Transakcja sprzedaży nieruchomości, pomimo kwalifikacji do opodatkowania VAT i efektywnego wyboru opodatkowania, zgodnie z art. 2 pkt 4 lit. a) ustawy o PCC, nie będzie podlegać opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych.
Planowana sprzedaż nieruchomości nie podlega opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych, gdyż strony efektywnie zrezygnują z jego zwolnienia VAT, zgodnie z art. 43 ust. 10 w zw. z art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT.
Ustalenie czy odpisy amortyzacyjne od WNiP będą podlegały ograniczeniu w zakresie ich uznania za koszt uzyskania przychodu zgodnie z art. 15e ust. 1 ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych (Dz. U. z 2017 r. poz. 2343 z późn. zm., dalej updop), mając na uwadze, że Zbywca WNiP nie jest podmiotem powiązanym z Wnioskodawcą w czasie dokonywania odpisów amortyzacyjnych.