W świetle obowiązujących przepisów, odliczenie podatku naliczonego VAT dla faktur przechowywanych wyłącznie w formie elektronicznej, po zniszczeniu papierowych oryginałów, jest dopuszczalne, o ile zapewniona jest ich autentyczność pochodzenia, integralność treści i czytelność zgodnie z art. 112a ustawy o VAT. Dokumenty Zakupowe, które nie są zrównane z fakturami, nie mogą być podstawą odliczenia podatku
Archiwizowanie dokumentów księgowych, w tym faktur, wyłącznie w formie elektronicznej jest dozwolone pod warunkiem zapewnienia autentyczności, integralności i czytelności. Uprawnienie do odliczenia VAT jest ograniczone do elektronicznie przechowywanych faktur, które spełniają wymogi ustawy i nie obejmuje innych dokumentów nieuznawanych za faktury zgodnie z ustawą o VAT.
Przechowywanie dokumentów księgowych w formie elektronicznej, z zachowaniem zasad integralności, autentyczności i czytelności, jest dopuszczalne bez papierowych kopii. Prawo do odliczenia VAT uzależnione jest od spełnienia warunków zarówno przez dokumenty, jak i przez transakcje, których dotyczą.
Prawo do odliczenia VAT naliczonego powstaje z chwilą faktycznego otrzymania faktury, wystawionej poza KSeF, gdy spełnione są materialne przesłanki z art. 86 ustawy o VAT, a późniejsze przesłanie faktury do KSeF nie wpływa na ten moment.
Wykładnia przepisów ustawy o VAT dopuszcza archiwizowanie i przechowywanie dokumentów księgowych wyłącznie w formie elektronicznej, przy zachowaniu wymogów autentyczności i integralności. Prawo do odliczenia podatku naliczonego zachodzi wyłącznie, gdy dokumenty elektroniczne spełniające definicję faktur są związane z czynnościami opodatkowanymi.
Przechowywanie dokumentów księgowych wyłącznie w formie elektronicznej jest dopuszczalne o ile spełnia wymogi zapewniające autentyczność, integralność i czytelność, jednakże prawo do odliczenia VAT przysługuje jedynie dla dokumentów spełniających definicję faktury zgodnie z ustawą o VAT.
Oznaczenie faktur w ewidencji JPK VAT wymaga zachowania zgodności z trybem ich wystawienia i źródłem pochodzenia; oznaczenie BFK obowiązuje dla faktur zagranicznych oraz pdf, podczas gdy korekta z ulgi na złe długi zachowuje pierwotne oznaczenie faktury. Rabaty pośrednie wymagają notyfikacji jako DI i WEW.
Prawo do odliczenia VAT naliczonego przysługuje z faktur doręczonych poza KSeF, pomimo wymogu użycia KSeF, gdy spełnione są inne warunki określone w ustawie o VAT. Niedopełnienie obowiązku wystawienia faktury w KSeF nie stanowi przesłanki negatywnej wykluczającej prawo do odliczenia podatku naliczonego.
W sytuacji omyłkowego przesłania faktur sprzedaży do Krajowego Systemu e-Faktur przed 1 kwietnia 2026 r., wystawienie faktury korygującej jest obligatoryjne, aby usunąć dokumenty z obrotu prawnego, niezależnie od wcześniejszego prawidłowego ich wystawienia poza KSeF. Pominięcie korekty naraża podatnika na ryzyko podwójnej zapłaty VAT.
W przypadku pomyłki w numerze NIP kontrahenta, podatnik jest zobowiązany do wystawienia faktury korygującej „do zera” i nowej faktury z poprawnym NIP; te dokumenty powinny być ujęte w ewidencji za okres, w którym powstał obowiązek podatkowy dla pierwotnej faktury, uwzględniając ograniczenia KSeF.
Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego z faktur wystawionych niezgodnie z obowiązkiem KSeF, o ile faktury te dokumentują rzeczywiste zdarzenia gospodarcze, odzwierciedlają transakcje podlegające opodatkowaniu i spełnione są pozostałe przesłanki odliczenia podatku VAT.
Jeżeli faktura ustrukturyzowana zawiera błędny numer NIP, konieczne jest wystawienie faktury korygującej do zera oraz nowej faktury z prawidłowym NIP. Rozliczenie powinno nastąpić w okresie obowiązkowego podatkowego faktury pierwotnej.
