Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego z tytułu zakupu usług szkoleniowych koniecznych do uzyskania licencji zawodowych lotniczych, wykorzystywanych pośrednio do czynności opodatkowanych, pod warunkiem braku przesłanek negatywnych eliminujących to prawo.
Polski oddział zagranicznego przedsiębiorstwa nie spełnia kryteriów stałego miejsca prowadzenia działalności gospodarczej w zakresie świadczenia międzynarodowego transportu lotniczego i nie jest zobowiązany do stosowania Krajowego Systemu e-Faktur przy wystawianiu faktur za usługi transportowe, będąc jedynie wsparciem administracyjnym.
Zagraniczna linia lotnicza nie posiada stałego miejsca prowadzenia działalności gospodarczej w Polsce, co zwalnia ją z obowiązku korzystania z Krajowego Systemu e-Faktur, gdyż jej działalność operacyjna i zaplecze techniczne oraz personalne są zlokalizowane wyłącznie poza terytorium Polski.
Podstawę opodatkowania z tytułu odsprzedaży biletów lotniczych ustala się zgodnie z art. 119 ustawy i w związku z tym za podstawę opodatkowania należy uznać marżę wyliczoną zgodnie z art. 119 ust. 2 ustawy.