Połączenie spółki komandytowej przez przejęcie przez spółkę kapitałową nie skutkuje powstaniem przychodu podatkowego, gdy zachowane zostaną przyczyny ekonomiczne uzasadniające transakcję oraz odpowiednie wartości majątkowe w księgach rachunkowych, neutralizując skutki konfuzji, z wyłączeniem art. 12 ustawy o CIT.

Spółka komandytowa wypłacająca komplementariuszowi zaliczki na poczet zysku nie jest zobowiązana do pobierania zaliczek na podatek dochodowy w trakcie roku. Obowiązek poboru podatku powstaje po zakończeniu roku podatkowego, gdy znana jest wysokość podatku CIT spółki, od której zależy wysokość podatku PIT komplementariusza. Dopiero wtedy następuje przekształcenie obowiązku w zobowiązanie podatkowe.

Zyski wypracowane przez spółkę komandytową przed wyborem estońskiego CIT, prawidłowo wyodrębnione i opodatkowane za wcześniejszy okres, nie podlegają ponownemu opodatkowaniu ryczałtem przy ich wypłacie wspólnikom.

Koszty nabycia udziałów z tytułu zbycia muszą odwoływać się do pierwotnych wydatków związanych z ich uzyskaniem, zgodnie z art. 23 ust. 1 pkt 38 ustawy PIT, a wartość bilansowa z dnia przekształcenia nie stanowi podstawy dla kalkulacji tego kosztu.

Wypłata zaliczek na poczet udziału w zysku przez spółkę komandytową skutkuje obowiązkiem poboru zryczałtowanego podatku dochodowego przez spółkę jako płatnika, zgodnie z art. 41 ust. 4e w związku z art. 30a ust. 1 pkt 4 ustawy o PIT, pomimo późniejszej możliwości pomniejszenia kwoty podatku.

Przekształcenie spółki komandytowej, której wspólnikami są wyłącznie osoby fizyczne, w spółkę jawną nie generuje dochodu do opodatkowania CIT po stronie przekształcanej spółki; powstała z przekształcenia spółka jawna zachowuje status podmiotu podatkowo transparentnego (art. 93a Ordynacji podatkowej).

Częściowe wycofanie wkładu przez wspólnika ze spółki komandytowej, po uzyskaniu przez nią statusu podatnika CIT, skutkuje powstaniem przychodu z kapitałów pieniężnych, podlegającego opodatkowaniu 19% stawką. Nie stanowi ono przychodu z pozarolniczej działalności gospodarczej.

Pożyczki udzielane spółce komandytowej przez jej wspólnika są na gruncie ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych traktowane jako zmiana umowy spółki i opodatkowane bez względu na powiązania z podatkiem VAT, z obowiązkiem składania deklaracji PCC-3 i wpłaty podatku.

Koszt uzyskania przychodu ze zbycia praw w spółce komandytowej może być pomniejszony jedynie o wartości udziałów nabytych odpłatnie, a nie o udziały nabyte w drodze darowizny. Wartość bilansowa spółki przekształconej pomniejsza przychód tylko w części odpowiadającej wydatkom rzeczywiście poniesionym.

Koszty uzyskania przychodów w przypadku przeniesienia udziałów nie mogą być uznane na podstawie art. 16 ust. 1 pkt 8d Ustawy o CIT w sytuacji, gdy nie dochodzi do wymiany udziałów zgodnej z art. 12 ust. 4d Ustawy o CIT z uwagi na brak wymogów ustawowych, takich jak status podatnika podatku dochodowego dla spółki uczestniczącej w transakcji.

W przypadku braku statusu podatnika podatku dochodowego od osób prawnych przez Spółkę w momencie transakcji, koszty uzyskania przychodów w ramach umowy datio in solutum nie mogą być ustalone na podstawie art. 16 ust. 1 pkt 8d CIT. Nie stanowi to wymiany udziałów, o której mowa w art. 12 ust. 4d CIT.

