Podatnik, który skorygował omyłkowo wystawioną fakturę ustrukturyzowaną „do zera” oraz wystawił nową fakturę na rzecz właściwego nabywcy, jest zobowiązany do wykazania obu dokumentów w tym samym okresie rozliczeniowym dla celów VAT, co pierwotna faktura, gdyż ich wpływ na podstawę opodatkowania oraz wysokość podatku należnego jest neutralny.

Archiwizowanie dokumentów księgowych, w tym faktur, wyłącznie w formie elektronicznej jest dozwolone pod warunkiem zapewnienia autentyczności, integralności i czytelności. Uprawnienie do odliczenia VAT jest ograniczone do elektronicznie przechowywanych faktur, które spełniają wymogi ustawy i nie obejmuje innych dokumentów nieuznawanych za faktury zgodnie z ustawą o VAT.

Przechowywanie dokumentów księgowych w formie elektronicznej, z zachowaniem zasad integralności, autentyczności i czytelności, jest dopuszczalne bez papierowych kopii. Prawo do odliczenia VAT uzależnione jest od spełnienia warunków zarówno przez dokumenty, jak i przez transakcje, których dotyczą.

Czynności biegłego sądowego z zakresu wyceny nieruchomości i ruchomości, mimo opodatkowania VAT, mogą korzystać ze zwolnienia na podstawie art. 113 ust. 1 ustawy o VAT, jeżeli roczny obrót nie przekracza ustalonego limitu, a wystawiane faktury muszą być ustrukturyzowane w systemie KSeF.

Biet kolejowy wystawiany w formie pliku PDF, zawierający numer NIP sprzedawcy i spełniający wymogi określone w §3 pkt 4 rozporządzenia dot. faktur, stanowi fakturę VAT w rozumieniu art. 106b ustawy o VAT, co zwalnia podatnika z obowiązku wystawiania dodatkowej faktury.

Odliczenie VAT naliczonego z faktur wystawionych poza KSeF jest możliwe, jeżeli spełnione są określone przesłanki, a brak użycia KSeF nie wpływa na możliwość odliczenia, co nie jest przesłanką negatywną w rozumieniu art. 88 ustawy o VAT.

Faktura wystawiona poza KSeF może stanowić podstawę do zaliczenia wydatku do kosztów uzyskania przychodów, jeśli merytorycznie spełnia wymogi ustawy o CIT, co jest zgodne z zasadą otwartego katalogu dowodów.