Dofinansowanie wynagrodzeń pracowników ze środków FGŚP stanowi przychód podatkowy. Jednakże, kiedy związane jest z działalnością na terenie specjalnej strefy ekonomicznej, może to być przychód zwolniony z opodatkowania na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, gdyż jest związany z działalnością prowadzoną w ramach strefy.

Prawo do zwolnienia z podatku dochodowego od osób prawnych z tytułu dochodów uzyskanych z działalności na terenie specjalnej strefy ekonomicznej, prowadzonej na podstawie ważnego zezwolenia, nie zależy od terminu złożenia deklaracji podatkowej, lecz od faktycznego uzyskania dochodu w trakcie okresu funkcjonowania strefy.

Zwolnienie z CIT dochodów uzyskanych w specjalnej strefie ekonomicznej obowiązuje do daty zakończenia funkcjonowania strefy, niezależnie od późniejszej daty złożenia deklaracji podatkowej.

Prawo do zwolnienia z opodatkowania dochodu uzyskanego z działalności gospodarczej prowadzonej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej, przyznane na mocy ważnego zezwolenia, zależy od momentu uzyskania dochodu, a nie od terminu złożenia deklaracji podatkowej.

Dochód uzyskany z działalności prowadzonej do 31 grudnia 2026 r. na terenie SSE, zwolniony podatkowo na mocy art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, pozostaje takim niezależnie od terminu złożenia deklaracji podatkowej po tym okresie.

Przychód ze zwrotu kosztów związanych z wadliwymi wyrobami nie korzysta z podatkowego zwolnienia strefowego, a refundacja wydatków na świadczenia gwarancyjne stanowi przychód podlegający opodatkowaniu, zgodnie z art. 12 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.

Pomoc publiczna w formie zwolnień podatkowych wynikających z zezwoleń strefowych oraz z decyzji o wsparciu powinna być rozliczana odrębnie dla każdego dokumentu, a nie chronologicznie według ich dat wydania. Dochody z działalności prowadzonej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej i na podstawie decyzji o wsparciu nie podlegają łączeniu.

Dochód uzyskany przez przedsiębiorcę z działalności na terenie SSE do dnia jej wygaśnięcia 31 grudnia 2026 r., nawet jeśli wykazany w deklaracji podatkowej złożonej po tej dacie, podlega zwolnieniu podatkowemu na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 Ustawy CIT, zgodnie z zasadami ochrony praw nabytych.

Odszkodowanie otrzymane w związku z uszkodzeniem i utraconymi korzyściami na terenie SSE nie stanowi przychodu zwolnionego z podatku zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, gdyż nie bezpośrednio wynika z działalności objętej zezwoleniem strefowym, lecz z pokrywania szkód przez ubezpieczyciela.

Działalność Spółki w zakresie projektów badawczo-rozwojowych kwalifikuje się jako działalność badawczo-rozwojowa w rozumieniu art. 4a pkt 26 ustawy o CIT, co uprawnia Spółkę do korzystania z ulgi B+R poprzez odliczenie kosztów wynagrodzeń w proporcji przypisanej do działalności B+R od podstawy opodatkowania.

Podatnik, niewykończający limitu pomocy publicznej na działalność w SSE, nie może skutecznie wybrać opodatkowania estońskim CIT. Dodanie przesłanek formalnych warunkuje nieskuteczność uprzednio złożonego zawiadomienia o wyborze ryczałtu, umożliwiając ponowną deklarację przy spełnieniu ustawowych warunków.

Stwierdzenie wygaśnięcia zezwolenia na działalność w SSE zgodnie z art. 19 ust. 5 pkt 3 UoSSE, nie obliguje do zwrotu pomocy publicznej. Po wygaśnięciu zezwolenia, spółka, spełniając wymogi, może wybrać opodatkowanie ryczałtem od dochodów spółek (tzw. „CIT estoński”) w bieżącym roku podatkowym.

