Wyboru opodatkowania przychodów z działalności gospodarczej w formie ryczałtu od przychodów ewidencjonowanych nie wykluczają czynności wykonywane obecnie na rzecz byłego pracodawcy, różniące się istotnie od tych realizowanych uprzednio w ramach stosunku pracy.

Jeżeli zakres obowiązków lekarza specjalisty znacząco różni się od czynności wykonywanych w trakcie rezydentury, przychody uzyskane z tej działalności można opodatkować zryczałtowanym podatkiem dochodowym od przychodów ewidencjonowanych, mimo kontynuacji współpracy z byłym pracodawcą.

Usługi świadczone przez lekarza w ramach funkcji zarządczych nie korzystają ze zwolnienia z VAT, gdy brak jest bezpośredniego celu terapeutycznego, zgodnie z art. 43 ust. 1 pkt 18 i 19 ustawy o VAT.

Lekarz, który po zakończeniu rezydentury rozszerza działalność gospodarczą o świadczenie usług zdrowotnych, zachowuje prawo do 19% stawki podatku liniowego, o ile wykonywane czynności różnią się od tych świadczonych w ramach umowy o pracę, a ich charakter zmienia się z nadzorowanego szkolenia na pełnoprawne udzielanie świadczeń medycznych.

Nabywanie i odsprzedaż usług psychologicznych oraz psychoterapeutycznych przez spółkę cywilną może być zwolnione z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 19a ustawy o VAT, mimo braku osobowości prawnej i statusu podmiotu leczniczego, o ile spełnione są przesłanki przedmiotowe i podmiotowe dotyczące charakteru usług i kwalifikacji wykonawców.

Usługi badań genetycznych nabywane przez Instytut od zagranicznego podmiotu, wykonywane w celu diagnostyki medycznej, objęte są zwolnieniem z VAT zgodnie z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o VAT, gdyż stanowią integralny element procedury medycznej służącej profilaktyce i ochronie zdrowia.

Kompleksowe usługi stomatologiczne świadczone przez podmiot leczniczy na rzecz pacjentów, których cel ogranicza się do profilaktyki, zachowania, ratowania, przywracania i poprawy zdrowia, korzystają ze zwolnienia z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o podatku od towarów i usług.

Usługi Nadzoru Technicznego świadczone na rzecz podmiotów leczniczych przez spółkę nie podlegają zwolnieniu od podatku VAT, ponieważ nie są ściśle związane z opieką medyczną, co wyklucza spełnienie warunków z art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o VAT.

Podatnikowi wykonującemu działalność leczniczą, świadczącemu usługi zdrowotne zwolnione z VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 18 i 19 ustawy o VAT, nie przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego od zakupu pojazdu służącego wyłącznie do tej działalności.

Usługi administracyjno-organizacyjne świadczone na rzecz podmiotu leczniczego przez osobę niebędącą podmiotem leczniczym nie korzystają ze zwolnienia od podatku VAT określonego w art. 43 ust. 1 pkt 18a ustawy o VAT, albowiem nie mają one charakteru terapeutycznego i nie są ściśle związane z usługami opieki medycznej.

Usługi organizacji i realizacji praktyk zawodowych dla uczniów, studentów i słuchaczy szkół medycznych w ramach procesu kształcenia zawodowego korzystają ze zwolnienia z VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 29 ustawy, gdyż spełniają warunki dotyczące kształcenia zawodowego określone w przepisach ustawowych i rozporządzeniach związanych z edukacją medyczną.

Usługi diagnozy zaburzeń ze spektrum autyzmu wykonywane przez lekarzy psychiatrów oraz terapie logopedyczne świadczone przez logopedów i neurologopedów mogą korzystać ze zwolnienia z VAT, gdyż są to świadczenia o charakterze medycznym, mające na celu profilaktykę oraz poprawę zdrowia, realizowane przez osoby wykonujące zawody medyczne.

Świadczenie przez lekarza usług medycznych na rzecz byłego pracodawcy w ramach działalności gospodarczej nie wyłącza prawa do opodatkowania w formie ryczałtu od przychodów ewidencjonowanych, o ile usługi te nie są tożsame z czynnościami wykonywanymi wcześniej w ramach stosunku pracy.

