W zastosowaniu stawki 0% VAT wobec faktur dokumentujących kamienie milowe projektu realizowanego dla instytucji UE, stanowiących przedmiot transakcji międzynarodowej, decydujące jest terminowe posiadanie adekwatnego świadectwa zwolnienia. Brak dokumentu przed upływem okresu rozliczeniowego uniemożliwia korektę faktury na preferencyjną stawkę.

Otrzymane środki z pobrexitowej rezerwy dostosowawczej są zwolnione z podatku dochodowego na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 46 u.p.d.o.f.; wydatki na zakup towarów, niepokryte dotacją, mogą być uznane za koszty uzyskania przychodu. Zwolnienie z opodatkowania dotacji oraz zakup towarów jako koszt działalności.

W deklaracji CIT-8 (Zeznanie o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) przez podatnika podatku dochodowego od osób prawnych) środki finansowe na poniesione wydatki w ramach realizowanego Projektu, refundowane przez Instytucję Wspomagającą (BPZ), które wpłyną do Instytutu w pełnej wysokości będą wolne od podatku dochodowego od osób prawnych na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 47 ustawy o podatku