Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę cywilną dokonana po jej przekształceniu w spółkę z o.o., które zostały opodatkowane przed przekształceniem, nie powoduje powstania przychodu podlegającego opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych, a spółka z o.o. nie jest płatnikiem tego podatku.

Koszty poniesione na podstawie faktur za usługi licencyjne, związane z działalnością spółki przekształconej, powinny być zaliczone w całości do kosztów uzyskania przychodów tej spółki z o.o., bez podziału na okresy działalności spółki jawnej i z o.o., zgodnie z zasadą sukcesji prawnej.

Wypłata z kapitału zapasowego spółki z o.o., powstałej z przekształcenia jednoosobowej działalności gospodarczej, uprzednio opodatkowanych zysków, stanowi przychód z tytułu udziału w zyskach osób prawnych, podlegający opodatkowaniu podatkiem dochodowym. Spółka zobowiązana jest jako płatnik do pobrania i odprowadzenia zryczałtowanego podatku dochodowego od tych wypłat.

Wypłata zysków ("Stare zyski") przez spółkę komandytową, które zostały uprzednio opodatkowane podatkiem dochodowym od osób fizycznych w ramach działalności spółki jawnej, nie podlega ponownemu opodatkowaniu tym podatkiem po przekształceniu spółki w komandytową. W razie możliwej identyfikacji takich zysków, uznaje się je za neutralne podatkowo.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę jawną przed jej przekształceniem w prostą spółkę akcyjną, już uprzednio opodatkowanych podatkiem dochodowym od osób fizycznych, nie podlega ponownemu opodatkowaniu PIT w momencie wypłaty. Spółka nie jest zobowiązana do poboru zryczałtowanego podatku jako płatnik.

Spółka przekształcona na mocy sukcesji uniwersalnej wchodzi we wszelkie prawa i obowiązki podatkowe podmiotu przekształcanego, jednak odliczenie VAT z faktur wystawionych przed przekształceniem wymaga wykazania ich związku z działalnością opodatkowaną, a w działalności mieszanej zastosowania proporcji podanej w art. 90 ustawy o VAT.

Najem nieruchomości na podstawie umowy, ustalony na warunkach rynkowych, nie prowadzi do powstania dochodu z tytułu ukrytych zysków podlegającego opodatkowaniu ryczałtem zgodnie z art. 28m ustawy o CIT; czynsz ten wynika z uzasadnionych ekonomicznie i organizacyjnie działań potrzebnych do prowadzenia działalności gospodarczej.

Spółka z o.o., przekształcona ze spółki jawnej, zobowiązana jest do sporządzenia korekty wstępnej informacji o przychodach i kosztach według art. 7aa ust. 8 ustawy o CIT, mimo braku obowiązku przeszacowania majątku do wartości rynkowej, jedynie dla celów informacyjnych.

Wypłaty zysków wypracowanych przez spółkę jawną przed jej przekształceniem i uprzednio opodatkowanych podatkiem dochodowym od osób fizycznych nie stanowią dochodu podlegającego opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek zgodnie z art. 28m ustawy o CIT, gdyż nie spełniają definicji podzielonego zysku, ukrytych zysków ani innych kategorii dochodów opodatkowanych w omawianym systemie.

Przekształcenie spółki komandytowej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością oraz uzyskanie przez wspólnika statusu komplementariusza po wypracowaniu zysku nie wpływa na możliwość zastosowania mechanizmu redukcji obciążeń podatkowych na podstawie art. 30a ust. 6a ustawy o PIT względem zysków osiągniętych przez podmiot w okresie funkcjonowania jako spółka komandytowa.

W przypadku zbycia udziałów spółki przekształconej, kosztem uzyskania przychodów jest przypadająca na wspólnika wartość bilansowa składników majątku spółki przekształcanej na moment przekształcenia, co wynika z jednolitej linii orzeczniczej i braku uznania przekształcenia za wkład niepieniężny.

Przychód ze sprzedaży ogółu praw i obowiązków w spółce komandytowej pomniejsza się o wartość bilansową spółki przekształconej na dzień przekształcenia, proporcjonalną do udziału w kapitale zakładowym. Owa wartość nie podlega zmniejszeniu o wycofaną część wkładu.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę przekształconą, na podstawie uchwały podziału zysków, po przekształceniu w formę spółki kapitałowej, stanowi przychód z tytułu udziału w zyskach osób prawnych zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 4 ustawy o PIT i podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych.

