Koszty poniesione na podstawie faktur za usługi licencyjne, związane z działalnością spółki przekształconej, powinny być zaliczone w całości do kosztów uzyskania przychodów tej spółki z o.o., bez podziału na okresy działalności spółki jawnej i z o.o., zgodnie z zasadą sukcesji prawnej.

W przypadku zbycia udziałów spółki przekształconej, kosztem uzyskania przychodów jest przypadająca na wspólnika wartość bilansowa składników majątku spółki przekształcanej na moment przekształcenia, co wynika z jednolitej linii orzeczniczej i braku uznania przekształcenia za wkład niepieniężny.

Przychód ze sprzedaży ogółu praw i obowiązków w spółce komandytowej pomniejsza się o wartość bilansową spółki przekształconej na dzień przekształcenia, proporcjonalną do udziału w kapitale zakładowym. Owa wartość nie podlega zmniejszeniu o wycofaną część wkładu.

Kosztem uzyskania przychodu z tytułu sprzedaży udziałów w spółce z o.o. przekształconej ze spółki komandytowej jest wartość majątku przypadająca na udziałowca, wyceniona na dzień przekształcenia, odzwierciedlając realny koszt ekonomiczny poniesiony przez wspólników.

Koszty poniesione na objęcie udziałów w przekształconej spółce z o.o. są uznawane za koszty uzyskania przychodu z umorzenia akcji spółki akcyjnej powstałej z przekształcenia; przekształcenie nie stanowi objęcia nowego prawa, jest kontynuacją udziału.

Wydatki na objęcie udziałów w spółce przekształcanej mogą być uznane za koszty uzyskania przychodów z umorzenia akcji w wyniku przekształcenia, o ile wydatki te były poniesione pierwotnie na objęcie statusu wspólnika w spółce z ograniczoną odpowiedzialnością, zgodnie z art. 23 ust. 1 pkt 38 ustawy o PIT.

W świetle art. 93a § 1 pkt 2 Ordynacji podatkowej przekształcona spółka z o.o. wstępuje we wszelkie prawa i obowiązki podatkowe przekształconej spółki jawnej, co uprawnia ją do zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów wydatków poniesionych przed przekształceniem przez spółkę jawną, nawet jeśli te nie były uznane jako koszty przed tym dniem, pod warunkiem spełnienia odpowiednich przesłanek ustalonych

Przymusowe umorzenie akcji w spółce akcyjnej, objętych w wyniku przekształcenia spółki z o.o. w spółkę akcyjną, nie jest traktowane jako odpłatne zbycie akcji zgodnie z art. 30b ustawy o PIT, lecz podlega przepisom art. 24 ust. 5 w związku z art. 23 ust. 1 pkt 38 tejże ustawy, określającym koszty uzyskania przychodu w kontekście wartości bilansowej majątku spółki przekształcanej.

Zmniejszenie wkładu wspólnika spółki komandytowej, będącej następcą prawnym spółki kapitałowej, skutkuje uznaniem jako kosztu uzyskania przychodu wartości bilansowej na dzień przekształcenia spółki kapitałowej, zgodnie z art. 24 ust. 5e ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.

Przymusowe umorzenie akcji w spółce akcyjnej, będącej wynikiem przekształcenia spółki z o.o., nie podlega opodatkowaniu na podstawie przepisów dotyczących odpłatnego zbycia, lecz jest traktowane jako dochód z udziału w zyskach osób prawnych według art. 24 ust. 5 w zw. z art. 17 ust. 1 pkt 4 ustawy o PIT.

Wypłata przez spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością, utworzoną z przekształcenia jednoosobowej działalności gospodarczej, środków pochodzących z zysków wypracowanych przed przekształceniem, jest neutralna podatkowo, o ile nie stanowi ona zysku spółki przekształconej, zgodnie z zasadą kontynuacji (art. 5842 KSH).

Obniżenie wkładu komandytariusza poprzez zwrot nieruchomości w spółce komandytowej stanowi przychód z kapitałów pieniężnych, z uwzględnieniem historycznego kosztu nabycia przedsiębiorstwa jako kosztu uzyskania przychodu.

