W przypadku wynajmu nieruchomości, koszty eksploatacyjne mediów, które są odrębnie rozliczane według zużycia przez najemców, stanowią świadczenia niezależne od usługi najmu i podlegają opodatkowaniu według właściwych stawek VAT. Koszty przypadające na części wspólne nieruchomości powinny być traktowane jako element usługi najmu mieszkalnego i korzystać ze zwolnienia z VAT.
Gminie przysługuje prawo do częściowego odliczenia VAT w części wydatków związanych z wykonaniem instalacji fotowoltaicznej, związanej z działalnością opodatkowaną sprzedażą energii. Wydatki niezwiązane z działalnością opodatkowaną są wyłączone z prawa do odliczenia podatku naliczonego.
Błędne lub niepełne dane jednostki organizacyjnej JST wykazywanej jako podmiot trzeci na fakturze w KSeF winny być skorygowane poprzez fakturę korygującą zmieniającą te dane, bez potrzeby wystawiania faktury do zera, jeśli dane nabywcy są prawidłowe.
Przekazanie nieruchomości na rzecz Skarbu Państwa w zamian za odszkodowanie korzysta ze zwolnienia z VAT, jeśli od pierwszego zasiedlenia upłynęło więcej niż dwa lata. Obowiązek podatkowy powstaje z chwilą otrzymania odszkodowania.
Gmina, realizując niekomercyjny projekt niepowiązany z czynnościami opodatkowanymi, nie ma prawa do odliczenia ani odzyskania podatku VAT naliczonego. Podatek ten traktowany jest jako koszt kwalifikowany, zgodnie z wytycznymi Planu Strategicznego dla Wspólnej Polityki Rolnej. Związek z czynnościami opodatkowanymi jest wymagany przez art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Sprzedaż ruchomości Miasta poprzez jednostkę budżetową O podlega opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług bez zastosowania zwolnienia, ponieważ aktywa te nie były wykorzystywane wyłącznie do działalności zwolnionej. Transakcje obejmujące sprzedaż wartości niematerialnych również podlegają opodatkowaniu zgodnie z art. 5 ust. 1 i art. 8 ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT.
Świadczenie przez gminę odpłatnych usług wstępu do muzeum stanowi działalność gospodarczą oraz czynności podlegające opodatkowaniu VAT. Gmina ma prawo do pełnego odliczenia VAT od poniesionych wydatków inwestycyjnych związanych z tą działalnością, pod warunkiem ich związku z czynnościami opodatkowanymi.
Miasto nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego z tytułu wydatków na modernizację Domu Kultury, gdyż efekty inwestycji nie są wykorzystywane do czynności opodatkowanych podatkiem VAT przez Miasto, co wyklucza możliwość odliczenia zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Gmina nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego VAT ani jego zwrotu od wydatków poniesionych na realizację projektu przebudowy placów zabaw, gdyż wydatki te nie służą czynnościom opodatkowanym, lecz zadaniom publiczno-prawnym.
Jednostka budżetowa taka jak Miejski Urząd Pracy, nie podlega centralizacji rozliczeń VAT z gminą macierzystą, gdyż nie działa jako samodzielny podatnik VAT i realizuje zadania wyłącznie w imieniu gminy zgodnie z ustawowymi obowiązkami.
W przypadku wskazania błędnych danych odbiorcy jednostki samorządu terytorialnego na fakturze w Krajowym Systemie e-Faktur, korekty dokonuje się poprzez wystawienie faktury korygującej do zera oraz nowej faktury z poprawnymi danymi, co jest niezbędne dla poprawności systemowej.
Jeżeli należność z faktury, zawierającej towary lub usługi z załącznika nr 15 do ustawy o VAT, uiszcza się po potrąceniu kar umownych, mechanizm podzielonej płatności obowiązuje dla pozostałej kwoty, a VAT należy wyliczyć proporcjonalnie.