Usługi farmaceutyczne świadczone przez farmaceutę mogą korzystać ze zwolnienia z VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 19 ustawy, gdy spełniają definicję opieki farmaceutycznej. Nie dotyczy to jednak czynności organizacyjnych kierownika apteki, które nie wpisują się w zakres usług medycznych. Przekroczenie limitu sprzedaży nie ogranicza takiego zwolnienia.

Usługi świadczone przez logopedów i terapeutów zajęciowych jako usługi opieki medycznej spełniają przesłanki do zwolnienia z VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 19 lit. c ustawy o VAT, a ich wartość nie powinna być wliczana do limitu sprzedaży określonego w art. 113 ust. 1 tejże ustawy.

Usługi wygłaszania referatów i wykładów na rzecz lekarzy, pielęgniarek i farmaceutów są zwolnione od podatku VAT jako kształcenie zawodowe na mocy art. 43 ust. 1 pkt 29 lit. a ustawy o VAT, o ile są prowadzone zgodnie z odrębnymi przepisami. Zwolnienie nie dotyczy usług edukacyjnych skierowanych do osób spoza zawodów medycznych i studentów medycyny.

Podatnik, który nie jest zarejestrowany jako czynny podatnik VAT, a ponadto towary i usługi nabywane w ramach projektu są wykorzystywane wyłącznie do czynności zwolnionych od VAT, nie ma prawa do obniżenia podatku należnego o podatek naliczony ani prawa do zwrotu różnicy podatku.

Usługi w zakresie mezoterapii igłowej, toksyny botulinowej i laseroterapii świadczone przez podmiot leczniczy w celach terapeutycznych, spełniają przesłanki zwolnienia z VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o VAT, realizując cel ochrony zdrowia.

Usługi psychoterapeutyczne w formie warsztatów poprawiających zdrowie psychiczne i spełniające warunki określone w art. 43 ust. 1 pkt 19 ustawy o VAT mogą być zwolnione z podatku, o ile są świadczone przez osoby wykonujące zawody medyczne lub psychologa, a ich celem jest profilaktyka zdrowotna.

Usługi logopedyczne świadczone przez osobę z odpowiednimi kwalifikacjami, ukierunkowane na profilaktykę, zachowanie, ratowanie, przywracanie i poprawę zdrowia, kwalifikują się do zwolnienia z VAT na zasadzie art. 43 ust. 1 pkt 19 lit. c ustawy o VAT. Dodatkowo, obrót z tych usług nie jest uwzględniany przy ustalaniu limitu zwolnienia podmiotowego określonego w art. 113 ustawy o VAT.

Podmiot leczniczy wykonujący świadczenia medyczne ponad umowny limit rozpoznaje przychód podatkowy z tytułu tych świadczeń dopiero w dacie faktycznego otrzymania środków pieniężnych, zgodnie z art. 12 ust. 3e ustawy o CIT, gdyż przedmiotowy przychód nie jest należny w momencie wykonania usługi.

Usługi podologiczne nabywane przez szpital od podologa, świadczone w ramach umowy zlecenie, nie korzystają ze zwolnienia z podatku VAT, o którym mowa w art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o VAT, z uwagi na niespełnienie podmiotowej przesłanki zwolnienia dotyczącej osób uprawnionych do udzielania świadczeń zdrowotnych.

Podatnik uzyskujący przychody z usług medycznych jako lekarz specjalista na rzecz byłego pracodawcy może opodatkować te przychody zryczałtowanym podatkiem dochodowym, o ile zakres czynności wykonywanych w nowej działalności różni się istotnie od zakresu obowiązków świadczonych wcześniej w ramach stosunku pracy.

Świadczenie usług zdrowotnych w ramach zryczałtowanego podatku dochodowego w stawce 14% jest możliwe, jeśli zakres czynności nie pokrywa się z obowiązkami etatowymi wobec pracodawcy. Brak tożsamości czynności umożliwia opodatkowanie przychodu w formie ryczałtu od przychodów ewidencjonowanych zgodnie z art. 8 ust. 2 ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym.