Sprzedaż nieruchomości, zwolniona w części z VAT, podlega opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych w liczbie, w której podatek od towarów i usług nie znajduje zastosowania, z wyłączeniem części obejmujących rzeczy ruchome niezwiązane trwale z gruntem.
Całość dochodu uzyskanego ze sprzedaży prawa wieczystego użytkowania i budynku magazynowo-warsztatowego przez wspólników spółki jawnej podlega podatkowi dochodowemu od osób fizycznych jako dochód z pozarolniczej działalności gospodarczej, stosownie do udziałów wspólników zgodnie z art. 14 ust. 2 pkt 1 lit. a ustawy o PIT.
Sprzedaż prawa własności nieruchomości gruntowej na rzecz dotychczasowego użytkownika wieczystego, którego prawo zostało ustanowione przed 1 maja 2004 r., nie stanowi dostawy towarów podlegającej opodatkowaniu VAT według przepisów ustawy o podatku od towarów i usług, gdyż jest to jedynie przekształcenie tytułu prawnego nie wpływające na rzeczywiste władztwo nad rzeczą.
Otrzymane odszkodowanie za wywłaszczenie działki użytkowanej wieczyście stanowi odpłatną dostawę towarów w rozumieniu art. 5 ust. 1 i art. 7 ust. 1 ustawy o VAT, podlegającą opodatkowaniu VAT, która nie jest objęta zwolnieniem na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 9 i 2 ustawy, z uwagi na jej przeznaczenie pod zabudowę.
Wynagrodzenie za budynek usługowo-handlowy, przyznane w wyniku wygaśnięcia prawa użytkowania wieczystego, stanowi przychód z działalności gospodarczej podlegający opodatkowaniu, a nie odszkodowanie zwolnione z opodatkowania. Niezamortyzowana wartość początkowa budynku może być kosztami uzyskania przychodów, lecz nie wartość prawa użytkowania wieczystego gruntu.
Nabycie prawa użytkowania wieczystego z mocy decyzji administracyjnej Wojewody, dotyczące nieruchomości Skarbu Państwa, nie stanowi dostawy towarów opodatkowanej podatkiem VAT zgodnie z art. 7 ust. 1 ustawy o VAT, jako że nie zachodzi tu stosunek cywilnoprawny wymagający odpłatności.
Transakcja sprzedaży nieruchomości, z uwagi na jej opodatkowanie podatkiem VAT, zostaje wyłączona spod opodatkowania podatkiem od czynności cywilnoprawnych na podstawie art. 2 pkt 4 lit. a ustawy o PCC.
Transakcja zbycia nieruchomości, jako opodatkowana podatkiem od towarów i usług, nie będzie podlegała opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych na podstawie art. 2 pkt 4 lit. a) ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych, pod warunkiem rezygnacji z przysługującego zwolnienia z VAT.
Sprzedaż nieruchomości w ramach transakcji nie podlega opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych, jeżeli transakcja zostanie opodatkowana podatkiem od towarów i usług poprzez rezygnację ze zwolnienia, zgodnie z art. 2 pkt 4 ustawy o PCC.
Umowa sprzedaży nieruchomości w zakresie naniesień, będących własnością podmiotu trzeciego i związanych z działką będącą własnością zbywcy, podlega podatkowi od czynności cywilnoprawnych. Pozostała część transakcji nie podlega opodatkowaniu tym podatkiem, jeżeli zostanie opodatkowana VAT-em po rezygnacji ze zwolnienia.
Przychód uzyskany z dobrowolnego zbycia prawa użytkowania wieczystego na rzecz jednostki samorządowej, przeznaczonego na realizację celu publicznego uzasadniającego wywłaszczenie, jest zwolniony z podatku dochodowego od osób fizycznych, jeżeli nabycie nie nastąpiło w okresie 2 lat przed zbyciem, zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 29 ustawy o PIT.
Przychód ze sprzedaży nieruchomości będącej w małżeńskiej współwłasności, wykorzystywanej w działalności gospodarczej przez jednego z małżonków, jest w całości przypisywany jako przychód z tej działalności, bez względu na wspólność majątkową.