Wynagrodzenie otrzymane za zobowiązanie się do wyłącznego zakupu komponentów od kontrahenta nie stanowi przychodu zwolnionego z opodatkowania na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, jako że nie jest bezpośrednim następstwem działalności gospodarczej prowadzonej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej zgodnie z zezwoleniem.

Usługi wsparcia sprzedaży nabywane od podmiotów powiązanych od 1 stycznia 2019 r. podlegają limitowaniu w zaliczaniu do kosztów uzyskania przychodów na mocy art. 15e ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych jako usługi podobne do doradczych. Ograniczenia nie obejmują kosztów uwzględnianych w działaniach strefowych wolnych od podatku.

Dochody uzyskane przez spółkę z działalności w Specjalnej Strefie Ekonomicznej do 31 grudnia 2026 r. korzystają ze zwolnienia podatkowego na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o CIT, niezależnie od złożenia deklaracji podatkowej w 2027 r.

Dochodów uzyskanych z nowej inwestycji realizowanej na terenie określonym decyzją o wsparciu, do momentu jej zakończenia, nie obejmuje zwolnienie od CIT przewidziane w art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT; stanowią one przychody z działalności opodatkowanej wraz z kosztami, które mogą być rozliczane na zasadach ogólnych.

Przychody i koszty uzyskania związane ze sprzedażą oprzyrządowania, służącego produkcji wyrobów zwolnionych, stanowią element kalkulacyjny zwolnionej działalności gospodarczej na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 i 34a ustawy o CIT, o ile działalność ta jest bezpośrednio powiązana z działalnością prowadzoną na terenie strefy w oparciu o uzyskane zezwolenia/ decyzje.

Ograniczenia z art. 15c i 15e ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych nie dotyczą kosztów działalności zwolnionej z opodatkowania, a w przypadku kosztów związanych zarówno z działalnością opodatkowaną, jak i zwolnioną, ograniczenia stosuje się tylko do kosztów przypisanych do działalności opodatkowanej.

Zmiana statusu przedsiębiorstwa z małego na średniego w trakcie realizacji inwestycji w SSE nie wpływa na wysokość przysługującej pomocy publicznej ustalonej na dzień wydania zezwolenia strefowego, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy CIT. Intensywność pomocy pozostaje niezmienna przez cały okres realizacji inwestycji.

Korekty rentowności dokonywane w ramach transakcji kontrolowanych, które związane są bezpośrednio z działalnością gospodarczą określoną w decyzji o wsparciu, mogą być uznane za wpływające na wartość dochodu zwolnionego z podatku dochodowego od osób prawnych na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy CIT.

Zwolnienie z PDOP z tytułu kosztów kwalifikowanych nowej inwestycji przysługuje od momentu uzyskania dochodu z działalności prowadzonej na jej podstawie, przy czym moment poniesienia wydatków kwalifikujących określa się zgodnie z metodą kasową, co oznacza faktyczną zapłatę kosztów. Zaliczki uwzględnia się jako koszty kwalifikowane dopiero po pełnej zapłacie należności.

Koszt nabycia kontenerów poniesiony przez spółkę komandytową w 2020 r. kwalifikuje się do objęcia wsparciem jako koszt kwalifikowany w rozumieniu § 8 ust. 1 Rozporządzenia WNI, co stanowi podstawę do korzystania z zwolnienia podatkowego, zgodnie z przepisami obowiązującymi przed uzyskaniem przez spółkę statusu podatnika CIT, tj. do 30 kwietnia 2021 r.

Odszkodowanie otrzymane przez przedsiębiorcę prowadzącego działalność w specjalnej strefie ekonomicznej, związane z indywidualną polisą ubezpieczeniową, nie korzysta ze zwolnienia z podatku dochodowego, gdyż nie jest bezpośrednim dochodem z działalności gospodarczej określonej w zezwoleniu strefowym.

Dla celów kalkulacji wskaźnika rentowności, określonego w art. 24ca ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT, należy uwzględniać całkowity dochód Spółki, obejmujący zarówno dochód opodatkowany, jak i dochód zwolniony, zgodnie z art. 7 ust. 1 ustawy o CIT.