Kosztem uzyskania przychodu z tytułu sprzedaży udziałów w spółce z o.o. przekształconej ze spółki komandytowej jest wartość majątku przypadająca na udziałowca, wyceniona na dzień przekształcenia, odzwierciedlając realny koszt ekonomiczny poniesiony przez wspólników.

Koszty poniesione na objęcie udziałów w przekształconej spółce z o.o. są uznawane za koszty uzyskania przychodu z umorzenia akcji spółki akcyjnej powstałej z przekształcenia; przekształcenie nie stanowi objęcia nowego prawa, jest kontynuacją udziału.

Wydatki na objęcie udziałów w spółce przekształcanej mogą być uznane za koszty uzyskania przychodów z umorzenia akcji w wyniku przekształcenia, o ile wydatki te były poniesione pierwotnie na objęcie statusu wspólnika w spółce z ograniczoną odpowiedzialnością, zgodnie z art. 23 ust. 1 pkt 38 ustawy o PIT.

Na gruncie przepisów o ryczałcie od dochodów spółek, spółka z o.o. powstała z przekształcenia spółki cywilnej nie kwalifikuje się jako podatnik rozpoczynający działalność, co wyklucza możliwość korzystania z preferencyjnych warunków zatrudnienia przewidzianych dla nowych podatników.

W świetle art. 93a § 1 pkt 2 Ordynacji podatkowej przekształcona spółka z o.o. wstępuje we wszelkie prawa i obowiązki podatkowe przekształconej spółki jawnej, co uprawnia ją do zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów wydatków poniesionych przed przekształceniem przez spółkę jawną, nawet jeśli te nie były uznane jako koszty przed tym dniem, pod warunkiem spełnienia odpowiednich przesłanek ustalonych

Przymusowe umorzenie akcji w spółce akcyjnej, objętych w wyniku przekształcenia spółki z o.o. w spółkę akcyjną, nie jest traktowane jako odpłatne zbycie akcji zgodnie z art. 30b ustawy o PIT, lecz podlega przepisom art. 24 ust. 5 w związku z art. 23 ust. 1 pkt 38 tejże ustawy, określającym koszty uzyskania przychodu w kontekście wartości bilansowej majątku spółki przekształcanej.

Wypłata zysków wygenerowanych przed przekształceniem jednoosobowej działalności gospodarczej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością, które wcześniej podlegały opodatkowaniu PIT jako dochody z działalności osoby fizycznej, nie stanowi przychodu z udziałów w zyskach osoby prawnej i jest neutralna podatkowo.

Na dzień przekształcenia z umów leasingu operacyjnego przekształconej spółki jawnej nie powstaje dochód z przekształcenia, gdyż nie sposób ustalić wartości podatkowej składników majątku, które są przedmiotem leasingu operacyjnego, z uwagi na brak ich amortyzacji podatkowej oraz niemożność ich zbycia.

Wypłata niepodzielonych zysków spółki jawnej po jej przekształceniu w spółkę z o.o. jest podatkowo neutralna, gdyż zyski te były już opodatkowane na poziomie wspólników spółki jawnej przed przekształceniem, nie podlegają zatem opodatkowaniu jako przychód z udziału w zyskach osób prawnych.

Straty poniesione przez spółkę przekształcaną, w związku z przekształceniem dokonanym w trybie art. 7 ust. 3 pkt 4 ustawy o CIT, mogą być odliczane od dochodu przez spółkę przekształconą, w myśl wyjątków przewidzianych dla przekształcenia 'spółki w inną spółkę' oraz art. 7 ust. 5 ustawy o CIT, przy spełnieniu ustawowych limitów rozliczeń.

Wypłata przez spółkę z kapitału zapasowego wartości niewypłaconego zysku wypracowanego przed przekształceniem JDG w spółkę z o.o. stanowi przychód z udziału w zyskach osób prawnych, podlegający opodatkowaniu 19% podatkiem, z obowiązkiem potrącenia przez spółkę jako płatnika.