Momentem poniesienia kosztów kwalifikowanych do wsparcia inwestycyjnego w rozumieniu przepisów o zwolnieniu z CIT jest chwila ich faktycznej zapłaty, co implikuje stosowanie metody kasowej przy ustaleniu momentu ich poniesienia.

Wydatki inwestycyjne nieujęte uprzednio w dokumentacji PSI mogą być uznane za kwalifikowane do objęcia pomocą publiczną w formie zwolnienia z CIT, o ile spełniają warunki związane z realizacją nowej inwestycji określonej przez art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT i Rozporządzenie WNI.