrodzeń za czas usprawiedliwionej nieobecności zleceniobiorców mogą być kosztem kwalifikowanym w uldze B+R, jednak wynagrodzenia zagranicznego podwykonawcy nie spełniają kryteriów art. 18d ust. 2 pkt 3 ustawy o CIT i nie mogą być uznane za koszty kwalifikowane.

Członkostwo spółki z o.o. opodatkowanej estońskim CIT w spółdzielni energetycznej nie wyklucza z opodatkowania ryczałtem. Transakcje za energię pomiędzy spółką a spółdzielnią, realizowane po cenach rynkowych, nie są traktowane jako ukryte zyski podlegające dodatkowym obciążeniom podatkowym.

Transakcje spółki z podmiotem powiązanym, w wyniku których generowana jest znacząca wartość dodana ekonomiczna, nie wykluczają możliwości opodatkowania ryczałtem, mimo że przychody z tych transakcji przekraczają 50% całkowitych przychodów spółki.

Wynagrodzenie za udzielenie poręczenia kredytu, sama czynność poręczenia oraz ewentualna spłata kredytu w ramach poręczenia przez podmiot powiązany nie stanowią dochodu z tytułu ukrytych zysków podlegającego opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek na mocy art. 28m ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT.

Nabywane przez Spółkę usługi najmu i podwykonawstwa od podmiotów powiązanych, zgodne z zasadami rynkowymi i niezbędne dla działalności gospodarczej, nie są traktowane jako ukryte zyski w rozumieniu art. 28m ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT, stąd nie podlegają opodatkowaniu w ramach ukrytych zysków.

Wynagrodzenie wypłacane przez Wnioskodawcę na rzecz Podmiotu powiązanego za świadczenie usług organizacji produkcji nie stanowi dochodu z ukrytych zysków w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy o CIT i nie podlega opodatkowaniu estońskim CIT, ponieważ nie jest związane z prawem do udziału w zysku.

Udzielenie pożyczki pomiędzy dwoma spółkami powiązanymi, obydwiema opodatkowanymi estońskim CIT, stanowi dochód z tytułu ukrytych zysków, zgodnie z art. 28m ustawy o CIT, niezależnie czy transakcja została dokonana na warunkach rynkowych.

Refakturowane przez fundację na spółkę koszty najmu i eksploatacji nie stanowią ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą, w konsekwencji nie podlegają opodatkowaniu na zasadach CIT estońskiego. Są one bezpośrednio związane z działalnością gospodarczą spółki.

Spółka jest uprawniona do stosowania zasady 'look-through' i do zwolnienia z potrącania podatku u źródła przy wypłatach dla rzeczywistych właścicieli odsetek, pod warunkiem spełnienia warunków formalnych wynikających z obowiązujących umów o unikaniu podwójnego opodatkowania z USA i Holandią.

Pożyczka udzielona w czasie obowiązywania estońskiego CIT, choć finansowana z wcześniejszych zysków, stanowi ukryty zysk dla celów opodatkowania ryczałtem. Natomiast zwrot kapitału pożyczki i zapłaconych odsetek nie generują takiego dochodu.

Podatnik świadczący usługi dla podmiotów powiązanych może korzystać z ryczałtu od dochodów spółek, jeżeli wykonywane transakcje wytwarzają istotną wartość dodaną ekonomicznie, nawet gdy ponad 50% przychodów pochodzi z tych transakcji. Brak znikomych wartości dodanych wyklucza ograniczenia z art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. g ustawy o CIT.

Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością powstała z przekształcenia jednoosobowej działalności gospodarczej nie kwalifikuje się jako podatnik rozpoczynający działalność w rozumieniu ustawy o CIT, lecz może być uznana za małego podatnika, uprawnionego do preferencyjnej stawki ryczałtu od dochodów spółek, o ile spełnia ustawowe kryteria dotyczące wartości przychodów.

W przypadku połączenia dwóch spółek opodatkowanych Estońskim CIT, Spółka Przejmująca nie traci prawa do kontynuacji opodatkowania tą formą, a po jej stronie nie powstaje dochód z tytułu zmiany wartości składników majątku, jeśli wartości księgowe składników nie ulegają zmianie. (art. 28l i 28m ustawy CIT)

Transakcje realizowane przez podatnika podlegającego estońskiemu CIT z podmiotami powiązanymi, zawierane na warunkach rynkowych oraz posiadające charakter biznesowy, nie stanowią ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą, zaś wpłaty na PFRON nie są objęte zakresem estońskiego CIT jako ukryte zyski.

Wniesienie wierzytelności jako aportu przez spółkę czeską do polskiej spółki nie wywołuje obowiązku podatkowego na gruncie polskiego CIT, gdyż zgodnie z UPO, dochód ten opodatkowany jest wyłącznie w państwie rezydencji podatnika.

Transakcja pożyczki udzielonej przez podatnika jednostce powiązanej stanowi dochód z ukrytych zysków w rozumieniu art. 28m ust. 3 pkt 1 ustawy o CIT, który podlega opodatkowaniu CIT estońskim. Powiązania osobowe i kapitałowe, a także relacje rodzinne, determinują uznanie spółek za jednostki powiązane.

Czynsz dzierżawny za użytkowanie znaku towarowego oraz czynsz za najem nieruchomości wypłacane przez spółkę na rzecz wspólnika nie stanowią ukrytego zysku, jeśli są ustalone na poziomie rynkowym i uzasadnione biznesowo, zatem nie podlegają opodatkowaniu estońskim ryczałtem CIT (art. 28m ust. 3 ustawy o CIT).

Spółka z o.o., powstała z przekształcenia spółki cywilnej, nie jest podatnikiem rozpoczynającym działalność i nie może korzystać z preferencyjnej stawki CIT 10%. Dzierżawa i świadczenie usług na rzecz spółki przez wspólnika na warunkach rynkowych nie stanowią ukrytego zysku.

Stosowanie zerowej stawki akcyzy na benzynę ekstrakcyjną oraz zwolnienie od akcyzy preparatów smarowych wymaga dokumentowania przesunięć wewnątrzzakładowych za pomocą e-DD, nawet gdy przemieszczenie odbywa się w obrębie jednego zakładu i pod tym samym adresem.

Wynagrodzenie dla komandytariusza pełniącego funkcję prokurenta samoistnego w spółce komandytowej stanowi ukryty zysk w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy o CIT, gdyż jest to świadczenie związane z prawem do udziału w zysku, podlegające opodatkowaniu ryczałtem.