W przypadku wygaśnięcia prawa użytkowania wieczystego w związku z decyzją o wywłaszczeniu na potrzeby drogi, całość odszkodowania stanowi wynagrodzenie za dostawę towaru i podlega opodatkowaniu VAT jako czynność odpłatna na podstawie art. 5 ust. 1 pkt 1 i art. 7 ust. 1 ustawy o VAT.
Odszkodowanie wypłacone za niemożność samodzielnego funkcjonowania budynku po częściowej jego rozbiórce wskutek inwestycji drogowej, nie jest świadczeniem podlegającym opodatkowaniu VAT, gdyż brak jest przesłanek do uznania go za odpłatną dostawę towarów lub świadczenie usług.
Sprzedaż nieruchomości wraz z przenoszonymi prawami nie jest zbyciem przedsiębiorstwa lub jego zorganizowanej części, podlega opodatkowaniu VAT jako dostawa odrębnych składników majątkowych, z możliwością zrezygnowania ze zwolnienia dla opodatkowania części transakcji.
Przekazanie prawa użytkowania wieczystego nieruchomości oraz własności budynków wspólnikowi w zamian za obniżenie udziału kapitałowego stanowi odpłatną dostawę towarów podlegającą VAT, jednak korzysta ze zwolnienia z podatku, gdyż spełnia warunki określone w art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT, a ponadto nie rodzi obowiązku korekty podatku VAT naliczonego.
Umowy sprzedaży nieruchomości oraz udziału w prawie użytkowania wieczystego, opodatkowane efektywnie podatkiem od towarów i usług, nie podlegają jednocześnie opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych zgodnie z art. 2 pkt 4 lit. a) ustawy o PCC.
Odpłatne zbycie działki wydzielonej z nieruchomości wykorzystywanej w działalności gospodarczej, która jest ujęta w ewidencji środków trwałych, stanowi przychód z działalności gospodarczej, nie zaś sprzedaż majątku prywatnego, niezależnie od terminu pięciu lat od uzyskania prawa własności. Skutkuje to opodatkowaniem zgodnie z zasadami działalności gospodarczej, zgodnie z art. 14 ust. 2 pkt 1 ustawy
Sprzedaż nieruchomości przez spadkobiercę nie podlega opodatkowaniu, jeśli od końca roku kalendarzowego, w którym spadkodawca nabył nieruchomość, upłynęło co najmniej pięć lat; przekształcenie prawa użytkowania wieczystego oraz rozszerzenie wspólności majątkowej małżeńskiej nie wpływa na bieg tego okresu.
Sprzedaż niezabudowanej nieruchomości przez osoby fizyczne działające w ramach zarządu majątkiem prywatnym, bez przejawów działalności gospodarczej, nie podlega opodatkowaniu VAT, zgodnie z art. 15 ust. 1 ustawy o VAT.
Sprzedaż udziałów w prawach użytkowania wieczystego, budynku oraz lokalu nie podlega opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych, gdy transakcja jest objęta podatkiem od towarów i usług oraz strony rezygnują z przysługującego zwolnienia z VAT (art. 2 pkt 4 lit. a) ustawy o PCC).
Nabycie z mocy prawa prawa użytkowania wieczystego na podstawie decyzji Wojewody, ustalonej na mocy ustawy o inwestycjach w zakresie terminalu, nie stanowi czynności podlegającej opodatkowaniu podatkiem VAT, jako że nie spełnia przesłanek odpłatnej dostawy towarów z art. 7 ustawy o VAT.
Sprzedaż nieruchomości w drodze licytacji publicznej, w przypadku której od pierwszego zasiedlenia minęło ponad dwa lata, korzysta ze zwolnienia od podatku VAT zgodnie z art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT, a prawo użytkowania wieczystego również dzieli ten byt podatkowy.
Sprzedaż nieruchomości opodatkowana VAT, po rezygnacji ze zwolnienia, nie podlega opodatkowaniu podatkiem PCC (art. 2 pkt 4 lit. a) ustawy o PCC).