Ograniczenie wprowadzone w art. 15 ust. 6 ustawy o CIT odnosi się do spółek nieruchomościowych i wymaga, aby wartość kosztów podatkowych z tytułu amortyzacji nie przekraczała wartości umorzeniowej z rachunkowości. W braku bilansowej amortyzacji, spółka nie może zaliczyć odpisów podatkowych od takich środków trwałych do kosztów uzyskania przychodów.

Wydzielony z przedsiębiorstwa zespół składników majątkowych i niemajątkowych, który zostaje przekazany do nowej jednostki w ramach podziału przez wydzielenie, stanowi zorganizowaną część przedsiębiorstwa w rozumieniu art. 4a pkt 4 ustawy o CIT, co powoduje, iż operacja ta jest neutralna podatkowo na gruncie podatku dochodowego od osób prawnych.

Koszty poniesione na dokumentację projektową przekazaną gminie, jako inwestycję w obcym środku trwałym, mogą stanowić koszty uzyskania przychodu, o ile przekazanie ma charakter ekwiwalentny, wynikający z późniejszych korzyści gospodarczych, spełniając przesłanki art. 15 ust. 1 updop.

W przypadku gdy jednostka budżetowa gminy wykorzystuje efekty inwestycji zarówno do działalności opodatkowanej VAT, jak i do działalności poza VAT, odliczenie VAT naliczonego odbywa się poprzez zastosowanie prewspółczynnika jednostki zgodnie z zasadami wynikającymi z art. 86 ust. 2a ustawy o VAT.

Odpłatne udostępnienie infrastruktury wodno-kanalizacyjnej na rzecz Spółki w ramach umowy dzierżawy stanowi działalność gospodarczą podlegającą opodatkowaniu VAT oraz uprawnia Gminę do pełnego odliczenia VAT naliczonego związanego z realizacją inwestycji.

Podział przez wydzielenie działalności Budynek A1 ze Spółki Dzielonej do Spółki Przejmującej nie skutkuje powstaniem przychodu po stronie wspólników ani spółek, gdyż obie działalności stanowią zorganizowane części przedsiębiorstwa zgodnie z art. 4a pkt 4 ustawy o CIT.

Wprowadzenie energii do sieci elektroenergetycznej, choć incydentalne, kwalifikuje Gminę jako podatnika VAT, co skutkuje możliwością częściowego odliczenia podatku naliczonego na instalacje fotowoltaiczne.

Przeniesienie Inwestycji Budynek X w ramach podziału przez wydzielenie stanowi transakcję zbycia zorganizowanej części przedsiębiorstwa w rozumieniu art. 2 pkt 27e ustawy o VAT, tym samym wyłączoną z opodatkowania VAT na podstawie art. 6 ust. 1 ustawy.

Gmina, jako organ władzy publicznej realizujący zadania własne niepodlegające opodatkowaniu VAT, nie ma możliwości odzyskania podatku VAT związanego z inwestycją finansowaną z Europejskiego Funduszu Rolnego, gdyż efekty inwestycji nie są wykorzystywane do czynności opodatkowanych VAT.

Podatnik podatku VAT ma prawo do odliczenia podatku naliczonego od wydatków inwestycyjnych na nieruchomości będącej przedmiotem dzierżawy, pod warunkiem spełnienia przesłanek z art. 86 ustawy o VAT, w tym przeznaczenia inwestycji na cele działalności opodatkowanej, oraz braku przesłanek negatywnych z art. 88 ustawy.

Zaliczki otrzymane przez wspólnotę lokalową powinny być rozpoznane jako przychód podatkowy w momencie ich otrzymania, a nie na koniec okresu rozliczeniowego; przychody z najmu należy rozpoznawać zgodnie z art. 12 ust. 3c ustawy o CIT, a wszystkie wydatki związane z utrzymaniem nieruchomości i mediami są kosztami uzyskania przychodów zaliczanymi w momencie ich poniesienia.