Wypłaty z kapitału zapasowego spółki, pochodzące z zysków wypracowanych przed przekształceniem przedsiębiorcy w spółkę, są traktowane jako przychód z tytułu udziału w zyskach osób prawnych i podlegają opodatkowaniu zryczałtowanym podatkiem dochodowym, chyba że dotyczą nowych wspólników, poza przedsiębiorcą przekształcanym.

Wypłata środków po przekształceniu jednoosobowej działalności w spółkę kapitałową, stanowiących kapitał zapasowy, skutkuje przysporzeniem z tytułu udziału w zyskach osób prawnych, obciążonym podatkiem dochodowym zgodnie z ustawą o PIT.

Koszty uzyskania przychodu ze zbycia udziałów nabytych w wyniku wymiany udziałów należy ustalić na podstawie wartości bilansowej spółki jawnej z dnia jej przekształcenia w spółkę kapitałową, przy czym przekształcenie spółki osobowej w kapitałową nie stanowi transakcji powodującej powstanie przychodu, a koszty są ustalane według proporcjonalnej wartości bilansowej majątku przekształconej spółki.

Koszty uzyskania przychodów z dobrowolnego umorzenia udziałów, nabytych przez wymianę udziałów zgodnie z art. 24 ust. 8a ustawy PIT, powinny odnosić się do historycznych wydatków poniesionych na nabycie udziałów przekazanych w tej wymianie.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę jawną po jej przekształceniu w spółkę z o.o. stanowi przychód z tytułu udziału w zyskach osób prawnych podlegający opodatkowaniu, jeżeli niepoprzedzona była uchwałą o wypłacie przed przekształceniem. Kosztami uzyskania przychodów ze zbycia udziałów w przekształconej spółce są wydatki na nabycie udziałów oraz proporcjonalna część zatrzymanych zysków.

W przypadku dobrowolnego umorzenia udziałów Z, objętych uprzednio przez Wnioskodawcę w wyniku wymiany, koszty podatkowe ustala się jako wartość bilansową spółki jawnej z dnia przekształcenia w spółkę kapitałową, wobec braku uznania przekształcenia za wniesienie aportu.

Wydatki poniesione na czynności notarialne związane z przekształceniem spółki z ograniczoną odpowiedzialnością w spółkę komandytowo-akcyjną, powinny być rozpoznane jako koszty uzyskania przychodu w księgach spółki przekształcanej na moment ich poniesienia, a nie przenoszone do kosztów spółki przekształconej.

Przekształcenie spółki komandytowej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie skutkuje powstaniem zobowiązania w podatku dochodowym od osób fizycznych dla wspólników - komandytariuszy, o ile nie dochodzi do faktycznego przysporzenia majątkowego.

Proces przekształcenia spółki komandytowej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością, o ile nie prowadzi do uzyskania przez komplementariusza jakichkolwiek przysporzeń majątkowych, nie generuje dla niego przychodu podatkowego na gruncie ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.

W przypadku przekształcenia spółki niebędącej osobą prawną w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością stosującą opodatkowanie ryczałtem, przychody i koszty uzgadnia się na podstawie danych wynikających z ksiąg rachunkowych. Zobowiązanie podatkowe wygaśnie, jeśli ryczałt stosowany jest przez co najmniej cztery lata. (art. 7aa CIT)

Na gruncie art. 23 ust. 1 pkt 38 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, wartość bilansowa majątku spółki przekształcanej nie stanowi wydatków na objęcie akcji, lecz wydatki te mogą być uznane za koszty uzyskania przychodu z ich zbycia, gdy nie wiążą się z historycznym okresem nabycia majątku przekształconej spółki.

Wartość bilansowa spółki komandytowej na dzień jej przekształcenia w spółkę akcyjną może stanowić koszty uzyskania przychodu przy sprzedaży akcji spółki akcyjnej, jako że proces przekształcenia traktowany jest podobnie do wniesienia wkładu.