Gmina nie ma prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego od wydatków związanych z zadaniami realizowanymi przez Miejski Zarząd Dróg, jeżeli wydatki te nie są związane z działalnością gospodarczą opodatkowaną VAT, a mają charakter publicznoprawny i są nieodpłatnie udostępniane społeczeństwu.
Wprowadzenie przez jednostkę samorządu terytorialnego energii elektrycznej do sieci, jako działanie prosumenta, stanowi podlegającą VAT odpłatną dostawę towarów, zaś obowiązek podatkowy powstaje z chwilą wystawienia faktury lub upływu terminu jej wystawienia, przy czym podstawa opodatkowania to wartość energii ustalana zgodnie z regulacjami OZE.
Gmina jest uprawniona do stosowania do wydatków mieszanych prewspółczynnika VAT obliczoną metodą ilościową dla działalności wodno-kanalizacyjnej. Jest to dopuszczalne, gdyż metoda ta lepiej odzwierciedla specyfikę działalności gospodarczej prowadzonej przez KZB, skutkując adekwatnym odliczeniem podatku naliczonego.
Gmina, realizując zadania własne w ramach nieodpłatnej działalności nie podlegającej opodatkowaniu VAT, nie jest uprawniona do odliczenia naliczonego podatku VAT związanego z wydatkami na realizację przedsięwzięcia, gdyż nie spełnia przesłanek zawartych w art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Wprowadzenie przez Gminę energii elektrycznej do sieci energetycznej stanowi działalność gospodarczą i odpłatną dostawę towarów podlegającą VAT. Obowiązek podatkowy powstaje z chwilą wystawienia faktury lub upływu terminu na jej wystawienie, a podstawa opodatkowania ustalana jest w relacji do wartości depozytu prosumenckiego zwiększonego o współczynnik 1,23.
Dostawa mediów w postaci centralnego ogrzewania w budynku mieszkalnym, z wykorzystaniem pompy ciepła, stanowi odrębne świadczenie podlegające opodatkowaniu VAT niezależnie od usługi najmu, a zwolnienie dla najmu z art. 43 ust. 1 pkt 36 ustawy o VAT nie ma tu zastosowania.
Zwrot kosztów na rzecz Gminy ponoszony przez Spółkę z tytułu ochrony ujęcia wody, na podstawie Porozumienia, stanowi koszt uzyskania przychodów na gruncie art. 15 ust. 1 ustawy CIT oraz jest potrącalny w dacie poniesienia jako koszt pośredni, zgodnie z art. 15 ust. 4d ustawy CIT.
Podatnikowi, który działa w ramach zadań publicznych i dokonuje czynności jako organ władzy publicznej, nie przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego związanego z inwestycjami niepowiązanymi z czynnościami opodatkowanymi VAT.
Opłaty parkingowe na drogach publicznych nie podlegają opodatkowaniu VAT, gdyż wynikają z realizacji zadań publicznych. Opłaty za parkowanie na terenach poza pasem drogowym oraz opłaty sankcyjne za przekroczenie czasu parkowania podlegają VAT jako świadczenia opodatkowane. Prawo odliczenia VAT przysługuje proporcjonalnie do wykorzystania do działalności opodatkowanej.
Jednostce samorządu terytorialnego, która nie może jednoznacznie przypisać wydatków na media do czynności opodatkowanych VAT, przysługuje prawo do proporcjonalnego odliczenia podatku naliczonego. Wydatki na media związane z mieszkaniem chronionym, jako czynnością niepodlegającą opodatkowaniu, wymagają częściowego odliczenia podatku.
Odpłatne zbycie przez Miasto nieruchomości gruntowej zabudowanej budynkami niemieszkalnymi będzie korzystać ze zwolnienia od podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT w sprzężeniu z art. 29a ust. 8 tej ustawy, z powodu upływu okresu ponad dwóch lat od pierwszego zasiedlenia i braku nakładów na ulepszenie tych budynków przekraczających 30% ich wartości początkowej.