Podatnik, którego proporcja sprzedaży wynosi 100%, zachowuje prawo do odliczenia naliczonego podatku VAT z faktur wystawionych poza KSeF, o ile zgodność formalno-materialna faktury jest zachowana, nie zaś forma wystawienia. Data faktycznego otrzymania takich faktur stanowi moment powstania prawa do odliczenia.
Faktury wystawione poza KSeF, dokumentujące rzeczywiste zdarzenia gospodarcze, mogą zostać uznane za podstawę zaliczenia wydatków do kosztów uzyskania przychodów, o ile spełniają kryteria określone w art. 15 ust. 1 ustawy CIT, niezależnie od formalnego obowiązku ich wystawienia przez KSeF.
Warunek „odbioru faktury” finalnego nabywcy węglowego, w rozumieniu art. 31a ust. 3i ustawy akcyzowej, zostaje spełniony z chwilą przydzielenia numeru KSeF fakturze w trybach online i offline, oraz w trybie awaryjnym, o ile nie nastąpi wcześniejsze faktyczne otrzymanie tej faktury poza KSeF przez nabywcę.
Podatnikowi VAT przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur zakupowych wystawionych bez użycia Krajowego Systemu e-Faktur, jeśli fakty te odzwierciedlają rzeczywiste transakcje gospodarcze, a towary i usługi służą czynnościom opodatkowanym.
Podatnik ma prawo do odliczenia podatku VAT z faktur otrzymanych poza KSeF, jeśli spełnia inne wymogi odliczenia, w tym przeznaczenie towarów i usług do działalności opodatkowanej. Otrzymanie takiej faktury bez użycia KSeF nie jest przesłanką negatywną wykluczającą prawo do odliczenia według art. 88 ustawy o VAT.
Dokumenty EDI i Wizualizacje PDF stanowiące wizualizacje faktur ustrukturyzowanych mogą być traktowane jako odrębne pustą faktury, jeśli ich treść lub sposób prezentacji wprowadza w błąd i odbiega od zgodności z danymi zawartymi na fakturze ustrukturyzowanej w KSeF.
Podatnik ma prawo do odliczenia VAT z faktur wydanych poza KSeF, przy spełnieniu pozostałych warunków, niezależnie od późniejszego wprowadzenia faktury do KSeF, jednakże momentem odliczenia VAT z e-faktur jest data przypisana w KSeF.
Prawo do odliczenia podatku naliczonego na podstawie faktur otrzymanych poza KSeF przysługuje, jeżeli faktura dokumentuje rzeczywiste zdarzenie gospodarcze oraz przy spełnieniu wymogów materialnych z art. 86 ustawy o VAT, niezależnie od formy wystawienia faktury.
Podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia podatku należnego o podatek naliczony z faktury VAT wystawionej poza systemem KSeF, nawet gdy istnieje obowiązek jej wystawienia poprzez KSeF, pod warunkiem spełnienia pozostałych wymogów odliczenia. Momentem odliczenia jest faktyczne otrzymanie faktury, a późniejsze jej wprowadzenie do KSeF nie wpływa na ten moment.
Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia VAT naliczonego, wynikającego z faktury wystawionej wbrew obowiązkowi poza Krajowym Systemem e-Faktur, pod warunkiem spełnienia przesłanek materialnych. Otrzymanie faktury w formie nieustrukturyzowanej nie wymaga korekty deklaracji VAT przy późniejszym otrzymaniu faktury w KSeF.
Odliczenie VAT od faktur nie w KSeF przysługuje przy spełnieniu warunków art. 86 ust. 1 ustawy VAT. Momentem odliczenia jest data otrzymania faktury, niezależnie od późniejszego jej wprowadzenia do KSeF, pod warunkiem braku przesłanek z art. 88.
Spółka, będąc czynnym podatnikiem VAT, jest uprawniona do odliczenia podatku naliczonego z faktur wystawionych poza KSeF, pod warunkiem, że faktury te dokumentują rzeczywiste transakcje gospodarcze i spełnione są materialne przesłanki odliczenia określone w art. 86 ustawy o VAT, niezależnie od niezgodności wystawienia faktury z wymogami KSeF.