Koszt uzyskania przychodu z tytułu zbycia udziałów w spółce z ograniczoną odpowiedzialnością, powstałej z przekształcenia spółki komandytowej, odpowiada wartości majątku spółki komandytowej na dzień przekształcenia, przypadającej na objęte udziały, oraz kwocie wniesionego wkładu pieniężnego do spółki przekształconej.

Transakcja wniesienia wkładu niepieniężnego przez spółkę komandytową do spółki z o.o. w warunkach braku statusu podatnika CIT nie stanowi wymiany udziałów w rozumieniu art. 12 ust. 4d ustawy CIT, skutkując niemożliwością rozpoznania kosztów na podstawie art. 16 ust. 1 pkt 8d ustawy CIT.

Spółka komandytowa, będąc podatkowo transparentną w momencie transakcji, nie spełniała warunków uznania transakcji za wymianę udziałów w rozumieniu art. 12 ust. 4d ustawy o CIT. W konsekwencji, koszty uzyskania przychodów przy przeniesieniu udziałów w datio in solutum nie mogą uwzględniać wartości poniesionej na objęcie udziałów w ramach wcześniejszej „wymiany”. Koszty należy ustalić na ogólnych zasadach

Momentem powstania przychodu z tytułu wystąpienia wspólnika ze spółki komandytowej jest dzień faktycznego otrzymania środków pieniężnych, a nie moment formalnych decyzji ani zawarcia porozumienia o rozliczeniu, zgodnie z zasadą kasową określoną w ustawie o CIT.

Zyski wypracowane przez spółkę komandytową przed jej przekształceniem w spółkę z o.o., wypłacane później wspólnikom, pozostają neutralne podatkowo, a spółka z o.o. nie pełni funkcji płatnika podatku dochodowego od osób fizycznych.

Przekształcenie spółki komandytowej w spółkę akcyjną, bez generowania nowych przychodów lub świadczeń, nie powoduje powstania przychodu podatkowego dla podmiotu przekształcającego, pod warunkiem zachowania tożsamej wartości kapitałów przed i po przekształceniu.

Kosztem nabycia lub objęcia udziałów spółki komandytowej, powstałej z przekształcenia spółki z o.o., jest wartość wynikająca z bilansu zamknięcia spółki przekształcającej, a nie historyczna wartość poniesionych wydatków.

Koszt nabycia lub objęcia udziałów w spółce komandytowej, powstałej z przekształcenia spółki z o.o., w rozumieniu art. 21 ust. 1 pkt 50a ustawy o PIT, odpowiada wartości bilansu zamknięcia spółki przekształcanej, a nie wartościom pierwotnie poniesionych wydatków na nabycie udziałów tej spółki.

Obniżenie wkładów wspólników w spółce komandytowej powoduje przychód z kapitałów pieniężnych podlegający opodatkowaniu, jeśli przekracza koszty uzyskania przychodu. Kompensata wkładów ze zobowiązaniem do wypłaty zysku nie generuje przychodu podatkowego.

Działania Wnioskodawcy, zrealizowane w ramach projektów badawczo-rozwojowych, stanowią działalność B+R w rozumieniu art. 5a pkt 38-40 ustawy o PIT. Skorzystanie z ulgi B+R jest możliwe dla kosztów pracowniczych, materiałów i surowców oraz odpisów amortyzacyjnych związanych z taką działalnością, nawet gdy prace prowadzone są w warunkach zbliżonych do przemysłowych.

Kosztem uzyskania przychodu z tytułu sprzedaży udziałów w spółce przekształconej z komandytowej na z o.o., jest wartość majątku spółki komandytowej, proporcjonalna do udziału, ustalona na potrzeby przekształcenia.

Spółka komandytowa, wypłacając zaliczki na poczet zysku komplementariuszom w trakcie roku podatkowego, nie ma statusu płatnika w zakresie pobierania zryczałtowanego podatku dochodowego, gdyż brak jest możliwości obliczenia podatku zgodnie z ustawowym mechanizmem zanim znane będą wszystkie niezbędne dane na zakończenie roku podatkowego.