Świadczenie przez gminę odpłatnych usług dostarczania wody i odbioru ścieków na rzecz odbiorców zewnętrznych podlega opodatkowaniu VAT. JST nie ma obowiązku naliczania VAT od dostaw wewnętrznych, zaś przy obliczeniu proporcjonalnych odliczeń podatku VAT uzasadnione jest stosowanie pre-współczynnika metrażowego bazującego na rzeczywistym wykorzystaniu infrastruktury wod-kan.

Gmina nie ma prawa do odliczenia VAT związanego z realizacją projektu infrastrukturalnego, gdyż projekt nie stanowi działalności opodatkowanej, co wyklucza możliwość skorzystania z prawa do obniżenia podatku należnego.

Zwolnienie podatkowe z tytułu nowej inwestycji w ramach wsparcia Specjalnej Strefy Ekonomicznej przysługuje wspólnikowi po uzyskaniu dochodów z tej inwestycji przy faktycznym poniesieniu kosztów, przy zachowaniu zasady kasowej dotyczącej wydatków kwalifikowanych.

Nieuzyskanie dochodu w ramach inwestycji określonej w decyzji o wsparciu, skutkujące niekorzystaniem ze zwolnienia na mocy art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o p.d.o.p., umożliwia zastosowanie wyłączenia z obowiązku sporządzania lokalnej dokumentacji cen transferowych zgodnie z art. 11n pkt 1 ustawy o p.d.o.p.

Operacja podziału przez wydzielenie zespołu składników stanowiących zorganizowaną część przedsiębiorstwa na rzecz spółki przejmującej jest wyłączona z opodatkowania VAT zgodnie z art. 6 pkt 1 ustawy o VAT, gdyż przenoszone składniki są wyodrębnione funkcjonalnie, finansowo i organizacyjnie, oraz zdolne do realizacji samodzielnej działalności gospodarczej.

Wpłaty mieszkańców na budowę przydomowych oczyszczalni nie podlegają VAT, zaś gmina nie ma prawa do odliczenia VAT od tej inwestycji, ponieważ działania te nie są wykonywane w ramach działalności gospodarczej w rozumieniu ustawy o VAT.

Dzierżawa infrastruktury przez Związek stanowi odpłatne świadczenie usług opodatkowane VAT; Związkowi przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego od inwestycji, częściowo po rejestracji wstecznej, lecz nie od wydatków związanych z dojściami ogólnodostępnymi, nieprzeznaczonych do dzierżawy komercyjnej.

Brak podstaw prawnych do zastosowania prewspółczynnika czasowego przez gminę dla inwestycji używanej zarówno w celach edukacyjnych jak i komercyjnych. Preferowane jest stosowanie wzoru obrotowego określonego w Rozporządzeniu Ministra Finansów, zapewniającego pełniejsze i obiektywne odzwierciedlenie zakresu działalności gospodarczej.

Koszty finansowania dłużnego związane z realizacją długoterminowego projektu infrastrukturalnego, jakim jest budowa farmy wiatrowej, oraz wszelkie koszty refinansowania tej inwestycji, nie powinny być uwzględniane przy wyliczaniu nadwyżki zgodnie z art. 15c ust. 8 Ustawy o CIT, z uwagi na ich rolę w długoterminowym interesie publicznym.

Gmina, realizując inwestycję polegającą na budowie ogólnodostępnego placu zabaw, nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego VAT, gdyż wydatki te nie są związane z czynnościami opodatkowanymi w rozumieniu ustawy o VAT.

Podatnik uzyskuje prawo do korzystania ze zwolnienia podatkowego na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT od miesiąca, w którym zrealizowana inwestycja zacznie generować przychód, niezależnie od wcześniejszego ponoszenia kosztów kwalifikowanych.

Gmina, działając w ramach realizacji zadań własnych, nie ma prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego, gdyż nie działa jako podatnik VAT w rozumieniu ustawy o VAT. Nabywane towary i usługi w ramach projektu nie są wykorzystywane do wykonywania czynności opodatkowanych, lecz służą celom publicznym.

Przychody z działalności sklasyfikowanej jako PKWiU 70.22.20.0 "Pozostałe usługi zarządzania projektami, z wyłączeniem projektów budowlanych" mogą być opodatkowane ryczałtem od przychodów ewidencjonowanych ze stawką 8,5%, przy spełnieniu ustawowych przesłanek.